Viruses: 27815356
Help
Entry
27815356 CDS
T40000
Symbol
UL17, A8B60_gp43
Name
(RefSeq) Canid alphaherpesvirus 1; DNA packaging tegument protein UL17
KO
K26017
Herpesviridae capsid vertex component 1
Virus
170325
Canid alphaherpesvirus 1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Herpes_UL17
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
27815356
NCBI-ProteinID:
YP_009252270
RS:
NC_030117
UniProt:
A0A172DSM1
LinkDB
All DBs
Position
NC_030117:72202..74268
Genome browser
AA seq
688 aa
AA seq
DB search
MDAHIANETKFQLDYDRSKTNFIVHIIIPKKCLSEAGIDLSKFTKPKLNLSGVIENSVNL
SPPTFRVLTQTRFHASGKCTPWEPVFACYLNNGALYSILIPTNPTNHNQLFKGLPGVGGL
FVTLEIVCDTDGLFDAFTVVAIRVDMFGQVKNFEILFTYDELIPSGTRYGADAPRIANIC
KQFSDYVKCHKNITERAVTAGSHIEACMGDEKLFEDTQNISYGSILKPYEILYNGGFDNP
ETILRLEENDKEIMSLIRRASEVIANRNPVRSHNSTKRFEGRQVIASGLIQGAKGISFNN
RTSSNISIRGHSSSENTSCNFLGNHSIAYSNQNSMENLDDILIVSNEAKVPLTPLDWLDV
GHASLLNGDTISDIWRRRPISIVARKHYSTGETFIVVSYENSIGWGGKRFKKNTDLSLSK
IISSECVSEGVTNPRDLPDDIKNRLITEHPILTIPLGKNIPPMSAFDSAAEVELIEKFKD
VCNKALITSITESLRLHPRMSQLFEYELHEKQHECIIKIANQAPELLKALLASIEHIPSK
DFRNGSLMLNALSYLNYTTSGKNGYIPYNQSCFSGLVGGKSVFLFDYFSSGGAVIKVSDE
PIPILIKQNSNGQHRCSFVKGKFSTGNKTYERFLPGECYAYICVGFNNTLDGIIVFPGGF
AFKIYPSIFFDWPEKLKEAILSRFCWTI
NT seq
2067 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatgcgcatattgctaacgaaacaaaatttcagctcgattatgataggtctaaaaca
aattttattgttcatattataatccctaaaaaatgtttatctgaagctgggatcgactta
tcaaaatttacaaaaccaaaactaaatttaagtggtgttattgaaaatagtgtaaattta
tcaccacccacgtttagagttttaactcaaacaagatttcatgccagtggaaaatgtact
ccatgggaaccagtttttgcttgttatcttaataatggggctttatacagtatattaata
ccaactaatccaacaaatcataaccaactatttaagggtttgcctggtgttggtggtctt
tttgtaacattggaaatagtatgtgatacagatggcttatttgatgcatttactgttgtt
gctattagagtggatatgtttggacaagttaaaaattttgaaatactttttacttatgat
gagttaattccttcaggaactagatatggtgcagatgctcctagaattgcaaatatatgc
aaacaattttcagactatgttaaatgtcataaaaatattacagaaagggctgttactgcc
gggtctcatatagaagcatgcatgggagatgaaaagttgtttgaagatacacaaaatatt
tcatatggttctattttaaaaccatatgaaatattatataatgggggatttgataaccct
gaaactattttacgacttgaggaaaatgataaagaaattatgtctttgattcgccgagca
tcagaagtaattgcaaacagaaatcctgtaagaagtcataattcaacaaaacgatttgaa
ggaaggcaagttattgcctctgggttaatacaaggagcaaagggaatttcttttaataat
cgtaccagttcaaatatatccattagggggcattctagctctgaaaataccagttgcaat
tttttgggtaatcattcaattgcgtattcaaaccaaaattctatggaaaatttggatgat
attttaattgtttcaaatgaggctaaagtgcccttaacaccattagattggttagatgtg
ggacatgcatctttattaaacggggatacaatttcagatatctggagacgccggccaatt
tcaatagttgctagaaaacactattcaacaggggaaacgtttattgtggtttcatatgaa
aactctataggatggggtggtaagagatttaaaaaaaatactgatttatctttaagtaaa
ataatttcttctgaatgtgtatctgaaggagttactaatcccagagatttacctgatgat
ataaaaaaccgtttaattaccgaacatccaattttaactattccattaggtaaaaatatt
ccgcctatgtcagcatttgactcagcggctgaagttgagcttattgaaaaatttaaagat
gtatgtaataaagcgttgattacatctataaccgaaagtttaagacttcatccgcgtatg
tctcaactatttgaatatgaacttcacgaaaaacagcatgaatgtataataaaaatcgca
aatcaagcacctgagttgttaaaagctttgttagcttcaatagaacatataccatcaaag
gattttcgaaatggatcgttaatgttgaatgcgttaagttacctaaattatactacaagc
ggtaaaaatggatatattccatataatcaatcgtgtttttcgggtttagtgggtggtaaa
tcagtatttttgtttgattattttagttccgggggggcggttataaaggtttcagatgaa
ccaatcccaatacttataaagcagaattctaacggtcaacaccgatgtagttttgtaaaa
gggaaattttccactggaaataaaacatacgaacgcttccttccaggggaatgttatgct
tatatttgtgttggatttaataatacgttggatggtataattgtattccccggtggattt
gcttttaaaatttatccatcgattttttttgattggccagaaaaattaaaagaggctatt
ttaagtaggttttgttggacaatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
