Viruses: 3021964
Help
Entry
3021964 CDS
T40000
Symbol
STSV1pORF41
Name
(RefSeq) Sulfolobus virus STSV1; transmembrane protein
Virus
285013
Sulfolobus virus STSV1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
GAPES3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3021964
NCBI-ProteinID:
YP_077234
LinkDB
All DBs
Position
NC_006268:43571..45766
Genome browser
AA seq
731 aa
AA seq
DB search
MLAFLIFIITTIASAAIQQINILVNIPPSLTGNNLFFVIPLKVNNSVITNNNFYVINNYG
YYEYSYLFSSTPPLLTLYQAQATNTTYYVTFGNGITPQYVSTNIYSNLFTFYLINTTIFN
VSGVTASAGIATFANNSHLWFQPSTSRYIPSSVLFLYNILPSATLSVSPLIYSGQPLQAG
AAVFFNLFQSSTTYTFSAQYLNVPYLFLNYIQYPTLQITNNQVAINNFPPVPVKPVSEVI
VTQNQTIVSNVTFHTTPIITPSSSFSTTYIAAFAAIYSQTGSSVYGLAPLIFTQSMINGS
NLYAVENGKFVTVGTAPSSLSLVNNPQMFVINLGNNAKNITLYGVPIGSTIAVTYSNSTT
KTFIAQGQVVNNVGPLKLTNYGIPAGSGITTMVITLPGSQDIYTAQIGFTDFVHAFYVNL
TNGFATVDVNGTQLVTLGQVVLPANIVIGTQQVGSNTYLLGLVQSYTGQVYNFLVPLNYP
VYNVVPYVKYVTYTGQPLLLTEIGVYPANGLFYTLNGQIKLSVSTPYPITATVETIVTSP
GLTLSINNGKVNVYTNSSTSSSNLVIEGANGYQLQLIYQNVQTTTPITSNYYSVQIPSNM
PALVSVDPSSRVIIVNANAIQQQQAQYINQKVTLNQPLNVTIAQLQITPIKVQLPTVSTN
QIVQIVTNYAYAAFGIYLINRNLEITNTLWYGSMLLSLLGFIVAIVISDKALTAMSLLLL
VVSFGLRYIGK
NT seq
2196 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttggcctttctaatctttatcattacaacgattgcctctgcagctatccagcagata
aacatcctagtcaacattccgccatctttaactggaaacaacttgtttttcgtcattcca
ttgaaggttaataatagcgtaataaccaataataatttttatgttatcaataactatggc
tattatgaatactcttatcttttctcatccactccaccactattaacactataccaagca
caagctacaaacacaacgtattacgttacgtttggaaacggaataacaccacagtacgtt
tcaaccaacatatactcgaaccttttcacattctatctaataaacactacaatttttaat
gtaagtggtgttacagcaagcgctggaattgcgacttttgcgaataacagtcacctatgg
ttccaaccatctacatcccgttacattccgtcttcagtcctattcctttacaacatttta
ccgtcagcaaccttatctgttagcccattaatatactctggccaaccattacaggctggc
gctgcagtattctttaacctatttcaatcatcaactacatacacgttctcagcacaatac
ttgaacgtaccttaccttttcctaaattacatacaatatcctacactacaaataactaac
aatcaggtagcaatcaacaatttcccaccagtgccagtaaagccggtctccgaagtgata
gtaactcaaaatcaaaccatcgtgtcaaacgttaccttccacactactccaattatcaca
ccttcatcatcattctcaacaacttatatagcagcttttgcagcaatctattctcaaact
ggttcatccgtttatggtttagccccactcatcttcactcaatcaatgataaatggttct
aacctatacgcagtagaaaatggaaaatttgtaactgtgggtactgcgccctcatcctta
tccttagtcaacaatccgcaaatgtttgtaataaacttaggtaataatgcaaagaacata
acattgtatggagttccaataggctctacaattgccgtaacgtattcaaatagtacaact
aaaacgtttattgcacaagggcaagtagttaataacgttggtccattgaagttaactaac
tatggtattccagctggtagtggaattactacgatggtaatcactttgccaggctctcaa
gacatttacactgcgcaaataggctttaccgattttgttcatgctttttatgtgaattta
acaaatggttttgcaaccgtagatgttaatggcacacaattagttacacttgggcaagta
gttttaccagcaaatattgttattggaacacagcaagttggttcaaacacttaccttctt
ggccttgtacaatcatacactggacaagtttataatttcttagtaccactaaactatcca
gtctataacgttgtaccttacgtaaaatatgtgacatacactggccaaccattgttatta
actgaaataggcgtttatccagcgaatggtttgttctacactttaaatggacaaattaag
cttagtgtttccacgccttatccaattactgctacagtggaaacaatagttacatcgcct
ggcttaacgctttcgattaataatggtaaagtaaacgtttatactaattcttctacatct
tcttcaaacttggtaatagaaggggcaaatggttaccagctacagttgatttatcaaaac
gtacaaactactaccccaataacatcaaactactactcagttcagataccttcaaatatg
ccggccttagtttcagttgatccatcatcaagagttattattgttaatgctaatgctatc
cagcagcaacaggcacaatacattaaccaaaaagtaactctaaaccaaccattaaacgtg
acaatagcccaattgcaaattacaccaataaaagtacaattgccaacagttagtactaac
caaatagttcaaattgttacgaactatgcctatgcggcatttggaatttacttgataaat
agaaaccttgaaattacaaacacattatggtatggttcaatgctcttgagtttactggga
ttcattgtagctatagtaatttcagacaaagcattaacagctatgtcattgttactactt
gtagttagctttggtttaagatatattggaaaatag
DBGET
integrated database retrieval system