Viruses: 26969574
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Entry
26969574 CDS
T40000
Symbol
A0E98_s1gp1
Name
(RefSeq) Emaravirus tritici; RdRp
KO
K26641
Emaravirus RNA-directed RNA polymerase
Virus
1980428
Emaravirus tritici
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Bunya_RdRp
Muted
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
26969574
NCBI-ProteinID:
YP_009237277
RS:
NC_029570
UniProt:
A0A076V800
LinkDB
All DBs
Position
NC_029570:complement(95..6913)
Genome browser
AA seq
2272 aa
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DB search
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DBGET
integrated database retrieval system