Viruses: 3294385
Help
Entry
3294385 CDS
T40000
Symbol
PSSM2_033
Name
(RefSeq) Prochlorococcus phage P-SSM2; tail fiber protein
Virus
268746
Prochlorococcus phage P-SSM2
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Peptidase_S74
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3294385
NCBI-ProteinID:
YP_214265
RS:
NC_006883
UniProt:
Q58MX1
LinkDB
All DBs
Position
NC_006883:28537..34263
Genome browser
AA seq
1908 aa
AA seq
DB search
MPLNKLENFIKNSEGRILYVNPNDLDATDGIENQGNSLTKPFKTLQRALIESARFSYLRG
NDNDLVEKTTILLFPGEHLIDNRPGFGIKSVSGTATAISPSSAESGAQNTLTLTLNSNFD
LTQEDNILYKFNSTEGGVIVPRGTSIVGLDLRKTKVRPKYVPNPTDDNVKSTAIFRVTGA
CYFWQFSIFDGDESTTVYTDPTNFSSSNRSKPVFSHHKVTCFAYADGVNKLDQFDGLTDL
DVYYSKLSNAYNRASIRDIDEKYPATPGGFSKQRPEYEIVGAFNSDRLQVTSIISGDGAT
PGQVVTVTTSVPHELTGGTPIKIEGVNELTYNISTKVSSVLSDTQFTYLLPYVPPNLKAG
PAGGLSAGSAEVSVEVDTVTGASPYIFNCSLRSVYGMQGMNADGAKATGFRSMVVAQFTG
ISLQKDDRAFVKYNKNSRSYDGISYQRQTGELLSSESSSLNAATVYHLDKDAVYRDGWKT
AHITIQNDAILQIVSVFAIGYHIHFLGKSGGDASITNSNSNFGQFALAADGFKKESFDKD
NKGFISAIIAPKAVVSTEANIELNQLDTSVHTAYKTADTSTNKILSRSKLFLLGQTNENL
VPSEIAQGYRIGARVGEKFYIDLANGTKVQATICMSNKEIVGGNASTVTSSVQVTSEKEY
EGTHNDTTQGSASIEHKIVLNNLRSIGAKHDLNNGESIRIIAEDADLPEGLDPHRIYYAI
TNEKNSSRQDGISLDDYTIQIASSKTNADRTTPQYIKTVSNPAAGKLKIISRVSDKKPGD
LGHPMQFDSTVTVQLEGGGTSTGNWFIHVDGTSDNTAATYNTVWDNFANLDADDEDIPYI
QRLNDSRSLDDKLYKFRYVIPKELENARDPNDSFIIQDSSSTNVRALADFTRTSLEAKDY
DFNRNTRFISYLDYNSTTKIVTIRSDKSHNLNAGEQIILKNIICTVNASGAADKGYNGTF
LVNSIINDKVFTYKTTDILGNVHNVGTYGNDTHTRTLSLPRFERNNNQENLFIYRTETIL
PYVEGAQDGVYHMYVLNGSNTIEEEFAAGKYNQNVVNLYPELDRDNVNDNPQEASSYAKR
FPIGDVVTNDLKKSITRETANKLINSFGVANTISDVTDNTTSAVLTLTREHDLGGLKYGG
TLAGGGGHTDGTYYNVKLFDDASAPASAVWKGATAKVVVSGGAVTEYEITEPGSAYKSTL
SPLYFDSSLVAQGGIGGAPSSNIAITDANISLANSGYVQVTGISTGTDQYFRVNDATDIN
KININKTASETILNGQTVVSVGPIVEVSTSSGTDTTTFNCSTAHGLLKGNRFRVLNASDA
NLGDFIVTEVVDVDSFTALTPGGLTSPKYILKHGLSANDGNSGKQGESLGVRGVAFYDNE
SLVLNDTITSVTDEIKVTLPGGGTTAASIQARFPLGSFIQVDSEIMRVVDETIGSGTTLK
VIRGALGTIVDNHVLNSQIKKIKPLSVELRRPSILRASGHTFEYLGYGPGNYSTGLPQVQ
LKSLTEREEFLSQSQETSCGTVVYTGMNDKGDFYIGNTKISSDSGEQITFDIPIPTVTGE
DPSTLSVVFDEVIIKDRLLVEGGSSNTILSQFNGPVTFNGNVRFNKDLKVATNLTVDGIV
KFNNETVASSTCGVTPTGSLVVKGGVSIGDKVSATGAVSLNVLDGIVRICENAASTSSTT
GALIVGGGVGIAGQLSLGGVLDVTGSINAGGGLHLPDNVKLTAGGTTSGPYFSIEHDVVG
GVRNNIIKDESLSNIYLRSDANIEIGNKDGTEQGLIYTAGAGIKLRHGTTLRFETNTSGA
KVHGALEVTDDITAYSTSDARLKNDVKPIQDSLAKVNSISGNTFTWNEASKKEGQEDTGV
IAQEISAIGLPGTVTIREDGTYAVDYEKLVPLLLEAIKELSNKVDTLS
NT seq
5727 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccacttaataagttagagaatttcataaagaatagtgagggtcgcattctttatgtt
aatccaaatgatcttgatgccactgatggaatagaaaatcagggtaactcattaacaaaa
ccatttaagaccttacaaagagcacttatcgaatccgctagattttcatatctaagggga
aatgataatgatttagtagagaagacaacaatattactgtttccaggtgaacacttaata
gataaccgtccaggttttggtataaaaagtgttagtggaactgctactgctattagtcca
agtagtgcagaatcaggtgctcaaaatacacttacattaactcttaattctaactttgat
ttaacgcaagaagataatatactttataagttcaatagtactgaaggtggtgttatagtt
cctagaggaacttctattgttggattagacctaagaaaaacaaaggttcgtcctaagtat
gttccaaatcctactgatgataatgtaaaatctactgctatctttagggttactggtgct
tgttatttctggcagttctctatttttgatggggatgaatctacaacagtatatacagac
cctactaactttagtagtagtaacagatcaaaaccagtattctctcatcataaggtaact
tgctttgcgtatgctgatggtgttaataagttagatcaatttgatggattgactgatcta
gatgtctattatagtaaattatcaaatgcatataatagagcatcgattagagatattgat
gaaaagtatcctgctactccaggtggattttcaaagcaaagacctgagtatgaaatagtt
ggtgcatttaattctgatagacttcaagttacaagtattatttcaggtgatggtgcaaca
ccaggtcaggttgttactgtaactacatctgttcctcatgaactgactggtggcacacca
attaagattgaaggtgtaaatgaattaacttataatatttcaactaaagttagtagtgtt
ttaagtgatactcaatttacatatttacttccatatgttccacctaatctaaaagctggt
cctgctggtggattaagtgctggtagtgcagaagtaagtgtagaagttgatactgttact
ggtgcatctccttatatctttaactgttcattaagatcagtttatggtatgcagggtatg
aacgctgatggtgctaaggcaactggatttagatctatggttgttgctcagtttactggt
atatcactacagaaagatgatcgtgcatttgtaaaatataataagaatagtagatcttat
gatggtattagttatcagagacaaactggtgaattgctatcatcagaatcatcatcttta
aatgctgctactgtctatcacttagataaagatgctgtttatagggatgggtggaagaca
gcacatattacaattcagaatgatgcaatcttacagattgtttctgtgttcgctattggt
tatcatattcatttcttaggtaaatctggtggtgacgcatcgattacaaactctaactct
aacttcggtcagtttgctcttgctgctgatggatttaagaaagaatcctttgataaagat
aataaaggatttatatctgctattatcgcacctaaagcagttgtcagtacagaggctaat
attgagttgaatcagcttgatacttccgttcatactgcatataaaactgctgatacttca
acaaataagattcttagtagaagtaagttattcttattaggtcaaactaatgagaactta
gtaccatctgaaattgcacagggatatagaatcggtgcgagagttggtgagaagttttat
atagatttagcaaatggaactaaggttcaggctaccatttgtatgtccaataaggaaatt
gttggtggcaatgcttcaacagtaacttcatctgtacaagttacttcagagaaggagtat
gaaggtactcataatgatactactcaaggaagtgcatctatagaacataagatagttctt
aataatttacgctctattggtgctaaacatgatcttaataatggtgagtctataagaatt
attgctgaagatgctgacttaccagaaggtttagatcctcatagaatttattatgcgatt
actaatgagaaaaactcttcaagacaagatggtattagtttagatgattatacaatccag
attgcatcatcaaaaactaacgctgatagaactacaccacaatatattaagactgtttct
aatcctgctgctggtaaattaaaaattattagtagagtttctgataaaaaaccaggtgac
ttaggacacccaatgcagtttgattctacagtaacagttcaactagaaggtggtggtact
tcaacaggtaactggtttattcatgttgatggtacttctgataatactgctgcaacttat
aatactgtatgggataattttgctaatctagatgctgatgatgaggatattccttacatc
caaagattaaatgatagtagaagtttagatgataaactctataagtttagatatgtaatt
ccaaaagaattagaaaatgctagagaccctaacgatagtttcatcattcaagattctagt
tctactaatgtaagagcattagcagattttactagaacctctctagaggcaaaagattat
gattttaataggaatacacgatttatttcttatcttgattacaatagtactactaagata
gttactattagatctgataagtcacataacttaaatgctggtgaacaaattatccttaag
aatataatttgtactgttaatgctagtggtgcagcagataaaggatataatggaacattc
ttagttaatagtattattaacgataaagtttttacctataagacaactgatattttaggt
aatgttcataatgtaggaacttatggtaatgatacccatactaggactctttcattacct
agatttgagaggaataataaccaagaaaacttattcatctatagaaccgaaacaatttta
ccgtatgttgagggagcacaagacggtgtttaccatatgtacgttctgaatggtagtaat
actatagaagaagaatttgctgctggtaagtacaatcaaaatgttgttaatctttatcca
gaattagatcgagataatgtaaatgacaatccacaggaagcatctagttacgctaagaga
ttccctattggtgatgtagttactaatgatcttaagaagagtatcactagagaaactgcc
aataaactaattaatagttttggtgttgcaaatacaattagtgatgtaactgataatact
acttctgctgttctaacacttacaagagaacatgatctcggtggtttgaagtatggtgga
acattagcaggtggaggtggacatactgatggaacttactataacgtaaaattatttgat
gatgcttctgctcctgcttctgctgtatggaaaggtgctactgctaaagttgttgttagt
ggtggagcagttaccgagtatgagataactgaaccaggatcagcatataagagtacatta
tccccactatactttgactcttcattagtagctcaaggtggtattggtggagctcctagt
tctaatattgctattactgatgcaaacattagtttagcaaatagcggatatgttcaagta
actggtattagtacaggaacagatcaatacttcagggttaatgatgctacggatattaat
aaaatcaatattaataagactgcaagtgaaacaattctgaatggtcaaactgttgttagt
gtaggacctattgttgaagttagtacttctagtggaactgatacaactacatttaattgt
agtacagcacacggattacttaaaggaaatcgtttcagagtattaaatgcttctgatgct
aatcttggagactttattgttactgaagttgtggatgtagatagttttactgcattaact
ccaggtggattaacatctcctaagtatattcttaagcatggattatctgctaatgatggt
aactctggtaagcaaggtgaaagtttaggagtaagaggagttgctttctatgataatgaa
tctctagttctgaatgatactattacttcagttacggatgaaattaaagttactctacct
ggtggaggtacgactgctgcatctattcaggcaagattcccattaggttcattcattcaa
gttgatagtgaaataatgagagttgttgatgaaactattggtagtggaacaacacttaaa
gttattcgtggtgcattaggtactattgttgataaccacgttcttaattctcagattaag
aagattaaacctctttctgttgaactaagaagaccatctattctaagagcatctggtcat
acatttgaataccttggttatggtccaggtaactactcaactggtttacctcaagttcaa
cttaaatctctaactgagagagaagagttcttatcacaatcacaagaaacttcttgtggt
actgttgtttacacaggtatgaatgataagggtgatttctatattggaaacactaagatt
tcatctgactctggtgaacagataacatttgatattccaattccaactgtaacaggtgaa
gatccaagtacgcttagtgttgtatttgatgaagtaatcattaaagatagactacttgtt
gagggtggaagttctaatacaattctatctcagtttaatggacctgtaacattcaacggt
aatgtaagattcaacaaggatcttaaagttgcaaccaacttaactgttgatggtatagtt
aaatttaataatgaaacagtagcatcatctacttgtggtgtgactcctacaggatcatta
gtggttaaaggtggagtttctattggtgataaggtaagtgctactggtgcagtatcctta
aatgtactagatggtattgttagaatttgtgaaaatgctgcatcaactagttctactaca
ggtgctttaatagttggtggtggtgttggtattgctggtcaactttctcttggtggtgtt
ttagatgttactggcagcataaatgctggtggtggtttacatttacctgataatgttaaa
ttaactgctggtggaactacttctggaccatatttctctattgaacatgatgttgttggt
ggtgttcgcaataatattattaaagatgaatcactctctaacatatacttgcgaagtgat
gcgaatattgaaataggtaataaggatggcacagagcaaggtttaatttatactgctgga
gcaggtattaaattacgtcatggcactaccttaaggtttgagactaatacttctggtgct
aaagttcatggtgctttagaagtaactgatgatattactgcatactcaacttctgatgca
agattgaagaatgatgttaaaccaatacaagattctcttgctaaggttaattcaatttca
ggtaatacctttacttggaatgaggcatctaagaaagagggacaggaagatactggtgtg
atcgcacaagaaatttctgctatcggattacctggcacagtaaccatcagagaagatgga
acctatgctgttgattatgagaagttagttccacttctattggaagcaatcaaggaatta
tctaataaggttgatactttatcataa
DBGET
integrated database retrieval system
