Viruses: 30306402
Help
Entry
30306402 CDS
T40000
Symbol
BOW87_gp146
Name
(RefSeq) Synechococcus phage S-CAM3; virion structural protein
Virus
1883366
Synechococcus phage S-CAM3
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
End_beta_barrel
Transposase_29
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
30306402
NCBI-ProteinID:
YP_009321375
RS:
NC_031906
UniProt:
A0A1D8KKB3
LinkDB
All DBs
Position
NC_031906:116292..121340
Genome browser
AA seq
1682 aa
AA seq
DB search
MAKKQIKNYAFNPGVAGQGTLKFVGRYSEEQLLLITNVTAGEVLASFADASKPTSLSYIL
VNPLSTDVDFPSAHNEADYLTVITFLYDTSTFTSTDSVQIFVEVDEQTIRPWDFGTDAIE
RMRIAEPQSMLDADFEYGIQPTKWQSLDLFRNYPSLYEIPGTSIGCASITTDASSGTSFI
GPSSITVQSVLDHGLIEGDPISIRGIDDSVFGYSKAEGSFVVAAVVNSTEFTFFAKGKVG
TLQGTQLLTNFTEVKKAGFYTGAAIGTPTLSVLTQGATGNVLSDQTSPAAGSIIGLTASS
VVPPIGAPILGVAISSGSQITSTVASSFDKEVTTSFVAPVSSIVLNDVTNIEVGHAVSDG
SGANVFVTNITNNEVFFDGDLTTDKNGNNLSQNFESVSPVNFGQGSGGKFDITRTAGVYA
AVITPTSFFPGRAQDSYSGTFGNNAQFSVTANHSTGAYSDVQLLNGGVAYSATETITISG
VNLGGATTANDLVITIDTVDATGAILTFTPSPTAVATSTNPNVGENYTTGETLIIYGTQL
DGESPANDLKIILTGAVGGSGEITTFTTTGTGVSPDQDYNGISGSGGTGSNATFNIQKLG
GGLDISQLEEITIGGIIEADDVFSITIDGTPLSYTALAGETITAIRNELIDAVNTASIAG
TIDVWASAGDTSEVLYIEGLTAGTAFTIAVATNDTGGAAADTQTFTVSQIRAASSTSGSP
AYSVVVANPGSGFTVGDNITILGNELGGVSPENDLIVNVASLDPNNGILTFNESGVASSG
DASYLGLTGQAAATGATIKATINASGNYVPVIGSPGANYEIGYELLIDGSTLGAVSPDND
MTVTVVSVDSTGSITEASATGLPASGDTITFRPSMTISEPLFQTVPTGTSYSYSSIAKIQ
ATFTSNHGLLPGSQILVAITSNGVNHGLCSGPFFIESVPTPTSLVYTSRSTGNVNTGTIL
TGSITARSDTFYVHRPFDGGVQIGTGSPAHGAQAIRQSKKYIRYQSGKGIMYTTGVNFAP
SYDIRSVIAEDITPGSKIEVITDDIDHGLQVGAEITLEGITSTGYNGHYTVTDIVNENTF
KVEAQETLEEYIAKFGIQPQVGLYAWKGATVRSGCFDEQNGIFFQYDGTNYAIGLRSSTF
QLAGTLSVDSGSNEISGSNTRFREQLKTGDRIVLRGMTHVVTNITDNTTMYVNPDYRGVS
DCVNSKAAITRELIIPQSQWNIDKCDGTGQSGYKINVNKMQMIGFQYSWYGAGFIDWMLR
GPRGDYIFLHRLKNNNLNTEAYMRSGNLPVRYEVINEGPGARLVSNINSTDTSITLDDAT
LFPDFGTLYIDNELIRYNSKNGNTLSGLTRSATFSNFVAGSQRSYTAGVAADHDESTGVV
LASVTATPQINHWGSAFLTDGKFDEDRGYIFSYRLPTVQVSVIKSTLFLIRLSPSVSNAI
IGDLGERELINRAQLLLKNIDIVVEGGQNTQTVIVEGVLNPSNYPVTPSDVSWSGLNNQG
AGGQPSFAQVATSVDWGTVATSIAATNAIDNGTRNYHYFTPSDVSGVNIGDNVSTSGASG
KNFTGGETITDIGNSQRFPGLVYIEFSSKIDAGAVGQTTFTFTSLAGSTAQPGEQAFSFT
AGCGSGDRDGIDLSGLKELTNTPIGGTGAFPNGPDVLAVNAFLSNGSDVDVTINLRWSEA
QA
NT seq
5049 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctaaaaagcaaattaaaaattacgccttcaacccaggcgttgcagggcaaggtact
ttaaaatttgttggtaggtatagtgaagagcaacttcttctaattacgaatgtaactgct
ggcgaggttctcgcttcgttcgcagacgcatcgaaaccaacatcgttgagttatatcctg
gttaatcctttaagtacagatgtagattttccgtcagcacataacgaggcagactatcta
actgtaattactttcctttacgatacttctacatttacttctactgattctgttcaaatt
tttgtagaggttgacgagcaaacaattagaccatgggactttggtacggacgctattgag
cgtatgcgtatcgctgaaccacagtcgatgctcgacgccgactttgagtatggcatccaa
ccaacgaagtggcagtcattagacctcttcagaaactatccatctctttatgagattcct
ggaactagtattggatgtgcttctattacaacagatgcttcttcaggaactagcttcatt
ggtccttcgagtattaccgtgcagtctgtgttagatcacggtcttattgaaggtgatcca
attagtattcgtggtatagatgattctgtttttggatatagtaaagctgaaggatctttt
gttgttgctgctgttgtaaactcaacagaatttactttctttgctaaaggtaaggtagga
acgctacaaggaactcaacttctaacaaacttcacagaagtgaagaaggctggattctat
acaggtgctgcaattggaaccccaacactatcagtccttactcaaggtgctactggtaat
gttctttccgatcagacttctcctgctgcaggaagtattattggtttgactgcatcttca
gtagttcctcctatcggagctccaattcttggtgtagcaattagcagtggttcgcagatt
acatctacagtagcgtcttcttttgataaagaagtaacaacatcatttgtagcaccagta
tcaagcatagttttaaatgatgttactaacattgaagtaggacatgctgtatctgatggt
tcaggtgctaacgtttttgttactaatattactaacaacgaagtattttttgatggagat
ctaaccactgataagaatggcaataacctttctcaaaatttcgagagtgtttctccagta
aacttcggacaaggaagtggtggtaagtttgacatcaccagaactgctggcgtatatgct
gctgtaattaccccaacttcatttttccctggaagagcgcaagattcttattctggaact
tttggtaataatgcacagtttagtgtcactgcaaatcatagcactggtgcatactctgat
gtacaactactaaatggtggtgttgcatattctgctacagaaactattactatctctgga
gtaaatcttggtggtgcaactacagcaaacgatctggttatcactattgatactgtagat
gcaactggtgccattttaacattcaccccctctccaactgcggttgcaacatcaacaaac
cccaacgttggtgaaaactatactacaggcgaaactctaattatctacggtactcaactg
gatggagaatcaccagctaatgatctaaaaattattttaactggagcagtaggtggtagc
ggagaaatcaccacgttcactactactggtactggagtttctccagatcaagattataat
ggtatttctggttcgggtggtacaggtagtaatgccactttcaatatccagaaacttggt
ggaggattagatatctctcaactggaagagattaccattggaggaatcatcgaagcagat
gatgtttttagtattactatcgacggcactccactttcatacacagcattagcaggtgag
actattactgctattagaaatgaattgattgatgctgtcaataccgcttctattgctggt
actattgatgtctgggcatctgctggtgacacatcagaagttctttatatcgagggactg
actgctggtacagcatttacaattgctgttgctactaatgatacaggtggtgctgcagca
gatactcaaacgtttactgtatcacaaattagagcagcatcaagcacatctggcagtcct
gcttacagtgttgttgttgcaaatcctggtagtggatttactgttggcgacaacattacg
attctcggcaatgaacttggtggagtttctccagaaaatgatctgattgttaatgttgcg
tctcttgatcctaataatggtatcttaacgttcaatgaatctggtgttgcttccagtggt
gatgcaagttatctgggattgacgggtcaagcagctgctacgggagcaactatcaaagca
actattaatgcttctggaaactatgttcctgtaatcggatctcctggtgctaattatgaa
attggatatgagttattaatcgatggatctacccttggcgctgtctctcctgacaatgac
atgacagtaaccgtagtcagtgttgactctactggttctattactgaagcaagtgccact
ggtctacctgcttctggagatacgattactttcagaccatcgatgacaatttcggaacct
ttgttccaaacagttccaacgggaacttcatattcttacagctcaattgcaaaaattcaa
gcaacctttacatcaaatcatggtctactaccaggaagtcaaatccttgttgcaatcaca
tcaaatggtgtaaatcacggtctatgttctggaccattctttattgagagtgttccaact
ccaacatcattagtatacacttccagatctactggtaatgtcaatacaggaacaatttta
actggatcaattactgccagatctgatacattctatgtccacagaccatttgatggtggt
gttcagatcggtacaggatctcctgcacatggagcacaggcaattcgtcagtccaaaaag
tatatcagatatcagtcaggtaaaggtatcatgtataccactggtgttaacttcgctcct
tcttatgatattagaagtgttattgctgaagatataactcctggatcaaagattgaagtt
atcactgatgacatcgatcatggattacaagtcggtgcagaaattactcttgagggtatt
acatctactggttacaatggtcattacactgtaactgatattgttaatgagaatactttt
aaggtagaagcacaggagactcttgaagagtatatcgcaaagtttggtattcaaccacag
gtaggtctctatgcatggaaaggtgctactgttagatctggttgttttgatgaacagaat
ggtatcttcttccagtatgatggaacaaactatgctatcggtttgagatcttctacattc
cagttagcgggaactttatctgttgattcaggatcaaatgaaattagtggatctaatacc
agatttagagaacagttgaaaactggtgacagaattgtactacgtggtatgactcacgtt
gttactaacattaccgacaatacgacaatgtatgtcaatccagactacagaggagttagc
gattgtgttaatagtaaggcagcaattaccagagaactaattattcctcaaagtcaatgg
aacattgacaagtgtgatggcactggtcaatctggatataagatcaatgttaataaaatg
cagatgattggattccagtattcttggtatggtgctggtttcattgactggatgctacgt
ggtccaagaggagactatatcttcttacacagactcaagaataacaacctcaatacagag
gcatacatgagatctggtaacctcccagttagatatgaagttattaatgaaggacctgga
gcaagactagttagtaacatcaattctaccgatacatctattaccctggatgatgcaact
ttgttccctgacttcggaactttgtatatcgacaatgagctcattcgttataactcgaag
aatggaaatactctttctggtttaaccagatcagcaacgttctctaactttgtggcagga
tcacaaagatcttatactgctggagttgctgcagatcacgatgaatctactggagttgtt
cttgccagtgtaactgctactccacagattaatcactggggttctgcattcctgaccgat
ggtaagttcgatgaagatagaggatacatcttctcatacagactaccaacggttcaggta
agtgttatcaagtccactctgttcttaattcgcttgtcacccagcgtatctaacgcaatc
attggtgatcttggcgaaagagaactaatcaacagagcacagttgctactgaagaacatt
gatattgttgtggagggtggacagaatacccagacggttattgttgagggtgttctcaac
ccatctaactatccagtaacaccatccgacgtttcttggagcggtttaaacaaccagggt
gctggtggacaaccatcattcgcacaggttgctacttcagttgattggggtacagttgct
acttctattgcagcaacaaacgctattgataatggcacaagaaactaccattacttcact
cccagtgacgtttcaggtgtaaacattggtgacaacgtttctacatctggagcaagtggt
aagaacttcactggtggtgaaactattactgatattggcaacagccaaagattccctggt
ttagtctatattgagttctccagtaaaattgatgcaggtgcggttggtcaaacaacattc
accttcacgtcacttgctggttctactgcacaaccaggcgaacaggcattctcgttcacg
gcaggttgtggtagtggagaccgtgatggtattgatctatctggtcttaaggaactcacc
aacactccaatcggaggaacaggtgcattcccgaatggtcctgacgtattagcggtcaac
gcattcctatctaatggatctgacgttgacgttacgatcaacttgagatggtccgaagca
caggcataa
DBGET
integrated database retrieval system
