Viruses: 29067394
Help
Entry
29067394 CDS
T40000
Symbol
BI097_gp082
Name
(RefSeq) Shigella phage SHSML-52-1; tail fiber protein proximal subunit
KO
K26775
Straboviridae long-tail fiber proximal subunit
Virus
1863011
Shigella phage SHSML-52-1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Gp34_2nd
Gp34_trimer
DUF4410
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
29067394
NCBI-ProteinID:
YP_009289043
RS:
NC_031090
UniProt:
A0A193H2D7
LinkDB
All DBs
Position
NC_031090:complement(50453..54328)
Genome browser
AA seq
1291 aa
AA seq
DB search
MADIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQVYDSTRGYNKGF
VVLYDNRLYQAINDIVSPSGAFNLLQWRAVRTDAQWITVASGTYQLSSGESISVNTGAGN
DMVFTLPNTPVDGDTVVLADIGGRTGTVKVQINASVQSILNFRGEQVRTVLMTRPRSQLL
FVFSNRLWQMYITDYGKESITVTPATPYQAQANDFIVRRFTSAAPINITLPRNANNGDII
SLVDLDRLNPLYHTIVKTFDDTTSIGEVGTHIAEGRNDSDAFFVFDAANSLWRIWEGDQK
SRLRIIRADSNIRPNEEVLIFGTNNATTGTINLTLPTGILSGDTVKISMNYMRKGQTVKI
KAAEGDTIASTVALLQFPKRSEYPPDAQWVSVTELEFNGTTSYVPVLELAYIEDTVAGTR
YWVVQQNVPTVERVDAGTDATRARLGVIALATQAQANVDLENTPAKEVAITPETLANRTA
TEARRGIAKIATTAQVNQNSTAAFVDDTIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQAETDAGL
DDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVKYVSTTSATPAETRGAAGTNVYNKTVNNLTISPKAL
DQYKATYAQQGAVILAVDSEVIAGQSQAGYSHAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAE
TNAGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAELATQVEFDTGTDDTRISTPLKIKTHFDSSD
RTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLG
TKSTETSEGVIKVATQAETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQNEPTWAATTAIRGFVKTSSGS
ITFVGDDTQGSTQDLNLYEKNSYAISPYELNRVLANYLPLKAKAADANLLDGLDSSQFIR
RDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATRLIFEKGPQT
GTNPAQTMTIRVWGNQFGGGSDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKDGNIAFSINGTVMPI
NINASGLMNVNGVATFGRSVTANGEFISKSANAFRAISGDYGFFIRNDAANTYFMLTASG
DQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGEGLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGSKTSDLYTRA
PTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTL
DSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATI
GNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKSVKFEWIE
NT seq
3876 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggccgacatcaaacgtaagttcagagccgaagacggtctggacgccggtggcgacaag
attgttaacgtagcattagccgaccgtacagtaggtactgatggcgtaaacgttgacttc
ctggtacaagaaaacaccgttcaagtatatgattctacgcgtggatataacaaaggattt
gttgttctttatgacaaccgtttatatcaagcaataaatgatatcgtgtctccttccggg
gcatttaaccttttacaatggcgtgcagttcgtactgatgcacaatggataactgtcgct
tctgggacttatcaactttcttcaggtgaatcgatttcggttaacactggtgccggcaat
gatatggtttttacattgccaaatactccagttgatggtgatactgttgttttggctgat
attggtggacgaaccgggacagttaaagtacagattaacgcgtctgtacagagtatttta
aactttagaggtgaacaagttcgtacggttttaatgacgcgcccacgttcacaactattg
tttgtgtttagtaatcgtttgtggcagatgtatattaccgattatggtaaagaatcaatc
actgttacacctgcgacaccatatcaagcacaagcaaatgattttatcgttcgtcgtttt
actagtgcagcaccaatcaacattacacttccacgtaatgctaacaatggtgatataatc
agcctagtcgatttagatagattaaacccactgtatcatacaattgttaaaacatttgat
gatacaacgtctattggtgaagtcgggactcatattgctgaaggcagaaatgactctgac
gcgttttttgtttttgatgctgcaaatagtttatggcgtatatgggaaggcgaccagaaa
tcgcgtcttcgtattatccgtgcggattcaaatattcgtccaaatgaagaagttcttatc
tttggcacaaataacgctacaaccggaactattaatcttacgctgcctaccggaattttg
agtggtgacactgttaaaatttcaatgaactacatgcgtaaaggtcaaacagtaaaaatt
aaagctgccgaaggtgatacaattgcttccactgttgcattgcttcagttccctaaacgt
tctgaatatccacctgatgctcaatgggtctctgttactgaactagaattcaatggcact
acttcatatgttcctgtattagaattagcgtatatcgaagacaccgttgctggtacacgt
tattgggttgtgcaacagaatgtccctacggtagaacgtgttgatgctggaactgatgct
acacgagctcgtttaggtgttattgctcttgctactcaagcgcaagcaaatgttgattta
gagaatactccagctaaagaagtggctattactcctgaaacgttggcaaatcgtacagca
actgaagctcgacgtggtatcgctaaaattgctacaacagcacaagttaaccagaattcc
acagcagcatttgtggacgatactattgttacgcctaaaaaattaaatgagcgtacagca
actgaaactcgtcgtggtcttgctgaaattgctactcaggctgaaactgatgccggtctt
gatgacacaacgattattacacctaagaaattgcaggcacgtcagggttctgaaacacta
tctggtatagttaaatatgtatcaactacttctgctactcctgctgaaactcgtggggcc
gcaggcactaacgtttataataaaaccgtaaataatttaactatttctcctaaagccctt
gaccaatataaagcaacttatgctcaacaaggtgcagtaattttagctgttgatagtgaa
gtaattgctggtcaatcacaagcaggttattctcacgctgtagtaactcctgaaacacta
cataagaaaacttctactgatggacgtattggtttaattgaaattgctacgcaagcagaa
actaatgctgggactgattatacacgtgcagtaacgcctaagacgttaaatgataggaaa
gctacggaaggattatccggcatagccgaacttgctacgcaagttgaatttgatactgga
actgatgatactcgtatctcgactccactgaaaattaaaactcattttgattcttctgac
cgtaccagtgttaattctgattccggacttattgaagaaggaaccttgtggaaccattat
actcttgatatttctaaagcaaatgaaacacaacgtggtacacttcgagtagcgacccag
gcagaatctaatgcaggaactttagatgatgttcttattactcctaaaaagcttttaggg
actaagtccactgaaacgtctgaaggcgtaattaaggttgctactcaggctgaaactgta
acaggaacttctgctaatactgctgtatctcctaagaatttaaaatggattgtccagaat
gaaccaacatgggctgctactacagcaattcgcggattcgttaaaacttcatccggttct
attacattcgttggtgacgatactcaaggtagtacccaggatctgaatctttacgagaaa
aatagttatgctatttctccatatgaattaaaccgtgtattagcaaattatttgccatta
aaagcaaaagctgctgatgcaaatttattggatggtctagattcatctcagttcattcgt
agggatattgcacagacggttaatggttcactaaccttaacccaacaaacgaatctgagt
gcccctcttgtatcatctagtactgctacgtttggtggttcagtttcggcaaatagtaca
ttaactatttctaatactggaacagcaactcgtctgatttttgaaaaaggacctcaaact
ggaactaacccagcacagacgatgactatcagagtatggggaaatcagtttggtggcgga
tcagatacaacacgttctactgtatttgaagttggtgatgaaacgtctaatcatttttat
tctcaacgtaataaagatgggaatatagcgtttagcattaatggtactgtaatgccaata
aacattaatgcttccggtttgatgaatgttaatggcgttgcaacatttggtcgttcagtc
acagccaatggtgaattcattagcaagtctgcaaatgctttcagagcaattagcggtgat
tacggattctttattcgtaatgatgctgctaatacctattttatgcttactgcatccggt
gatcagaccggtggatttaatggattacgtcctttggctattaataatgcatctggccaa
gtaacgattggtgaaggcttaatcattgccaaaggtgctactataaattcaggtggttta
actgttaactcgagaattcgttctcagggttctaaaacatctgatttatatacccgggcg
ccaacatctgataccgtaggattctggtcaatcgatattaacgattcagccacttataac
cagttcccgggttattttaaaatggttgaaaaaactaatgaagtgactgggcttccatac
ttagaacgtggcgaagaagttaaatctcctggtacattgactcagtttggtaatacactt
gattcgctttaccaagattggattacttatccaacaactccagaggcacgtacaacccgt
tggacacgtacatggcagaaaactaaaaattcttggtcaagttttgttcaggtatttgat
ggcggaaaccctcctcaaccttctgatattggtgctttaccttctgataatgcaacaatc
ggaaacttgacaataagggatttcttaaggattggtaatgtccgcattattccagaccct
gtgaataaatctgttaaattcgagtggattgaataa
DBGET
integrated database retrieval system