Viruses: 3283262
Help
Entry
3283262 CDS
T40000
Symbol
S, MHV-JHMgp05
Name
(RefSeq) Murine hepatitis virus strain JHM; spike glycoprotein
KO
K24325
Betacoronavirus (excluding SARS and MERS) spike glycoprotein
Virus
11144
Murine hepatitis virus strain JHM
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
CoV_S2
bCoV_S1_N
bCoV_S1_RBD
CoV_S1_C
CoV_S2_C
DUF2959
HSBP1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3283262
NCBI-ProteinID:
YP_209233
RS:
AC_000192
LinkDB
All DBs
Position
AC_000192:23940..28070
Genome browser
AA seq
1376 aa
AA seq
DB search
MLFVFILLLPSCLGYIGDFRCIQTVNYNGNNASAPSISTEAVDVSKGLGTYYVLDRVYLN
ATLLLTGYYPVDGSNYRNLALTGTNTLSLTWFKPPFLSEFNDGIFAKVQNLKTNTPTGAT
SYFPTIVIGSLFGNTSYTVVLEPYNNIIMASVCTYTICQLPYTPCKPNTNGNRVIGFWHT
DVKPPICLLKRNFTFNVNAPWLYFHFYQQGGTFYAYYADKPSATTFLFSVYIGDILTQYF
VLPFICTPTAGSTLLPLYWVTPLLKRQYLFNFNEKGVITSAVDCASSYISEIKCKTQSLL
PSTGVYDLSGYTVQPVGVVYRRVPNLPDCKIEEWLTAKSVPSPLNWERRTFQNCNFNLSS
LLRYVQAESLSCNNIDASKVYGMCFGSVSVDKFAIPRSRQIDLQIGNSGFLQTANYKIDT
AATSCQLYYSLPKNNVTINNYNPSSWNRRYGFNDAGVFGKSKHDVAYAQQCFTVRPSYCP
CAQPDIVSACTSQTKPMSAYCPTGTIHRECSLWNGPHLRSARVGSGTYTCECTCKPNPFD
TYDLRCGQIKTIVNVGDHCEGLGVLEDKCGNSDPHKGCSCANDSFIGWSHDTCLVNDRCQ
IFANILLNGINSGTTCSTDLQLPNTEVATGVCVRYDLYGITGQGVFKEVKADYYNSWQAL
LYDVNGNLNGFRDLTTNKTYTIRSCYSGRVSAAYHKEAPEPALLYRNINCSYVFTNNISR
EENPLNYFDSYLGCVVNADNRTDEALPNCDLRMGAGLCVDYSKSRRARRSVSTGYRLTTF
EPYMPMLVNDSVQSVGGLYEMQIPTNFTIGHHEEFIQIRAPKVTIDCAAFVCGDNAACRQ
QLVEYGSFCDNVNAILNEVNNLLDNMQLQVASALMQGVTISSRLPDGISGPIDDINFSPL
LGCIGSTCAEDGNGPSAIRGRSAIEDLLFDKVKLSDVGFVEAYNNCTGGQEVRDLLCVQS
FNGIKVLPPVLSESQISGYTAGATAAAMFPPWTAAAGVPFSLNVQYRINGLGVTMNVLSE
NQKMIASAFNNALGAIQEGFDATNSALGKIQSVVNANAEALNNLLNQLSNRFGAISASLQ
EILTRLDAVEAKAQIDRLINGRLTALNAYISKQLSDSTLIKFSAAQAIEKVNECVKSQTT
RINFCGNGNHILSLVQNAPYGLCFIHFSYVPTSFKTANVSPGLCISGDRGLAPKAGYFVQ
DNGEWKFTGSNYYYPEPITDKNSVVMISCAVNYTKAPEVFLNNSIPNLPDFKEELDKWFK
NQTSIAPDLSLDFEKLNVTFLDLTYEMNRIQDAIKKLNESYINLKEVGTYEMYVKWPWYV
WLLIGLAGVAVCVLLFFICCCTGCGSCCFRKCGSCCDEYGGHQDSIVIHNISAHED
NT seq
4131 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctgttcgtctttattttactattaccctcttgtttagggtatattggtgattttaga
tgtatccagaccgtgaattataacggcaataatgcttctgcgcctagcattagcaccgaa
gcagtcgatgtttccaaaggtctgggcacttactatgttttagatcgtgtttacttaaat
gccacgttattgcttactggttattatcctgtggacggttccaattatcggaatctcgcg
cttacaggcactaataccttaagccttacgtggtttaaaccaccctttctaagtgagttt
aatgatggtatatttgctaaggtccagaacctcaagacaaatacgccaacaggtgcaacc
tcatattttcccactatagttataggtagtttgtttggtaacacttcctataccgtagtt
ttagagccatataataatattataatggcttctgtttgtacatataccatttgtcaatta
ccttacacaccctgtaagcctaataccaatggtaatcgtgttattggattttggcacaca
gatgtcaaaccgccgatttgtcttttaaagcgtaattttacgtttaatgttaatgcccct
tggctttatttccatttttatcagcagggtggtactttttatgcgtactatgcggataaa
ccttccgctactacgtttttgtttagtgtgtatattggcgacattttaacacagtatttt
gtgttaccttttatttgtactccaacagctggtagcactttactgccgctctattgggtt
acacctttacttaagcgccaatatttgtttaattttaatgaaaagggtgtcattactagt
gctgttgattgcgccagcagctacattagtgaaataaaatgtaagacccaaagtctctta
ccgagtactggtgtctatgatctatccggttacacggtccaacctgttggagttgtgtac
cggcgtgttcctaacctacctgattgtaaaatagaggaatggctcactgctaaatctgtg
ccgtcacctctcaattgggagcgtaggactttccaaaattgtaattttaatttaagcagc
ctgctacgttatgtccaggctgagtctttgtcgtgtaataatattgatgcgtccaaagtg
tatggtatgtgctttggtagtgtctcagttgataagtttgctatcccccgaagccgtcaa
attgatttacaaattggcaactccggatttttgcaaacggctaattataagattgatacc
gctgccacatcatgtcagctgtattacagtcttcctaagaataatgttaccataaataac
tataacccctcgtcttggaataggaggtatggttttaatgatgctggtgtgtttggcaaa
agtaaacatgatgttgcctacgcccagcaatgttttactgtgcgacctagctattgtccg
tgtgcacaaccggacatagttagcgcttgcactagtcagaccaaacccatgtctgcttat
tgccccacaggcacaattcatcgtgagtgttctctttggaatgggccccatttgcgctcg
gcacgtgtaggttccggcacgtacacgtgtgagtgcacttgtaaacccaatccatttgat
acgtatgatctccgctgtgggcaaattaaaactattgttaatgtgggcgatcattgtgaa
ggtctgggtgttttagaagataaatgtggcaatagcgatccacataagggctgttcttgt
gccaatgattcttttatcggatggtcacatgacacttgtttagtaaatgatcgctgccaa
atttttgctaacatattgttaaatggcattaatagtgggactacgtgttccacagattta
caattgcctaatactgaagtggccactggcgtttgcgtcagatatgacctctatggtatt
actggtcaaggtgtttttaaagaggtcaaggctgactattataatagctggcaggcccta
ttatatgatgttaatggtaacttaaacgggttccgtgaccttaccactaacaagacttat
acgataaggagctgttatagtggccgtgtttctgctgcatatcataaagaagcacccgaa
ccggctctgctctatcgtaatataaattgtagttatgtttttactaataatatttcccgt
gaggaaaacccccttaactattttgatagttatttgggttgtgttgttaatgctgataac
cgcacggatgaggcgcttcctaattgcgatctccgtatgggtgctggactatgcgtagat
tattcaaagtcacgcagagcccgccgatcagtttctactggctatcgattaaccacattc
gagccatacatgccgatgttagtcaatgatagcgttcaatccgtaggtggattatatgag
atgcaaataccaaccaattttactattggtcatcatgaggaattcatccagataagggct
cccaaggtgactatagattgtgctgcatttgtttgtggtgataacgctgcatgcagacag
cagttggttgagtatggctctttttgtgataatgttaatgccattcttaatgaggttaat
aacctcttggataatatgcaattacaagttgctagtgcattaatgcagggtgttactata
agttcgaggctgccagatggcatctccggccctatagatgacattaatttcagtcctcta
cttggatgcataggttcaacatgtgctgaagacggcaatggacctagtgcgatacggggg
cgttcagctatagaggatttattatttgacaaggtcaaactatctgacgttggctttgtc
gaggcttataacaattgcactggtggtcaagaagttcgcgacctcctttgcgtacagtct
tttaatggcatcaaagtattacctcccgtgttgtctgagagtcaaatctctggctacaca
gcgggtgctactgcggcagctatgttcccaccttggactgcagctgctggtgtgccattc
agtttaaatgttcaatataggattaatggtttaggtgtcactatgaatgttcttagtgag
aaccaaaagatgattgctagtgcttttaacaacgcgctcggtgctattcaggaagggttc
gatgcaaccaattctgctctaggtaagatccagtccgttgttaatgcaaacgctgaagca
cttaataatttattaaaccaactttctaataggtttggtgctattagtgcttctttacaa
gaaattctaacgcggcttgacgctgtagaagcaaaggcccagatagatcgtcttattaat
ggcaggttaactgcacttaatgcgtatatatccaagcaactcagtgatagtacgcttatt
aaatttagtgctgctcaggccatcgaaaaggtcaatgagtgcgttaagagccaaactacg
cgcattaatttctgtggcaatggtaatcacatattatcacttgtccagaatgcgccttat
ggcttatgttttattcatttcagctacgtgccaacatcctttaaaacggcaaatgtgagt
cctggactatgcatttctggtgatagaggattggcacctaaagctggatattttgttcaa
gataatggagagtggaagttcacaggcagtaattattactaccctgaacccattacagat
aaaaatagtgttgtcatgatcagttgcgctgtgaattacacaaaagcgcctgaagttttc
ttgaacaactcaataccaaatctacccgactttaaggaggagttagataaatggtttaag
aatcagacgtctattgcgcctgatttatccctcgatttcgagaagttaaatgttactttc
ctggacctgacttatgagatgaacaggattcaggatgcaattaagaagttaaatgagagc
tacatcaacctcaaggaagttggcacatatgaaatgtatgtgaaatggccttggtatgtt
tggttgctaattggtttagctggtgtagccgtttgtgtgttattattctttatatgttgc
tgcacaggttgcggctcatgttgttttagaaaatgcggaagttgttgtgatgagtatgga
ggacaccaggacagtattgtgatacataatatttcagcccatgaggattga
DBGET
integrated database retrieval system
