Viruses: 27815326
Help
Entry
27815326 CDS
T40000
Symbol
UL48, A8B60_gp11
Name
(RefSeq) Canid alphaherpesvirus 1; transactivating tegument protein VP16
Virus
170325
Canid alphaherpesvirus 1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Alpha_TIF
GldB_lipo
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
27815326
NCBI-ProteinID:
YP_009252238
RS:
NC_030117
UniProt:
Q8B635
LinkDB
All DBs
Position
NC_030117:10588..11856
AA seq
422 aa
AA seq
DB search
MEFNIEDFDESLLGAVGYSNNFKGKQSLPIKASSPSSLIKNLLDELNFPEGPSLLSSMEK
WNEDLFSCIPRFLEIYIENSILSTSVDEVIKNLDNSLNYDDVIDFQVHGPETFPKTPLLE
EELENYVTSVQKYFLSELKAREVTYSFLLTKYCKALLLYLRYNTKSSIKGNKDINAFHQK
FKQNVRERYYREVANIARLLYLHLYLSVTREVSWKLHADQVLLQSVFVSLSYSWSHRRQF
ECIFHPILFNHGIVNLENNPLTFKELQKINYRRHILGLPLIRAGLVEEDNQPLMIPPEFS
SKLPRTIGFLTQQIRAKMEAYSDNHPVTPKFPRIEHSYAKPIDPINYGTTIEAMMDPPSP
SAILPGDPNPEINVKVKSTVSSFQIPPNITLEELESGEYNLFTDGVTYNDIPENELNKMF
QL
NT seq
1269 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatttaacatagaagactttgatgaatcgttgctaggggctgttggatactctaat
aattttaaaggtaagcaaagccttccgattaaggcttctagtccatcatcgttaattaaa
aatcttttagatgaattaaattttccggaaggtcctagtttattatcttctatggaaaaa
tggaatgaggatttattttcctgcatcccaagatttttggaaatctacattgaaaattct
attttatcaacatctgtcgatgaggttattaaaaatttggataattctttaaattatgat
gatgtaatcgattttcaggtccatggacctgaaacatttccaaaaaccccattattggaa
gaggaattggaaaattatgtaacatctgttcaaaagtattttttatctgaacttaaagct
agagaagttacatattcatttctactcactaaatattgtaaagcgcttttgttatatctt
cgctataatacaaaatcatcgattaagggtaataaggacataaatgcatttcaccaaaaa
tttaaacaaaatgtgcgggaacgttattatagagaggttgcaaatatagcacgattgtta
tatttacatctgtatttatcagtaactagggaagtgtcttggaaactacatgccgatcaa
gtattactccaaagtgtttttgtttcattgtcttattcttggagccaccgacgacagttt
gagtgtatatttcatccaattttatttaatcatggtattgtgaatttggaaaataaccct
ttgacatttaaggaactacaaaaaataaattatagacgtcatattcttggtttaccattg
attagagctggattggtagaagaagataatcaacctttaatgatacctccagagttttcc
agtaaactacctcgaacaataggatttttaactcaacaaattagagccaaaatggaagct
tattcagacaaccatcctgtaacaccaaaatttcctcgtattgaacattcatatgctaaa
cctatagatcctattaactatggaactacaatagaagctatgatggacccaccatcacca
agcgctattttaccaggagatccaaatcctgaaattaatgttaaggttaaaagcactgtt
tcatcctttcaaattccacctaatattaccttggaagaactggagtcaggtgaatataat
ttatttacagatggtgttacctacaatgatatacctgaaaatgagttaaataaaatgttt
caattataa
DBGET
integrated database retrieval system
