KEGG   Viruses: 26969574
Entry
26969574          CDS       T40000                                 
Symbol
A0E98_s1gp1
Name
(RefSeq) Emaravirus tritici; RdRp
  KO
K26641  Emaravirus RNA-directed RNA polymerase
Virus
1980428  Emaravirus tritici
SSDB
Motif
Pfam: Bunya_RdRp Muted
Other DBs
NCBI-GeneID: 26969574
NCBI-ProteinID: YP_009237277
RS: NC_029570
UniProt: A0A076V800
LinkDB
Position
NC_029570:complement(95..6913)
AA seq 2272 aa
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DBGET integrated database retrieval system