Viruses: 29062333
Help
Entry
29062333 CDS
T40000
Symbol
BI057_gp144
Name
(RefSeq) Shigella phage SHFML-26; DNA polymerase
KO
K18942
Straboviridae DNA polymerase [EC:
2.7.7.7
]
Virus
1863009
Shigella phage SHFML-26
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
DNA_pol_B
DNA_pol_B_exo1
PSK_trans_fac
IFT52_central
divDNApol
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
29062333
NCBI-ProteinID:
YP_009279042
UniProt:
A0A193H100
LinkDB
All DBs
Position
NC_031011:complement(91196..93706)
Genome browser
AA seq
836 aa
AA seq
DB search
MKYARDWMKRMEDIGLEALGMNDFKLAYISDTYGSEIVYDRKFVRVANCDIEVTGDKFPD
PMKAEYEIDAITHYDSIDDRFYVFDLLNSMYGSVSKWDAKLAAKLDCEGGDEVPQEILDR
VIYMPFDNERDMLMEYINLWEQKRPAIFTGWNIEGFDVPYIMNRVKMILGERSMKRFSPI
GRVKSKLIQNMYGSKEIYSIDGVSILDYLDLYKKFAFTNLPSFSLESVAQHETKKGKLPY
DGPINKLRETNHQRYISYNIIDVESVQAIDKIRGFIDLVLSMSYYAKMPFSGVMSPIKTW
DAIIFNSLKGEHKVIPQQGSHVKQSFPGAFVFEPKPIARRYIMSFDLTSLYPSIIRQVNI
SPETIRGQFKVHPIHEYIAGTAPKPSDEYSCSPNGWMYDKHQEGIIPKEIAKVFFQRKDW
KKKMFAEEMNAEAIKKIIMKGAGSCSTKPEVERYVKFNDDFLNELSNYTESVLNSLIEEC
EKAATLANTNQLNRKILINSLYGALGNIHFRYYDLRNATAITIFGQVGIQWIARKINEYL
NKVCGTNGEDFIAAGDTDSVYVCVDKVIEKVGLDRFKEQNDLVEFMNQFGKKKMEPMIDV
AYRELCDYMNNREHLMHMDREAISCPPLGSKGVGGFWKAKKRYALNVYDMEDKRFAEPHL
KIMGMETQQSSTPKAVQEALEESIRRILQEGEESVQEYYKNFEKEYRQLDYKVIAEVKTA
NDIAKYDDKGWPGFKCPFHIRGVLTYRRAVSGLGVAPILDGNKVMVLPLREGNPFGDKCI
AWPSGTELPKEIRSDVLSWIDYSTLFQKSFVKPLAGMCESAGMDYEEKASLDFLFG
NT seq
2511 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatatgctcgagattggatgaaacgaatggaagacatcggtctcgaagctctcggt
atgaacgattttaaactcgcttatatcagtgatacgtatggttcagaaattgtttatgac
cgaaaatttgttcgtgtagctaactgtgacattgaggttactggtgataaatttcctgac
ccaatgaaagctgaatatgaaattgatgctatcactcattacgattcaattgatgatcgt
ttttatgttttcgaccttttgaattcaatgtacggttcagtatcaaaatgggatgcaaag
ttagctgctaagcttgactgtgaaggtggtgatgaagttcctcaagaaattcttgaccga
gtaatttatatgccattcgataatgagcgtgatatgctcatggaatatatcaatctctgg
gaacagaaacgacctgctatttttactggttggaatattgaggggtttgacgttccatat
attatgaatcgcgttaaaatgattctaggtgaacgcagtatgaaacgtttctctccaatc
ggtcgggtaaaatctaaactaattcaaaatatgtacggtagcaaagaaatttattctatt
gatggcgtatctattcttgattatttagatttgtataagaaattcgcatttactaatttg
ccgtcattctctttggaatcagttgctcaacatgaaaccaaaaaaggtaaattaccatac
gacggtcctattaataaacttcgtgagactaatcatcaacgatacattagttataacatc
attgacgtagaatcagttcaagcaattgataaaattcgcgggtttatcgatctagtttta
agtatgtcttattatgctaaaatgcctttttctggtgtaatgagtcctattaaaacttgg
gatgctattatttttaactcattgaaaggtgaacataaggttattcctcaacaaggttcg
cacgttaaacagagttttccgggtgcatttgtatttgaacctaaaccaattgctcgtcga
tatattatgagttttgacttgacgtctctgtatccgagcattattcgtcaggttaacatt
agtcctgagactattcgtgggcagtttaaagttcatccaattcatgaatatatcgcagga
acagctcctaaaccgagtgatgaatattcttgttctccgaatggatggatgtatgataag
catcaagaaggtatcattccaaaggaaatcgctaaagtatttttccagcgtaaagattgg
aaaaagaaaatgttcgctgaagaaatgaatgccgaagctattaaaaagattattatgaaa
ggcgcagggtcctgttcaactaaaccggaagttgaacgatatgttaagttcaatgatgat
ttcttaaacgaattatcgaattacaccgaatctgttcttaacagtctgattgaagaatgt
gaaaaagctgctacacttgctaacacaaatcagttgaaccgtaaaattcttattaacagt
ctttatggtgctcttggtaatattcatttccgctactatgatttgcgaaatgctactgct
atcacaattttcggtcaagtcggtattcaatggattgctcgcaaaattaatgaatatctg
aataaagtatgtggaactaatggtgaagatttcatcgcagcaggtgatactgattcggta
tatgtttgtgtagataaagtaattgaaaaagtaggtcttgaccgctttaaagaacaaaat
gatttagttgaattcatgaatcagtttggtaagaaaaagatggaacctatgattgatgtt
gcatatcgtgagttatgtgattatatgaataaccgcgagcatctgatgcatatggaccgt
gaagctatttcttgccctccgcttggttcaaagggtgttggtggattttggaaagcgaaa
aaacgttatgctctgaacgtttatgatatggaagataagcgatttgccgaaccgcatcta
aaaatcatgggtatggaaactcagcagagttcaacaccaaaagcggtgcaagaagctctc
gaagaaagtattcgtcgtattcttcaggaaggtgaagagtctgtccaagaatactacaag
aacttcgagaaagaatatcgtcaacttgactataaagttattgctgaagtaaaaactgcg
aacgatatagcgaaatatgatgataaaggttggccaggatttaaatgcccattccatatt
cgtggtgtgctaacttatcgtcgagctgttagtggtttaggtgtagctccaattttggat
ggaaataaagtaatggttcttccattacgtgaaggaaatccatttggtgacaagtgcatt
gcttggccatcaggtacagaacttccaaaagaaattcgttctgacgtactatcttggatt
gactactcaactttgttccaaaaatcgtttgttaagccgcttgcaggtatgtgtgaatcg
gcaggtatggactatgaagaaaaagcttcgttagacttcctgtttggctga
DBGET
integrated database retrieval system
