Viruses: 27815355
Help
Entry
27815355 CDS
T40000
Symbol
UL15, A8B60_gp42
Name
(RefSeq) Canid alphaherpesvirus 1; DNA packaging terminase subunit 1
Virus
170325
Canid alphaherpesvirus 1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
DNA_pack_C
DNA_pack_N
Terminase_6N
NAT10_TcmA_helicase
Flavi_DEAD
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
27815355
NCBI-ProteinID:
YP_009252269
RS:
NC_030117
UniProt:
A0A172DSC0
LinkDB
All DBs
Position
NC_030117:complement(join(70975..72141,75388..76416))
AA seq
731 aa
AA seq
DB search
MFGKILSDETEKYFESLKRDRQNYNKSNYDTETPVTNSNDDIRVPFLNFAISTPQRHQTM
IPAVGALHNCCESSPIFSSISRQLLFTGFTKKQPTNQDTYLNISPDVYLSTNITKTIKEI
IFLKYNNEITTSQKNSYYSVMNTFETLRSSDAFNQLISFIKNFNNLVQTSFKDIHIDDTN
QRPVKRSKVEVACYGKTHGTLELFQKMILMHATYFLAFIILGDHSDRITTFLKMVFNTPT
FSESIIKHFRQRATVFLVPRRHGKTWFLVPLIALVMATFKGIKVGYTAHIRKATEPVFEE
IGARLRQWFGTSRVEHVKGENISFSFDDGSKSTIVFASSHNTNGIRGQDFNLLFVDEANF
IRPEAIQTIIGFLNQTNCKIIFVSSTNTGKASTSFLYNLKGSSEELLNVVTYICDDHMQR
VVTHTNTTACSCYILNKPVFITMDSSMRNTAEMFLQDSFMQEIIGGCDSINSTPVKPIFT
KVACERFLLYRPSSVTNQSLLSPNLYMYIDPAFTTNSKASGTGIAIVGRYNANWIIFGLE
HFFLKALTGCSSEEIGKCATQCLAQIFALHNQPFGTINIAIEGNSSQDSAVAISQFIQRD
LDSLKDANVVPMPHTILFYHCIPPGSNIAYPFFLLQKQKTGAFDHFIKKFNSEMILASKD
MVSTTIQLQTDPVEYLYNQMKNLTESLSNVSETRVFTGKKGGTSDDMMVALVMAIYISSL
PQNDNSFAKLK
NT seq
2196 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttggtaaaatattaagtgatgaaacagaaaaatactttgaatcacttaagcgtgat
cgccaaaattataacaaatctaattatgataccgagacacccgtaactaattcaaatgat
gatataagagttccgtttttaaattttgctatttctacaccacaacgtcatcaaacgatg
attccggcagtaggagctcttcacaattgctgtgaaagctcaccaatattttcatcaata
tctcgccaactactatttacaggttttaccaaaaaacaaccaaccaatcaggatacatat
ttaaatatttcacctgatgtttatttatctacaaatattacaaaaactataaaggaaata
atatttttgaaatataataacgaaattacgacttcccagaaaaattcttattatagtgtt
atgaacacttttgaaacactgcgatcatctgatgcgtttaatcaattaatttcatttatt
aaaaattttaataatttagtacaaacctcatttaaagatatacatatagatgatacaaac
caaagacctgtaaaacgatctaaagtagaagtggcttgttatggaaaaactcacggaact
cttgaattgtttcaaaaaatgattttaatgcatgctacgtattttttagcatttataatt
ctgggtgatcattcggatcgtataactacatttttaaaaatggtgtttaacacaccaaca
ttttcagaatccattataaaacacttcagacagcgtgctacagtgtttttggttccaagg
aggcatggtaaaacatggtttttagtaccattaattgcattggtaatggctacatttaaa
ggcattaaagtagggtatactgcgcatatacgaaaggctacagaaccggtttttgaagaa
ataggtgcaagattacgtcaatggtttggtacttcaagagttgagcatgtaaaaggggaa
aacatttctttttcgttcgacgatggatctaaaagtactatagtttttgcatcaagccac
aacacaaatgggatccgaggacaagatttcaatcttctatttgttgacgaagcaaacttc
atacgaccagaagcaatacaaacgataattggatttttaaatcaaacaaactgtaaaatc
atctttgtctcatcaacaaacactggtaaagccagtacaagttttttatataatcttaaa
ggatcatcagaagaactattaaatgtagtaacctatatatgtgatgatcatatgcagcga
gtggttactcatactaacacaacagcttgttcttgttatatattaaataagccggttttt
ataactatggatagttctatgcgaaataccgctgagatgtttctacaagattcttttatg
caggaaattataggggggtgcgattctattaattcaaccccggtaaagcctattttcaca
aaagtagcatgtgaacggttcttgttatatagaccatcttcagttaccaaccaatcactt
ttatccccaaatttgtatatgtatatagatccggcatttactactaattctaaagcatct
ggaactggaattgctatagttggacgatataatgctaattggataatattcggtcttgaa
cacttttttttgaaagctttaacaggttgttcatctgaggaaattggaaaatgtgctaca
caatgtttagctcaaatttttgcgttacacaaccaaccatttggtacaattaatattgcg
attgaaggaaacagcagtcaagactctgctgtagcaatatctcaatttattcaaagggat
ttagatagtcttaaggatgcaaatgttgttcctatgccacatacaattttattttatcat
tgcatacccccgggaagcaacatagcatatcctttttttttattacaaaaacaaaaaacc
ggtgcttttgatcattttattaaaaaatttaactctgaaatgatattagcttcaaaggat
atggtttctacaaccatacaactacaaactgaccctgttgagtatctatataatcaaatg
aaaaacttaaccgaatctttgtctaatgtatccgaaactagagtttttacaggtaaaaag
ggtggaacatcggatgatatgatggttgctcttgtgatggctatttatataagtagttta
ccacaaaatgacaactcgtttgcaaaacttaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
