Viruses: 29067475
Help
Entry
29067475 CDS
T40000
Symbol
BI097_gp163
Name
(RefSeq) Shigella phage SHSML-52-1; baseplate wedge subunit
KO
K26780
Straboviridae baseplate wedge protein Gp10
Virus
1863011
Shigella phage SHSML-52-1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Gp10_C
T4_gp9_10_N
Gp10_D3
T4_gp9_10_C
CAP18_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
29067475
NCBI-ProteinID:
YP_009289124
RS:
NC_031090
UniProt:
A0A193H2J0
LinkDB
All DBs
Position
NC_031090:complement(112917..114722)
Genome browser
AA seq
601 aa
AA seq
DB search
MKQNIKIGNVVDDGQGDYLRRGGEKINENFDEIYYELGDGEVPYAAGAWKTYDAADGLNL
KAAWGKSYAINTTSGRVSVNLPKGTIADYNKVIRARDVFATWNINPVTLIPANGDTIKGS
SSPVEINVQFSDLELVYCAPGRWEYIKNKQIDKIVSSDISNVARREYLVETQGQTDFMDV
FNGTSYNVNNIRVKHRGNELYYGDVFSDNSDFGSPGANPGELVALDGFNIRLRQPCNVGD
TVQIETFLDGVSQWRSSYTRRQVRILDSKLTAKKSIDGSIYVTDLSTFRSIPFTAFGINP
TEPPNPNSLEVRFNGILQELAGTVGTPIFRCEGVDADSEESCANLGGTWTQSYTDYAIEY
TDNIPSAILFDRQFEDQDIITITWFNNDLGTLLEMEEILDVADEKYVSQGSNIEITGDVA
LTDFDKIGWPNVEPVPKYEREFSTISAIFDTIYPVGTIYENAVNPNNPATYLGFGSWKIW
GQGKVLAGWNDDASDPNFALNNNDLDINGNPTHTAGGTVGVTTITLENADLPATQTDEKV
LISDDNGTVIIGGCQYDPDEEGPIYTKYREDHAKTNGSHVPARSITNIQPSITVYRWVRI
A
NT seq
1806 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacaaaatattaaaattggtaacgtcgttgatgacggacaaggcgattaccttcgt
cgaggtggcgaaaaaataaatgagaacttcgacgaaatctattatgaattaggtgatggt
gaagttccttatgccgctggcgcatggaagacttatgatgcggctgatggtcttaatctt
aaggctgcttggggtaaatcttatgcaattaatactacttctgggcgagtttcggtaaat
cttcctaaagggacaattgcagactataataaagttattcgtgctcgtgatgtatttgca
acttggaacattaaccctgttactttaattccggcaaacggagacacgattaaaggttct
tcatctccagtagaaattaacgttcagttctctgatttagaattagtttattgtgctcct
ggacgttgggaatacatcaagaacaaacaaattgataaaatagttagctctgacattagt
aatgttgctcgtagagaatatctggttgaaacccaaggtcagaccgatttcatggatgtt
tttaacgggacctcttataacgttaacaacattcgcgtaaaacatcgtggcaacgaatta
tattatggtgatgtgttcagtgataatagtgattttggttctcctggtgctaatcctggt
gaactggttgcacttgatggatttaatattagattacgccaaccatgtaatgttggggac
actgtacaaattgagacattcctagacggtgtttctcagtggcgtagttcatatactcgt
cgccaagttcgcattttagatagtaaattgactgctaaaaagtctattgacggaagtatt
tacgtcactgatttgagtacgttccggtctattccatttacagcatttggtattaatcct
acagaaccacctaacccgaattcattagaagttcgcttcaatggtattctccaagaatta
gctggtactgttggaactcctattttccgttgtgaaggtgtggatgctgattctgaagag
tcatgcgctaatctcggtgggacatggactcaatcgtatacagattatgcgattgaatat
actgataatatccctagcgcaattctgtttgaccgtcaatttgaagaccaagacattatt
accatcacatggtttaataacgatttaggaactcttcttgaaatggaagaaattcttgat
gtcgctgatgagaaatatgtttctcaagggtctaacattgaaattactggtgacgttgca
ttaaccgatttcgataaaattggatggcctaatgtagaacctgttcctaagtatgaacgt
gaattctcgactatctcagcaatatttgatacaatttatcctgtcgggactatttacgaa
aatgcggttaaccctaataatccggccacttatttaggttttggttcgtggaaaatttgg
ggacaaggcaaagtattagccggttggaatgatgacgcatcggatcctaattttgcatta
aataataatgaccttgacatcaatggtaaccctactcataccgcaggtggtaccgttggt
gtaacaaccatcacattagaaaatgctgatttaccagctacacaaaccgatgaaaaggtt
cttatttctgatgataatggtacagtaattataggcggttgccaatatgacccggatgaa
gaaggtcctatttacactaaatatcgtgaagaccatgcaaagactaatggatctcatgtt
ccagcgcgttctataactaatattcagccatctataactgtataccgttgggtaaggatt
gcataa
DBGET
integrated database retrieval system