Viruses: 3294541
Help
Entry
3294541 CDS
T40000
Symbol
PSSM4_027
Name
(RefSeq) Prochlorococcus phage P-SSM4; tail fiber protein
Virus
268747
Prochlorococcus phage P-SSM4
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Other DBs
NCBI-GeneID:
3294541
NCBI-ProteinID:
YP_214588
RS:
NC_006884
UniProt:
Q58LS1
LinkDB
All DBs
Position
NC_006884:23611..27567
Genome browser
AA seq
1318 aa
AA seq
DB search
MSLTRLKNIITSRTGRIIYVNPDDFDASDAIDNRGNSALRPFKSLQRAFLEVARFSYRVG
LSNDEFDAFSIMLYPAEYVVDNRPGDVLYTNVAPIDANSNLDLTSPNNVLYKYNSVEGGI
IVPRGCSVVGTDLRRTKIIPKYVPYPTTYPAQGINTEAQVPPRTAIFKVTGGTYFWQFSF
FDGAEEGVYFKPDSVTTLAPKFSHHRLTCFEFADGLNPLSTLIANGTVPNADYSAVSNIL
ARTDLEIYYQKVSKAFATIPDTSGDPSTDQIQARVEENRIVGPISDEYRVLQITRNGQTA
TAVTVDEFDDPRDHGFSVGVNINVSGVTGSTGSQSEADAGLYNGSFTVTSASGNVFTYQM
QGEPTGNAVGSNIAVKTEIDTVDSASPYAFNLSLRSVWGMNGMHANGAKATGFKSMVVAQ
FTGLSLQKDDRAFVRYNASTGNYDVATAGDGAHLDGFAEYRKGWGHEHIKCSNDSFIQAV
SVFAVGYQGHFTALSGGDMSITNSNSNFGNTALRSAGFKAKAFSKDKAGALTHIIPPKAL
NVISTTATGASGTNTITLANDGSVNGVIQGMTITGTNIGVGATVGNINVSTRVLTLTASN
TGAVNGNVIFGEETSINWVNIDIQRTKTINASLAGQGGTPGTRLYLYGYTVEASPPTTRV
QGFAVGARQDGTGASAIADKINCLLVAQGATDASVQSASISPYGPSVSGLAAGVVGSPLQ
YDANTYTISGVAGSVGGWYLSVSSVNNEIYTTLSTNTTYNTVNFTPTTFLKRIPDPRDLQ
DRTYRVRYVIDKDKTNPLPRDPLSGYVMQPLNSDTTSFNLQRCFYIYDIEVVQPFVRGTD
DGIYYITLLCGSISPTTSNFDDRKFSQNVNEVYPTFDRDNPIADPAAATSVADNVTIGLV
NATDGASPPVKDPKLSITKESTVFLLTDTGWTQPGTTPNYDSVNKRLSNVELTARAGDEE
VRKINIRENNDGTVAPINVEFRRHSILRSGNHTFEYLGFGPGNYSTAFPQTQVETLTQEQ
IRFSQSIKEEGGVSFYSGLNSNGDLFIGNQVINPVTGQITNEDVAQLNVVGEESTTIETF
SELVLTDKITVIGGASNQLESIFAGPVTFQGQSTFTNNISAKKLTYFNQDGTVIKQTLLA
PENASGLPDFSNITGYDTPADGDIVYNINWTPGKSLGWIYYGGAFKEFGLTDTGDINIST
TGNGHIGLGEAPDTTYRVRINGSVRIDGDVVGTGRGVVGSDKYITKSYTGDGNTLTFAVT
TYGGGIKHSDDSLLVFLNGVAQIAGTNYTVDTNGANVVFSSGDAPLSTDTVHILELPI
NT seq
3957 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcactaacgagactcaagaatattattacgtccagaactggacgtatcatatatgtc
aacccagacgatttcgatgcatctgatgcgattgacaacaggggtaactctgcattgcgt
ccgtttaaaagtttacagagagcatttttagaagtagcaagattttcatatagagttggt
ttaagtaatgacgagtttgatgcttttagtatcatgctctaccctgctgagtatgtcgta
gacaatagaccaggcgatgttttatatacaaacgttgcacctattgatgcaaactcaaac
ctagacttaacttctcctaacaatgttctctacaaatataactcagtcgaaggtggtatt
attgtacctagaggttgttctgttgttggtacagacctcagaagaactaaaataattcca
aaatacgttccatatcccactacatatccagctcaaggtattaatacggaagctcaggtt
ccaccaagaacagcaatcttcaaagtcactggtggtacatacttctggcagttctcgttc
ttcgatggagcagaggagggagtatatttcaaacctgattcagtcacaactttagcacct
aagttttctcaccatagacttacatgttttgagtttgctgatggtcttaatcctttatca
actcttattgcaaacggtacagttcctaacgctgactactctgcagtatcaaatattcta
gcaagaactgacttagagatatattatcagaaagtatctaaagcatttgctacaatacct
gatacatctggtgatccttcaactgaccaaatacaggcaagggttgaggaaaacagaatc
gttggtcctatatctgatgaatacagagtattacagatcacacgtaatggtcagactgca
acagcagtcacagttgatgaatttgatgatcctagagatcatggcttctctgttggtgta
aacatcaacgttagtggtgtcactggttcgactggatcacagtctgaagcagacgcaggt
ttatataatggttcatttactgtcacatctgcatctggaaacgtattcacctatcaaatg
cagggagaaccaactggtaatgctgtaggttcaaacattgcagttaaaactgagattgat
actgttgactctgcatcaccatacgcatttaacctatcactaagaagtgtatggggtatg
aatggtatgcatgcaaacggtgcaaaggcaactggtttcaaatcaatggttgtggcacag
tttactggattatcactacagaaagatgacagagcatttgtaagatataatgcatcaact
ggaaactatgatgtagcaacagcaggagatggtgcacacttagatggtttcgctgagtat
agaaagggatggggtcatgaacacatcaagtgtagtaatgattcattcatacaggcagtt
tctgtgttcgctgtgggatatcaaggtcactttactgcattaagtggtggtgatatgtca
atcaccaactctaactctaactttggtaatactgcattgagatcagcaggattcaaagca
aaagcattctctaaagataaggcaggtgcattaacacatataataccacctaaagcttta
aatgttatctctacaactgctactggtgctagtggaacaaatacaattacgttagcaaat
gatggtagtgtaaatggtgtcatacaaggtatgactatcacaggaactaatattggagta
ggagcgacagtcggaaatataaacgtaagcacaagagtattgacacttacagcttcaaat
actggtgctgtaaatggaaacgtaatctttggtgaagagacatcaattaactgggttaac
attgacatccagagaactaaaactatcaacgcatcacttgcaggacagggtggtacacca
ggtacaaggttatatctatatggttatactgtagaagcatctccaccaacaacaagagta
cagggttttgcagtaggagcaagacaagatggtacaggtgcaagtgcaatagcagataaa
ataaactgtttacttgtagcacagggtgcaactgatgcaagtgtacaatctgcaagcata
tcaccttatggtcctagtgtttctggtttggcagcaggtgttgttggatctccattacaa
tatgatgctaatacatatacaattagcggtgtagcaggatcagtcggtggatggtatcta
tcagtcagttcagtaaataatgaaatctatacaactttatctactaacacaacatataac
acagttaacttcacaccaactacattcctcaagagaatacctgacccaagagacttacaa
gatagaacatatcgtgtaagatatgtaattgataaagataagaccaatccattaccaaga
gatcccctctctggttatgttatgcaaccattgaatagtgatactacatcatttaattta
caaagatgtttctacatctatgacattgaggttgtacaaccatttgtaagaggtactgac
gatggtatctactacataactctcttatgtggatctatatcacctacaacttctaacttt
gatgataggaagttctctcaaaatgtcaatgaagtttatcctacatttgacagagataat
ccaatcgctgatcctgctgctgcaacatcagttgcagataatgtcaccattggtcttgtt
aatgcaacagatggtgcatcgccacctgttaaagatccaaagttatctattacaaaggaa
tcaacagtattcttactaacagatacaggatggacacaaccaggtactacacctaactat
gactcagttaataaaagattatctaacgtagagttaactgcacgagcaggagacgaagaa
gtaagaaagattaatatacgagaaaataatgatggtacagtagcaccaattaacgtagag
tttagacgacactctatcctaagatcaggaaaccatacgtttgaataccttggttttggt
ccaggtaactacagtacagcgttccctcagacacaggtagaaactctaactcaagagcaa
attagattctcacagtcaattaaagaagagggaggagtttcattctactcaggattgaac
tcaaatggtgatctattcattggtaatcaggttatcaacccagtcacaggtcagatcact
aacgaagatgttgcacagttaaacgttgttggtgaagagagcacaaccattgaaacattc
tctgagttggttctaacggacaagataactgttattggtggagcatcaaaccagttagaa
tctatctttgcaggtcctgtcacattccaaggacagagtacatttactaataatatatct
gctaagaaacttacatactttaaccaagatggtactgttattaaacagactttactagca
ccagaaaatgcaagtggactaccagatttctctaatatcacaggatatgatacacctgct
gatggagatatagtttacaatatcaactggacaccaggtaaatcactaggttggatatac
tatggtggtgcatttaaagagtttggactgacagacacaggagatattaacatatctacc
acaggtaatggacatataggtttaggagaagcacctgatacaacttacagagtcagaatt
aatggttcagttagaattgacggagacgttgttggtactggtagaggtgttgttggatca
gataaatatattactaaatcttatacaggggatggtaatacattaaccttcgcagtcaca
acatatggtggaggcatcaaacactctgatgattcactcttagtattcctcaatggtgta
gcacagattgcaggaactaactacacagtggatacaaatggtgctaacgttgtattctca
tctggggatgcacctctatcaacggacacagttcacatcttagaattacctatctaa
DBGET
integrated database retrieval system