Viruses: 29031019
Help
Entry
29031019 CDS
T40000
Symbol
SV40gp6
Name
(RefSeq) Betapolyomavirus macacae; large T antigen
Virus
1891767
Betapolyomavirus macacae
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Polyoma_lg_T_C
T_Ag_DNA_bind
PPV_E1_C
DnaJ
GTP_EFTU
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
29031019
NCBI-ProteinID:
NP_043127
RS:
NC_001669
UniProt:
P03070
Q9DH70
Structure
PDB
PDBj
LinkDB
All DBs
Position
NC_001669:complement(join(2691..4571,4918..5163))
Genome browser
AA seq
708 aa
AA seq
DB search
MDKVLNREESLQLMDLLGLERSAWGNIPLMRKAYLKKCKEFHPDKGGDEEKMKKMNTLYK
KMEDGVKYAHQPDFGGFWDATEIPTYGTDEWEQWWNAFNEENLFCSEEMPSSDDEATADS
QHSTPPKKKRKVEDPKDFPSELLSFLSHAVFSNRTLACFAIYTTKEKAALLYKKIMEKYS
VTFISRHNSYNHNILFFLTPHRHRVSAINNYAQKLCTFSFLICKGVNKEYLMYSALTRDP
FSVIEESLPGGLKEHDFNPEEAEETKQVSWKLVTEYAMETKCDDVLLLLGMYLEFQYSFE
MCLKCIKKEQPSHYKYHEKHYANAAIFADSKNQKTICQQAVDTVLAKKRVDSLQLTREQM
LTNRFNDLLDRMDIMFGSTGSADIEEWMAGVAWLHCLLPKMDSVVYDFLKCMVYNIPKKR
YWLFKGPIDSGKTTLAAALLELCGGKALNVNLPLDRLNFELGVAIDQFLVVFEDVKGTGG
ESRDLPSGQGINNLDNLRDYLDGSVKVNLEKKHLNKRTQIFPPGIVTMNEYSVPKTLQAR
FVKQIDFRPKDYLKHCLERSEFLLEKRIIQSGIALLLMLIWYRPVAEFAQSIQSRIVEWK
ERLDKEFSLSVYQKMKFNVAMGIGVLDWLRNSDDDDEDSQENADKNEDGGEKNMEDSGHE
TGIDSQSQGSFQAPQSSQSVHDHNQPYHICRGFTCFKKPPTPPPEPET
NT seq
2127 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataaagttttaaacagagaggaatctttgcagctaatggaccttctaggtcttgaa
aggagtgcctgggggaatattcctctgatgagaaaggcatatttaaaaaaatgcaaggag
tttcatcctgataaaggaggagatgaagaaaaaatgaagaaaatgaatactctgtacaag
aaaatggaagatggagtaaaatatgctcatcaacctgactttggaggcttctgggatgca
actgagattccaacctatggaactgatgaatgggagcagtggtggaatgcctttaatgag
gaaaacctgttttgctcagaagaaatgccatctagtgatgatgaggctactgctgactct
caacattctactcctccaaaaaagaagagaaaggtagaagaccccaaggactttccttca
gaattgctaagttttttgagtcatgctgtgtttagtaatagaactcttgcttgctttgct
atttacaccacaaaggaaaaagctgcactgctatacaagaaaattatggaaaaatattct
gtaacctttataagtaggcataacagttataatcataacatactgttttttcttactcca
cacaggcatagagtgtctgctattaataactatgctcaaaaattgtgtacctttagcttt
ttaatttgtaaaggggttaataaggaatatttgatgtatagtgccttgactagagatcca
ttttctgttattgaggaaagtttgccaggtgggttaaaggagcatgattttaatccagaa
gaagcagaggaaactaaacaagtgtcctggaagcttgtaacagagtatgcaatggaaaca
aaatgtgatgatgtgttgttattgcttgggatgtacttggaatttcagtacagttttgaa
atgtgtttaaaatgtattaaaaaagaacagcccagccactataagtaccatgaaaagcat
tatgcaaatgctgctatatttgctgacagcaaaaaccaaaaaaccatatgccaacaggct
gttgatactgttttagctaaaaagcgggttgatagcctacaattaactagagaacaaatg
ttaacaaacagatttaatgatcttttggataggatggatataatgtttggttctacaggc
tctgctgacatagaagaatggatggctggagttgcttggctacactgtttgttgcccaaa
atggattcagtggtgtatgactttttaaaatgcatggtgtacaacattcctaaaaaaaga
tactggctgtttaaaggaccaattgatagtggtaaaactacattagcagctgctttgctt
gaattatgtggggggaaagctttaaatgttaatttgcccttggacaggctgaactttgag
ctaggagtagctattgaccagtttttagtagtttttgaggatgtaaagggcactggaggg
gagtccagagatttgccttcaggtcagggaattaataacctggacaatttaagggattat
ttggatggcagtgttaaggtaaacttagaaaagaaacacctaaataaaagaactcaaata
tttccccctggaatagtcaccatgaatgagtacagtgtgcctaaaacactgcaggccaga
tttgtaaaacaaatagattttaggcccaaagattatttaaagcattgcctggaacgcagt
gagtttttgttagaaaagagaataattcaaagtggcattgctttgcttcttatgttaatt
tggtacagacctgtggctgagtttgctcaaagtattcagagcagaattgtggagtggaaa
gagagattggacaaagagtttagtttgtcagtgtatcaaaaaatgaagtttaatgtggct
atgggaattggagttttagattggctaagaaacagtgatgatgatgatgaagacagccag
gaaaatgctgataaaaatgaagatggtggggagaagaacatggaagactcagggcatgaa
acaggcattgattcacagtcccaaggctcatttcaggcccctcagtcctcacagtctgtt
catgatcataatcagccataccacatttgtagaggttttacttgctttaaaaaacctccc
acacctccccctgaacctgaaacataa
DBGET
integrated database retrieval system