Viruses: 3294482
Help
Entry
3294482 CDS
T40000
Symbol
PSSM2_019
Name
(RefSeq) Prochlorococcus phage P-SSM2; baseplate hub subunit and tail lysozyme
Virus
268746
Prochlorococcus phage P-SSM2
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
OmpH
Gp5_OB
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3294482
NCBI-ProteinID:
YP_214251
RS:
NC_006883
UniProt:
Q58MY5
LinkDB
All DBs
Position
NC_006883:11784..14042
Genome browser
AA seq
752 aa
AA seq
DB search
MIEESILKSNFVGRDGFKWWIGQIGPEDCQGDQINQTGDAWGNRIKVRIMGYHPQDPIEL
PDKDLPWAQILLPATAGSGGAGVYRSTRLTPGDSVFGFFLDGDDAQLPVILGIFGRPSSP
TPLGPYTRPFVPYTGYTKENPPSAYFLNKEIGAQEGAKSTPLPIDLPKDIADKVNTAKLS
QLVGKLGEELGEIEFDKEKIKSSFTALGSIIDTPTVSSMIPTMKLASRQMKTEMKNMQKD
LKILTDSIDKDAIKAQFADVLGGIDTDAFKAKSKELQGIVKLKIKERTANAKEQIKSLGG
GMAKDMMGKLQTEVAKNANKGIKKTYNKVFGAVFAATKSRGKAKQAGIAAQAAFIKPLKS
FHEGIPCVMQNVLGGLGDAIDGIIDQLVDNVTNFTDCIMDQAIGGMMNSVIGGLTKGIMP
SLGGISKILGGFSPGDFLRGKAENLQAIASMFDCLPQSKLDSEEVQQYIIGGGAAQSFDS
LVDNILSVANTADSLTDGLLDAVQGLNIGGISGSLGVFDFMNPSVSVPGFKSPLGKCYSG
PPLGCAGVKLNIFGGGGVGASARAIFGDVIGSGVEAVGSIIGVDLKSGGSGYNAAPFIEI
VDTCNKGYGAVARTVIDPDPESPTYQQVVDVIILTPGENYPVKNEDGEKNEPVIVDHVTV
ITPGEDYDKDDKVIDSDGNEYTTFIDDFGRIVNVVAPDSTIINVKEVTEFPELTVVSKDG
LPSTGFGAILRAQLKPRPPYQGEVKQVIDCIG
NT seq
2259 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatagaagaatcaatattaaaaagtaattttgtaggaagggatggatttaagtggtgg
atcggtcagattggacctgaagattgtcaaggtgatcagatcaatcaaactggtgatgca
tggggaaataggattaaagtaaggattatgggttatcatccccaagatccaattgaattg
cctgataaggatttaccttgggctcagattttattaccagcaaccgcaggatctggtggt
gcaggtgtatatcgatcaactagactaacaccaggagatagtgtatttggtttcttcctt
gatggtgatgatgcacaattacctgtaatattaggaatatttggtagaccttcaagtcca
actccacttggtccttatacacgtccatttgtaccttatactggatatacgaaagaaaat
ccaccaagtgcttatttcttaaataaggaaattggtgctcaagagggtgctaaatctaca
ccattacctattgatttacctaaagatattgcagataaggtaaacacggctaaacttagt
caattagttggtaagttgggtgaggaactaggtgaaattgaatttgataaggaaaagata
aaatcttcttttactgctttgggtagtataattgatactcctacggtatcttctatgata
ccaactatgaaacttgccagtaggcaaatgaagactgaaatgaaaaatatgcagaaggat
ttaaaaatattaacagattcgattgataaggatgcgattaaagctcagtttgctgatgtt
cttggtggaattgatactgatgcattcaaagcaaaatcaaaagaacttcaaggtatagta
aaattaaaaataaaagagagaactgcgaatgcgaaggagcaaataaaatctttaggtggt
ggaatggctaaagatatgatgggtaaattgcaaactgaagttgctaagaatgctaataaa
ggaataaagaaaacatataataaggtatttggtgctgtttttgcagcaactaagagtaga
ggtaaagcaaaacaagctggtatagcagcacaagcagcatttattaaaccacttaagtcc
tttcatgaaggtattccttgtgtaatgcagaatgttttaggtggtcttggagatgctatc
gatggaataattgatcagttagtagataatgtgactaattttactgattgtattatggat
caggcgattggtggtatgatgaatagtgtgattggaggtcttacaaaaggtattatgcca
tctttaggtgggatatctaaaattttaggtggatttagtcctggtgatttcctcagaggt
aaagcagagaatttacaggcaattgcaagtatgtttgattgtttaccacaatcaaaatta
gactctgaagaagttcaacagtatattattggtggaggagcagcacagtcatttgattct
cttgtagataatatattatctgtagcaaatacagcagattctttaactgacggattgctt
gatgctgttcaaggattaaatattggaggtatatctggtagtttaggtgtatttgacttt
atgaatccaagcgtatctgttcctggatttaagagtccacttggaaaatgttatagtgga
cctccattaggatgtgctggtgttaaacttaatatatttggtggcggtggtgtaggtgct
agtgctagagcgatatttggtgacgtaattggttctggtgtagaagcagttggtagtata
attggtgtagatttaaagagtggtggatctggttataatgcagcaccttttattgagatt
gttgatacttgtaataagggatatggtgctgttgctagaacagtaatagatcccgatcct
gaatcaccgacttatcagcaagtagttgatgttattattcttactccaggtgagaattat
ccagttaaaaatgaggatggtgaaaagaatgaacctgttatagttgatcatgtaactgtt
attactcctggtgaagattatgataaggatgataaggtaattgattctgatggtaatgaa
tatactacgtttatagatgactttggtagaattgttaatgtggttgcaccagatagtact
ataattaatgttaaagaagtaactgagttccctgaacttacagtggtatctaaagatggt
ttaccatctactggttttggagcaatactaagagcacagttgaaaccaagacctccatat
caaggagaagtcaagcaagttatcgactgtattggttga
DBGET
integrated database retrieval system
