Viruses: 3294198
Help
Entry
3294198 CDS
T40000
Symbol
PSSM2_295
Name
(RefSeq) Prochlorococcus phage P-SSM2; tail fiber protein
Virus
268746
Prochlorococcus phage P-SSM2
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Other DBs
NCBI-GeneID:
3294198
NCBI-ProteinID:
YP_214526
RS:
NC_006883
UniProt:
Q58M60
LinkDB
All DBs
Position
NC_006883:217085..220597
Genome browser
AA seq
1170 aa
AA seq
DB search
MTRFRSGRVPHQHIGISSFTEDKLVLDVIGNATISGTLSVGVGTNNSGNGNISIGGTTGT
IGQYLKSTGVGVTWADFADVRDSQSFVATAGQTTFVFTANELNQYNPNFIDVYVNGVKLI
NSEYDAFNGSNVVLKSACFAGDIVELISYNTNQITNGMGGSTIGINTFATSTFTHIGASG
VVTATTYYGDGSNLTGVTTSLRSEYADVSGISTISQGLTGTPDIAVRNINVGIATFTGNL
DAVDASFSGNVSIGGTLTYEDVTNIDSVGLITARNGIDVTGPIKGFSYTQSPYSNTVETI
IVKVVTKTAAHRYNGNGSSLGYTFDGVESPFLTLTPGKTYRFDQSDNSNLTHQLRFYLDP
EKVVEYLRTPGEIVYSGAAGSNGSYTEIQILDDTPTVLYYQCVNHSYMGNAVQVNTGHAI
GFATAASIDTSGIITAFRYYGDGTYLSGVQSQLVIQEEGGAVGTAGTINFVGVGVTASVT
DDIATIQVGNHFAVTAGIATVAEGITGSPNASFSGITATGLQMTGLCTAGTFVGNLVGGV
AGGNWGGYDSTATNNVSAGQNVSAGQSVTAGNGFYGDGSGITNLVTTSDTAPSNPTDGNL
WWKSDEGQLKIYYQDADSAQWVDANASGGAGSSGGSSDLLNDTTPQLGGTLDLNNRDITG
TGNISINGGLTLIGGTSNIGNVYSTGIVTASTFYGNIVGDLSGTSTGNVTGTVNATGLST
FTTLDINGDVNVSGASTITGALDVTDSVDAHSINVSTAVTAISFHGDGQYLTNIYSAPPQ
GISTTGYTGLTNLFCGGYLEVDGQSILDDVIVSAAATFQGALSANTGPVTLNNATINGTT
NVTGPSTLTTVNVVGHSELDNVNISGVATAIGFVGPLTGNAATASNLSGSPSISVTNVSA
GIITATNGYYGNVNVNNQNIEVGNCTTQGTDNTIKVGSSALEIFHRPAAYATYLQNKADT
NLFITGNDATGTWGNIFIRPYLSNFSGVACWWGGATELFYGNNNTKRLETTSGGVNIIGT
LSKSGGSFKIPHPVSGLSTTKHLVHSFLEGPQMDLIYRGKVDLVGGTATVNIDTKAGMTE
GTFVLLNRDVQCFTTNETGWTAVKGSVTGNEITIVAQDNSCTDTISWMVVGERQDDTVKA
LDMTDSEGNLIVEPDQPAADTKHADVQAQL
NT seq
3513 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaaggtttagaagcggaagagtcccccatcaacatatcggtattagttcttttacc
gaagataagcttgtccttgatgtaataggtaatgccacgattagtggtactttaagtgtt
ggtgttggaactaataatagtggtaatggtaatattagtattggtggaactactggaaca
ataggtcagtatttaaaatccactggtgttggagttacttgggctgattttgctgatgta
agagattctcaatcctttgttgcaactgcaggacaaacaacatttgtatttactgcaaat
gaacttaatcaatataatccaaattttattgatgtatatgttaatggtgttaaattaatt
aatagtgaatatgatgcatttaatggatctaatgtagttttaaaatctgcgtgttttgct
ggagatattgttgagttaatttcttataatacaaatcaaattactaatggtatgggtgga
agtaccattggtattaacacctttgctacatcaacctttactcatataggtgcaagtggg
gttgtaactgctacaacttattatggtgatggatctaatttaacaggagtaacaacttct
ttacgttctgagtatgctgatgtatctggcatttcaactatctctcaagggttaactgga
acacctgatattgcagtaagaaatattaatgttggtattgcaacttttactgggaacctt
gatgctgttgatgcttcctttagtggaaatgtatctatcggtggaacattaacatacgaa
gatgtaacaaatatagattcagttggacttataactgctagaaatggtatagatgtaact
ggtcctataaaggggtttagttatactcaatcaccatatagtaatactgtagaaacaata
atagtaaaagtagtaactaaaactgcagcacaccgatataatggtaatggtagttcactt
ggatatacttttgatggtgtcgaatctcctttcctcacgttaacacctggtaaaacttat
agatttgatcaatcagataattcaaaccttacacatcaattaagattttatttagatcct
gagaaggtagtagaatatcttagaactcctggtgagattgtttatagtggagcagcaggt
tctaatggttcttatactgaaattcaaatacttgatgataccccaacggtcttatattat
caatgcgtaaaccattcttatatgggtaatgcggttcaggttaatactggacacgctatt
ggatttgcaacagcagcatctatagacacatctggtattataactgcatttagatattat
ggtgatggaacatatctaagtggagtacaatctcaacttgtaatacaagaagagggtggt
gctgtaggtactgctggaacaattaattttgttggtgttggtgtaacagcatcggttact
gatgatattgcaacaattcaagttggtaatcattttgctgttactgctggtattgctact
gttgctgaagggataacaggatctccaaatgcttcattctctggtataactgcaacagga
ttgcagatgactggattatgtactgctggtacttttgttggtaacttagttggtggtgtt
gctggtggtaattggggtggatatgattcaactgctactaataatgtaagtgctggtcaa
aatgtaagtgctggtcaatcagtaacagcaggaaatggattctatggtgatggttctggt
ataacaaatcttgttacaacctcagataccgcaccaagtaatcctactgatggtaatctt
tggtggaaatctgatgaaggtcaattaaaaatatattatcaagatgctgatagtgctcaa
tgggtagatgcaaatgctagtggtggagctggttcttctggtggatctagcgatctatta
aatgacacaacaccacagttgggaggaacactagatcttaataaccgtgatattactgga
actggtaatatatccattaatggaggtttaactttaattggtggtacaagtaatataggt
aatgtatactcgactggtattgtaactgcttcaactttctatggaaacattgtaggtgat
cttagtggtacttctactggtaatgtaactggaactgttaatgctactggattatctact
tttactacccttgacataaatggtgatgttaatgttagtggtgcatctactataactggt
gctcttgatgtaactgatagtgttgatgcacatagtataaatgtttctacagcagtaacg
gcaatatcattccacggtgatggacaatatttaactaacatatattctgcacctccacaa
ggtattagtacaactggatatactggattaacaaatttattctgtggtggatacttagag
gtagatggtcaatctatccttgatgatgttattgtatctgctgctgcaactttccaaggt
gctttaagtgctaatacaggaccagttactcttaacaatgcaactattaatggtactaca
aatgtaactggtccatctacgcttacaactgttaatgtggttggtcattcagaattagat
aatgtaaatatttctggtgttgctactgctataggttttgttggacctttgactggtaat
gctgctactgcttctaatttaagtggatccccaagtattagtgttacgaatgtatctgct
ggaattataactgcaactaacggttattatggaaatgtaaatgttaataatcaaaatatt
gaagttggtaattgtaccactcaaggaaccgataatactataaaggtaggatctagtgca
ttagaaattttccatagacctgctgcatatgcaacttatcttcaaaataaagcagataca
aacctctttataactggtaatgatgctactggaacttggggtaatatattcattagacct
tatctaagtaactttagtggagttgcttgttggtggggcggtgctacagaattattctat
ggtaataataacactaagagattggagacgacttctggtggtgttaatattattggaacc
ctgagtaagagtggtggatcgtttaagattcctcatccagtatcaggattatctaccact
aagcacttagttcattctttccttgaaggtccacaaatggatcttatctatcgtggtaag
gttgatttggttggtggtactgctacagttaatattgataccaaggctggtatgactgaa
gggacatttgttttattaaatagagatgttcaatgttttactacaaatgaaactgggtgg
acagcagtgaagggttctgtaactggtaatgagattactatagttgcacaagataatagt
tgtactgatactatttcttggatggttgttggtgaaagacaagatgatactgttaaggca
ttagatatgactgatagtgagggtaacttaattgttgaaccagatcaaccagcagcagac
acaaaacatgctgatgttcaagcacagttatag
DBGET
integrated database retrieval system