Viruses: 26855125
Help
Entry
26855125 CDS
T40000
Symbol
AYR72_gp099
Name
(RefSeq) Cnaphalocrocis medinalis granulovirus; DNA_ligase
Virus
1750712
Cnaphalocrocis medinalis granulovirus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
DNA_ligase_A_M
RNA_ligase
DUF1514
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
26855125
NCBI-ProteinID:
YP_009230017
RS:
NC_029304
UniProt:
A0A109WZX5
LinkDB
All DBs
Position
NC_029304:88814..90565
Genome browser
AA seq
583 aa
AA seq
DB search
MYFKYFAKIYNDLLNMTTTNEINMYITQNVNPKHRKEVFLWLYIMFGFERKFKINDKHLL
TVFCKIQEPHIDRKNLQEAFKNFGVAQTCSTVVKFDPTKPITNIQMVTVYNFLLKLQNVP
SKNFYLLKLFKSIVELCDQTTLYCLIDFIRGSNKNKKLNAKRRNLYLFKQVFDRKTFDQL
DAYKQELQNSGLTILKMNDLLQPGKPIEPMLALPWKNVSKITFKEICAEIKYNGERVQLH
KFHDKITCYKRNLNVHTKCTNVLLNVIQRVLRHVENVILDCEFVGNSVDTYGLIVFDVLY
YNNKNYLNVKLKNRKQILEYIMYNKEPCMTQIYYELFDNVHTLKSWVHQILNIHQHHQVD
INNNNNNEDKENNNIINEIEGVVIKNWNENYEPKRKKWLKIKKSYFNNVCTADLVVVGGW
KKNKGNITIYLVATPFFDHDNCKTMFLPVSKVKYSKNNYEHLMTPYTGSASCDWLVVDKR
MNKLRKIPNMVAIDPLKMPVWEMTGDFIRSSDSWTWGNITHNYVSIRLPRFIRVRDDKTY
QQANTFMDLVLLSSISNESFNYPDLYEFLLPKNCIKNYIPNKN
NT seq
1752 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtattttaaatattttgcaaaaatttataacgatttattaaacatgaccacaacaaac
gagataaacatgtacatcacacaaaacgtgaatcctaaacacagaaaagaagtgtttttg
tggttgtacatcatgtttggttttgagagaaaatttaaaattaatgacaaacacttgttg
acagtgttttgcaaaatacaagaaccgcacatagatcgtaaaaatttacaagaagcgttt
aagaattttggtgtggcacaaacgtgcagcactgtggtaaaattcgaccccaccaaacct
atcactaacatacaaatggtgactgtttacaattttctgctaaaactacaaaatgttccg
tcgaaaaatttttatttgttaaaactgttcaaatccattgtggagctatgcgatcaaacg
actttgtattgtttaattgattttatcagaggatctaacaaaaacaaaaaactcaatgcc
aagcgaagaaatttgtatttgttcaaacaagtatttgatcgcaaaacatttgatcagttg
gacgcttacaaacaagagctacaaaacagcgggctcacaatattgaaaatgaacgatttg
ttgcaaccgggcaaaccaatagaaccgatgttggcgttaccatggaagaatgtcagcaag
attacttttaaagagatatgtgccgaaataaagtacaacggtgagagagtgcaactacac
aaattccacgacaaaatcacgtgctataaacgtaacttaaacgtgcacacaaaatgtaca
aacgttttgttgaacgtcatacaaagagtgttgcgtcacgtggagaatgtgatattggat
tgcgagtttgtgggcaacagcgtcgacacatacggcttgatcgtgttcgatgtgctttat
tacaacaataaaaattatcttaatgtgaaattaaaaaatcgcaaacagatattggaatac
atcatgtacaacaaagaaccgtgcatgacacaaatatattacgaattgtttgacaacgtg
cacacattgaaaagttgggtacaccaaattttaaatatacaccaacatcatcaggttgac
attaacaacaacaacaacaacgaagacaaagaaaacaataatataataaatgaaattgaa
ggtgttgtgataaaaaattggaacgagaattatgagcctaaacgcaaaaagtggctcaaa
ataaaaaaaagctattttaataatgtgtgcacggcggatttggtggtggtgggcggttgg
aaaaagaacaaaggcaacattacaatatatttggtcgccacgccatttttcgatcacgac
aattgtaaaactatgtttttacccgtgtccaaagttaaatattcaaaaaataattatgaa
catttaatgacaccgtacaccggttcggcctcgtgcgactggttggtggtggacaaacgt
atgaacaaattacgcaaaatacccaacatggtggctatagatcctttgaaaatgcccgta
tgggagatgaccggtgattttatcagaagctcagattcgtggacatggggaaacataaca
cacaattatgtgtcgattagattgccacgattcattcgcgtgcgcgacgacaaaacgtac
caacaagccaacacgtttatggatctcgtgttgttgtcaagcattagtaatgaatctttt
aactatccagatttgtatgaatttcttttacctaaaaattgtattaaaaattatatacca
aataaaaactaa
DBGET
integrated database retrieval system