Viruses: 26737393
Help
Entry
26737393 CDS
T40000
Symbol
PHICD211_20103
Name
(RefSeq) Clostridium phage phiCD211; transposase
Virus
1582152
Clostridium phage phiCD211
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
HTH_OrfB_IS605
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
26737393
NCBI-ProteinID:
YP_009221705
RS:
NC_029048
LinkDB
All DBs
Position
NC_029048:complement(94039..95478)
Genome browser
AA seq
479 aa
AA seq
DB search
MSNYILTLQLKTEKFQEDIICNAFDKYRKVYNSCLSELFKRYNHMIESKEHQANCKYKGK
DRNKIFSEINKKYNLTEYSLHKFVKFIGKYYKLHSAITQKIATRCFNAFNKYIYHQAKRV
NYIRYNELTSIEGKQNSTGISYKDGIIKFNKMTIPVIIKNNDNYAQRAIQDKIKYCRILK
KEIKGKIKWYVQLVLEGIPPKKTTNQGKIKGQIGLGNVGIDIGTQTIAISSKCDVKLLEL
APNVNNIDRQIKLIQRKMDRSKRATNLNKFNDNGTIKQGNRDKWIFSNHYLKLKRLRKEL
YRKQAEIRKQDHYILINKLLNLGNKFYVETMSYKRLQTRVKDTTINEKTGRINKKKRFGK
SLANKAPSMFLTMLDNKLKYNNERLYKIDTAKCRASQYNHFSDEYNKKELKDRWNNGMDI
QRDCYSAFLIMNVNEDLKSINRELCVKTYDNFKILHDKEINRLKKLKLNGYKLISSMGI
NT seq
1440 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcaaattatatattaacattgcaattaaaaacagaaaagtttcaagaagacattata
tgtaatgcttttgataagtatagaaaagtatataattcatgtttatcagagctatttaaa
agatataaccacatgatagaatctaaagaacaccaagcaaattgtaaatataagggtaaa
gatagaaataaaatatttagtgaaattaataagaagtataatttaacagagtattcactt
cataagtttgttaaatttattggtaaatattataaactacattctgctataactcagaag
atagctacaagatgttttaatgcttttaataagtatatctatcatcaagctaaacgagtt
aattatattagatataatgaattaacatcaatagaagggaaacaaaattcaactggtatt
agttataaagatggtattattaaatttaataagatgactattccagtaataataaagaat
aatgacaattatgctcaaagagcgatacaagataaaataaaatattgtagaatacttaaa
aaagaaattaagggtaaaattaaatggtatgtacaattagtcttagaaggaattccacct
aaaaaaacaaccaatcaaggaaaaataaaaggacaaattggtttaggtaatgtaggtata
gatattggaactcaaactatagctatatctagtaaatgtgatgttaagttattggagtta
gctcctaatgttaataatatagataggcaaataaagttaattcaacgtaaaatggataga
agtaaacgtgcaactaatcttaataaattcaatgataatggtactataaaacaaggaaat
agagataagtggatatttagtaatcactatcttaaattaaaaagactaagaaaagagtta
tatagaaaacaagctgaaataagaaaacaagaccactatatattaattaacaaattacta
aatttaggcaataagttttatgttgaaacgatgagttataaaagacttcaaactagagtc
aaggatactactattaatgaaaaaactggtagaattaataaaaagaaacgttttggaaaa
tcattagcaaataaagcaccatcaatgtttttgactatgttagacaataagttaaaatat
aataatgaaagattatataagatagatactgctaaatgtagagccagtcaatataatcac
ttttcagatgagtacaataagaaggaattaaaagatagatggaataatggtatggacatt
caaagagattgctattctgcatttttaataatgaatgttaatgaagatttaaaatcaatc
aacagagaattgtgtgttaaaacatatgataactttaaaatattacatgataaagagata
aatagattaaaaaaattaaaattaaatggttataaattaatatctagtatggggatataa
DBGET
integrated database retrieval system