Viruses: 29062262
Help
Entry
29062262 CDS
T40000
Symbol
BI057_gp073
Name
(RefSeq) Shigella phage SHFML-26; tail fiber protein proximal subunit
KO
K26775
Straboviridae long-tail fiber proximal subunit
Virus
1863009
Shigella phage SHFML-26
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Gp34_2nd
Gp34_trimer
Gp34_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
29062262
NCBI-ProteinID:
YP_009278971
UniProt:
A0A193H145
LinkDB
All DBs
Position
NC_031011:47725..51594
Genome browser
AA seq
1289 aa
AA seq
DB search
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDF
VIIYNNRFWAATDNIPKPAGNFNRIRWKALRTDAVYTTVSSGPYQLKSGEAISVDTSVGN
DIEFTLPPSPLDGETVIIQDIGGKPGINQVKINSSNQSIVNFRGEQVRSVLMTHPKSQMV
FIFNNRLWQMYIADYSREAAIVTPSTAYQAQSNDFIVRRFTSAAPINVKLPRFANHGDII
NFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEVGTHSIEGRTSIDGFLMFDDNEKLWRLFDGDSK
ARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTTQTIELQLPTDISVGDTVKISMNYMRKGQTVKI
KAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPEAEWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKCW
VVQQNVPTVERVDSLNASTRARLGVIALATQAQANADLENSPQKELAITPETLANRTATE
TRRGIARIATTAQVNQNTTFSFADDLIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNTGTDD
TTIITPKKLQARQGSESLSGIVTYVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQ
YKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVN
TGTDYTRAVTPKTLNDRRATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRT
SVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGTLDNVLITPKKLLGTK
STESQEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTLIRGFVKTSSGSIT
FVGNDTVGSTQSLESYEKNGYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAVDSNLLDGLDSLQFIRRD
IAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATRLIFEKGPQTGT
NPAQTMTVRVWGNQFSGESDTTRSTVFEVSDETSSHFYSQRNKAGNITFNINGTVTPINV
NASGTLNANGVATFGNSVTATGEIISRSANAFRAINGNYGFIVRNDGSVTNFMLTASGDQ
TGGFNGLRPLAINNASGQVTIGESLIIAKGATISSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPT
SDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDS
LYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGAIPSDNGIIGN
LTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWVE
NT seq
3870 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggccgagattaaaagaaagttcagagcagaagatggtctggacgcaggtggcgataaa
ataatcaacgtagctttagctgatcgtaccgtaggaactgacggtgttaacgttgattac
ttaattcaagaaaacacagttcagcaatatgatccaactcgtggatatttaaaagatttt
gtaatcatttataataatcgtttttgggcagcaacggataatattccaaaacctgctgga
aattttaatagaattcgttggaaagcattacgtactgatgctgtatatacaaccgtatca
tctggaccatatcaattaaaatccggagaagcaatttcagtagatacatcagttggcaat
gacattgagtttactttaccgccttctccgcttgatggagaaaccgtaataattcaagat
atcggtggaaaacctggcataaatcaggttaaaataaattcttcaaatcagagtattgtc
aattttagaggtgaacaggtacgttcagttttaatgactcatccaaagtcacagatggta
ttcatttttaataatcgtttgtggcaaatgtatattgctgattatagcagagaagctgcg
attgttactccatcgactgcatatcaagcacaatctaatgattttatcgtacgtagattt
acttctgccgcgccgattaatgttaagcttccaagatttgccaatcatggagatatcatt
aatttcgttgatttagataaattaaatccactttatcatacaattgttacgacatatgat
gaaacaacgtcagtgcaagaagttggaactcattccattgaaggccgtacatcgattgac
ggtttcttgatgtttgatgataatgagaaattgtggagattgtttgacggggatagtaaa
gcacgtttacgcattataacaactaattctaatattcgtccaaatgaagaagtcatggta
tttggcgcgaataatggaacaacccagacaattgaacttcagcttccgactgatatttct
gttggtgatactgtcaaaatttccatgaattacatgagaaaaggacaaacagttaaaatc
aaagctgcaggtgaagataaaattgcttcctcagttcaattgctgcaattcccaaaacgt
tcagaatatccgcctgaagctgaatgggtaacagttcaagaattagtttttaacggtgaa
actaattatgttccagttttacaacttgcttatatagaagattctgatggaaaatgctgg
gttgtacagcaaaacgttccaactgtagaaagagtagactctttaaatgcttctactaga
gcaagattaggcgtaattgctttagctacgcaagctcaagcaaatgctgatttagaaaat
tctccacaaaaagaattagcaattactccagaaacgttagctaatcgtactgctacagaa
actcgcagaggtattgcaagaatagcaactactgctcaagtgaatcagaacaccacattc
tcttttgcagatgaccttatcatcactcctaaaaagctgaatgaaagaactgctacagaa
actcgtagaggtgtcgctgaaattgctacgcagcaggaaactaatacaggtactgatgat
actacaatcatcactcctaaaaagcttcaagctcgccaaggttctgaatcattatctggt
attgtaacttatgtatctactgcaggagctactccagcttctagccgtgaattaaatggt
acgaatgtttataataaaaacactaataatttagttgtttcacctaaagctttggatcag
tataaagctactccaacgcaacaaggcgcagtaattttagcagttgaaagtgaagtaatt
gctggacaaagccaagaaggatgggcaaatgcggttgtaacgccagaaacgttacataaa
aagacatcaactgatggaagaattggtttaattgaaattgctacgcaaagtgaagttaac
acaggaactgactatactcgtgcagtcactcctaaaactttaaatgaccgtagagcaact
gaaagtttaagtggtatagctgaaattgctacgcaagttgaattcgacgcaggcgtcgac
gatactcgcatctctacaccattaaaaattaaaactagatttaatagtactgatcgtact
tctgttgttgctctatctggattagttgaatcaggaactctctgggaccattataccctt
aatattcttgaagcaaatgagacacagcgtggtacacttcgtgtagctacacaagttgaa
gctgctgcaggaacattagataatgttttaataactcctaaaaagcttttaggtactaaa
tctaccgaatcgcaagaaggtgttattaaagttgcaactcagtctgaaactgtgactgga
acgtcagcaaatactgctgtatctccaaaaaatttaaagtggattgtgcagagtgaacca
acttgggcagcaactactctgataagagggtttgttaaaacttcatctggttcaattaca
ttcgttggtaatgataccgttggttcaacgcagtcattagaatcatatgagaaaaatggt
tatgcagtatcaccatatgaattaaaccgtgtattagcaaattatttgccattaaaagca
aaagctgtagatagtaatttattagatggtctagattcgctccagttcattcgtagggac
attgcacaaacagttaatggttcactaaccttaacccaacaaacgaatctgagtgcccct
cttgtatcatctagtacagctacgtttggtgggtcagtttcagcaaatagtacattaact
atttctaatactggaacggcaactcgattgatttttgagaaaggacctcaaactggaaca
aacccggctcaaacgatgacagtcagagtgtggggaaatcaatttagtggggaatcagac
acaacacgttctaccgtatttgaagttagtgatgaaacgtctagtcatttttattctcag
cgtaataaagctggaaatataacatttaatatcaacggtacagtaacaccgataaatgtt
aatgcttcaggaacattgaatgcaaatggtgtagcaacatttggtaattcagtcactgca
actggtgaaattatttctcgaagcgcaaatgctttccgtgctattaacggaaattatggt
ttcattgttcgcaatgatgggtcagtaacgaattttatgcttactgcatcgggtgatcaa
accggcggatttaatggattgcgtcctttagctattaataatgcatctggccaagtaacg
attggtgaaagcttaatcattgcaaaaggtgctactataagttcaggcggtttaactgtt
aactcgagaattcgttctcagggtactaaaacctctgatttatatacccgtgcgccaaca
tctgatacagtaggattctggtcaatcgatattaatgattcagccacttataaccagttc
ccgggttattttaaaatggttgaaaaaactaatgaagtgactggacttccatacttagaa
cgcggtgaagaagttaaatctcctggtacattgactcagtttggtaacacacttgattcg
ctttatcaagattggattacttatccaacgaccccagaagcacgtaccactcgctggaca
cgtacatggcagaaaaccaaaaactcttggtcaagttttgttcaggtatttgatggaggt
aaccctcctcaaccttcggatataggagcaatcccatctgataatggaataataggtaat
cttactattcgtgatttcttacgaattggtaatgttcgcattattcctgacccagtgaat
aaaactgttaaatttgaatgggttgaataa
DBGET
integrated database retrieval system