Viruses: 30309980
Help
Entry
30309980 CDS
T40000
Symbol
BOW92_gp217
Name
(RefSeq) Synechococcus phage S-WAM1; tail fiber protein
Virus
1815521
Synechococcus phage S-WAM1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Other DBs
NCBI-GeneID:
30309980
NCBI-ProteinID:
YP_009325016
RS:
NC_031944
UniProt:
A0A1D8KS45
LinkDB
All DBs
Position
NC_031944:23364..26936
Genome browser
AA seq
1190 aa
AA seq
DB search
MALTRLKNIITSRTGRIIYVNPDDFDASDAYDNRGNSALRPFKTLQRAFLEVARFSYRVG
LSNDEFDAFSIYLYPSDYVLDNRPGVADYNDVQPFDANTNFDLTSSSNVLYRFNSTRGGI
IVPRGASVVGSDLRRTKFIPKYVPYPTVQGSLGITATNEPTASAIFNLTGGCYFWQASFF
DGDTNGVYYRGDDIATIAPNFSHHKLTCFEFANVQDLNLYYQKISKAYATIPDSSGVVAQ
DQLQARIEENRIVGPISDEFAISQIIRNGQTATAFTVDELGNPKNHGFSVGVAVNISGVN
GPTEQDKLLYNGSFLVTSAQGNQFTYQMSAEPSGNAIGSNILVKVEIDTVDSASPYVFNM
SLRSVWGINGMHADGSRATGFKSMVVAQFTGISLQKDDRAFVVYNPSSGNYEPQAAGSGA
HINGLAEYRKGWRHAHIKASNDAFIQVVSVFAVGFGDHFFADSGGDLSITNSNSNFGNTS
LRSKGFKGTAFTKDKAGQITHIIPPKSLDDVDEISINWVTIDINATRAEADNTRLYLYGY
TSELGRPPSKIQGYTIGARRDDVNTPDRIYVALVASGASEPTTHYADISPSGPDVTGTRA
GDDESPIKYDTNRGQWFLQVDNANNTIYTTLQANSIYQNLGFTPTTFIRRVPDARDLNDR
TYRFRYVLDKDAFPIPRPPITGFVLQPRSSETNSPAYSKTYYVYDVETFQEFVIGETDGI
YYLTVLSASVSPITSNFDDFFFSQQTVDIYPAFDRDNPVADPAASVSIADNEVLGLVRTT
DGASPTPNEDTQLSITKETAQFFLQELENNLGYTTTTNTLSNIVVTARLGDEEERMIPLQ
LNPDNSVAPLSIELRRYSILRASGHTFEYLGFGPGNYSTAFPSTQVEVLSPSQVRLSQSL
KEAAGVAYYSGVNSDGELFVGNQVINPVTGQITNEDIAQLNVLGEEGTTIETFSELVLTD
KLTVIGGASNQLESVFSGPVTFQKKVTSGNQIQSLNFTYSNDDGTVLRQTFLAEELAGLP
DLDSGLAFNSGDICYNIDWVPGQSLGWIYDAGTWYKFGLSDTTPITSNRFSGVTNYGIGM
APDAANRLKISGNTYFDGDIDVTGKYGCSDKYSLATGIANGNAGVTYNGDGVSQSFNISP
GHTAYSVLVFLNGVAQIPGVDYTVTGNAVDFSIATPPATGDTIHIRELVI
NT seq
3573 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcacttactcgtcttaaaaatatcattacgtcccgtacgggacgtattatctacgtc
aacccagacgacttcgatgcatcggacgcatatgataaccgaggtaactcggcattgcgt
ccgtttaagacgttgcaacgtgcctttcttgaagtggcacgtttctcatatcgtgttggt
ctgagtaatgacgaatttgacgcattctcgatctatctgtatccttctgactacgttctg
gataacagacctggggtagcagactataacgatgtgcaaccgtttgacgctaacactaat
tttgacctgaccagtagtagtaatgttctttataggtttaattcaactcgcggtggtatt
attgtccctcgtggtgcttctgttgttggttcggacctacgtcgaaccaagttcattcca
aaatatgtcccgtatcccacagtacagggtagtctcggtattactgctactaatgaacct
actgcttctgcgatctttaacctaactggtggttgctacttctggcaggcatcattcttt
gatggtgataccaatggtgtctactatcgtggtgatgatattgcaactattgctccaaac
ttctctcaccacaaactcacttgctttgagtttgctaacgtacaagatctgaacctgtac
tatcagaagatctcgaaagcatacgctacgattcctgactcctctggtgtggttgcacag
gaccagttgcaggcaagaatcgaagaaaacagaattgtgggtccgatttcggacgaattt
gccatctcgcagattatcagaaatggacaaactgctacggcgtttactgttgacgaactc
ggtaatccgaagaatcatggattctccgtgggtgtcgctgttaatatttctggcgttaat
ggtcctactgagcaggataaactcctctataatggatcgttcctggtaacatctgcccaa
ggtaatcagttcacctatcagatgtcggcagaaccgtcaggtaatgctatcggttccaac
atcctggtgaaagttgagattgacacagttgactctgcgtcaccatatgtgttcaacatg
tccctacgttctgtgtggggtatcaatggtatgcacgctgatggttcgcgtgctactggt
ttcaaatcgatggtggttgcacagttcacgggtatctctctgcaaaaagatgaccgtgcg
tttgtagtctataacccatcgtcgggcaactatgaaccacaagcagcaggttctggtgct
cacatcaacggtcttgcagagtatcgtaaggggtggagacatgctcacattaaagcaagt
aatgatgcgtttattcaggtggtgtccgtcttcgctgtgggattcggtgatcacttcttc
gctgatagtggtggtgacctctctattactaactcgaactccaatttcggtaatacatca
ctgagatcgaaaggattcaagggcactgctttcaccaaggataaggcaggtcagattaca
catatcatcccacccaagtctttggatgatgttgatgagatctcgatcaactgggtgact
attgatattaacgcaactcgtgcagaggcagacaatactcgtctgtatctgtatggatat
acttccgaactgggtagaccacccagcaagattcagggttacactattggcgcaagacgc
gatgatgtcaatactcccgatagaatctatgttgcacttgtcgcgtctggcgcgtctgaa
cccactacacactatgctgacatttcaccttctggtcctgatgtaactggcacaagagca
ggtgatgatgagagtccgatcaaatatgacaccaaccgtggtcagtggttcttgcaagta
gataacgctaacaatactatctacactacactgcaagcgaactctatctatcagaatctt
ggattcacgccgacaacattcattcgtcgtgtgcctgatgctcgtgacctgaatgacaga
acctatcgtttccgttatgttctggataaggatgcgttcccgattcctcgtcctccgatt
actggtttcgttctgcaacccagatcatctgagactaactcacctgcttactctaagact
tactacgtctatgacgtagagacattccaagagtttgtgattggtgaaactgatggtatt
tactacctgacagttctgtctgcgtcagtatctcccatcacatcaaactttgatgatttc
ttcttctctcaacagacagtagacatttatcctgcattcgacagagacaatcctgtcgct
gaccctgctgcatctgtgtctatcgcagacaatgaagttctgggtctggttagaactact
gatggtgcaagtcctactcctaatgaagacactcagttgtctattactaaggagaccgca
cagttcttcctgcaagagttggagaacaatcttggatataccaccacaaccaatactctg
tctaacattgttgtgacagcacgtttgggtgatgaagaggagagaatgattccgttgcag
ttaaatcctgacaactctgttgctcctctgagtattgaacttcgtcgttattcgattctt
cgtgcatctggtcacacgtttgagtatcttggtttcggtcctggtaactattcaactgca
ttcccatctacccaggttgaggttctctcaccctcgcaggttagattgtctcagtcactc
aaagaagcagcaggtgttgcatactactctggtgtgaactctgatggtgaactgttcgtt
ggtaaccaggtcatcaaccctgttacaggtcagatcactaacgaagatattgcacagttg
aacgttcttggtgaagagggtacaacgattgagacattctctgaactggtgcttaccgac
aaactaactgttatcggtggtgcatctaaccagttggaatctgtattctctggtcctgtg
actttccagaagaaggttacatctggtaatcagattcagtctctgaactttacctattct
aacgatgatggtactgtgttgagacaaacattccttgctgaggaacttgctggtctgcct
gatcttgattctggtcttgcatttaacagtggagacatctgttacaacattgattgggtt
cctggtcaatctcttggttggatctatgatgctggcacctggtataagtttggtctgagt
gatactactccgatcacatctaatagattcagtggtgttactaactacggtattggtatg
gcacctgatgccgctaatcgattgaagattagtggtaacacatactttgatggtgacatc
gatgttacgggcaagtatggttgctctgataaatactcattagcaactggtattgcaaat
ggcaatgcaggtgtaacatataatggagatggtgtatctcaatcattcaacatctctcct
ggacacacagcatattcggtattggtattccttaatggtgttgcacaaatccctggtgta
gactacacagtcacaggtaatgctgttgacttctctatcgctacacctcctgcaactggt
gacactatccatattcgtgaacttgttatctaa
DBGET
integrated database retrieval system