Viruses: 33868140
Help
Entry
33868140 CDS
T40000
Symbol
CKM51_gp007
Name
(RefSeq) NY_014 poxvirus; surface glycoprotein
Virus
2025360
NY_014 poxvirus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Poxvirus_B22R_C
Poxvirus_B22R
Poxvirus_B22R_N
7TMR-HDED
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
33868140
NCBI-ProteinID:
YP_009408395
RS:
NC_035469
LinkDB
All DBs
Position
NC_035469:complement(9399..15026)
Genome browser
AA seq
1875 aa
AA seq
DB search
MNLYILSLIIYFATCSWCYETCMRKSALYHDNNLDRVEDNKDDVASLPYKYLQVVHQRES
SRLLATFNWTSISNSVREEFVKRCDINGTYLYNYTIAISMIINSTEELLTSPIQTTTQTP
TPSPTQYYYTTPLPTSIVPYNQSNNNVSIISIQILSKILGVNESELTSYLITHINNTVVY
NETYNNTVVYNEASNNNTLNGNIGLFEINNCYNVSVADASFRITLVNETSEEIVLMLKGT
SASDTFISSDNITECLRTLINNTSNNTDVTITENVNVTSNCDKCSMDLMTSVVPIVTEFN
NTLEKIGAKYSNTTYSYYHCKLTTNSNCNELINLNEIINNITLTNIISSSSKTNTRKRRD
LNPEIGFSTPKELDCLYESYGVKDDVSHCFASPRHRRSDDKEYIEMKLLDHAKRDLGIDS
VIPRGTTHFQVGVSGASGGVVGDSSPFQNVKSRASLLAEKIMPKVPITTTEDDLYATVNK
QAKLPAGVKSTPFTEAVVSTINQKLSSVKDVTYASLELPRSSGYIHRPSESVIYSTIRRP
RISSSSSSDFEDIDTVVKEYNQKYGGRVRTLSSSSDFEDIDTVVKEYNQKYGGRVRTLSS
NSDFEDIDTVVKEYNQKYGNAMTRGRSTSPKPDPLYSTVKKTPKSLAAGVEIATKQTEYS
ILPDVNTGSSIMTPLTRRGATRRPKRPSPPSSNNLPPLPPNPPPRNPRPQLPPRDDSSPP
RRPPPPLPPKPVPAVPPRDSQPDKKGFSKFVSPRRCRRASSGVICGLIQSRPNDDTYSLL
QPPNRNYPQYEEVGNGIARNNVPVIGDKRSKKYTSSMTKISTKFDKSMAFGAAMLLTGQQ
AINQQIRSTALIRKDQMSKEEKIFEAVSMGLSSIGSTLTTAGMVAGPKLMIAGMGVSFIA
GIIDTVKDIYYLLSGAERPEDPVIKLFNTYSDLVSDSNKMGVRKCLTPGEDTIIFMAYKN
DSSFKPNIDNAIYFLDVINSEILYLNTSNLVLEYQLKVACPIGTLRSVDVDITAYTVLYD
TSDNIKRYKFVRLATLLSKHPVIRLTCGLDATLVIKPYEVPISDMQLLKMATPGEPESTK
SIPSDVCDKYPLKKFYLLASGCPYDTSQTFIVHTTCSILLKTATWDQFRNRWVLQNPFKQ
EGTFKQLFTFSKYDFNDTIIDPNGVEGHASFCTNKSSNQCFWSEPMILEDVTSCNSRTRK
IYVKLGLFNTGGFNSFVLNCPSGSTPTYIKDKNTDNSNFIIELPVGDYGTAKLYSSTKQS
RIAVFCTHNYDKRFKSDIIVLIFDRFSSLSFTSIDTTGVYGKNTLFYRLSGGMPFRSLFC
DNRRRAGCNYAGIPFNEESVEIDVHHGSEIMFKETYDANSVDPVIISKSKTHFPSPLNIK
FHVNNLGNGYKNHDSFWKDAKNKKRTYSAITLKISPCTIRNKNIDFGPFVSNMVYLQSTS
YDYGDGSKYTFKSVNKTNHECEASLDLTSKEVIVTCPAFSIPRNISKYEGLCFTIVTSKD
HCATNDDGLKSHGYEKEDAYKQRYCHHHWLYNIKPYDYYCMDSYFKHRFPDYDPCNSYIN
VEYRDTWIESKVLQQPPYTFEFIHDDSNEYVDKEISNKLNDLYNEYKNIMEYSDGSLPAS
INRLAKALTLEGREITSVNIDGNLLDIAYQADKEKMIEIQNKIDDITRDLFIHTLSDKDI
KDIIESEEGKRCCIIDVKNNHVEKYYPIDNYLCGTLDDYIYTSVETNKSYVLVNDTYMSY
DYLEASGIVVLSCYEMTIISLDTKDAKDAVENEIIESAVAEALNDMFKEFDKNVSAILIK
EEDNYLNNKDIYNIIYIIGSAILLLLVIVLILVMYIALNRYKTRKYKLIKKYDNISIKSE
HHNSLETISMEIIDH
NT seq
5628 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatttatatatattatctctgataatatattttgctacgtgttcttggtgttatgaa
acatgtatgagaaaatctgcattgtatcatgataataatttggatcgtgttgaagataac
aaagatgatgtggcatcattgccatacaaatatctacaagtggtccatcaaagagaaagt
agtagattattagctacttttaattggacaagtatatcaaacagtgttagagaggagttt
gttaaacgatgtgatataaacggaacatatctatataattatactattgcaattagtatg
attattaattctactgaagaactactaacgagcccaattcaaacaacgactcaaactcca
acaccttctccaactcagtattattatacaacgcctcttccaacttcaattgttccatat
aatcaatcaaataacaatgtaagtattatatctattcagatactgagtaaaatattgggc
gtcaatgaaagcgaactaacaagttatcttatcacacacataaataacactgttgtatac
aatgagacttataataacactgttgtatacaatgaggcatctaataataacacactgaat
ggtaatataggattatttgaaataaataattgctacaatgtttctgtagcagatgctagt
tttagaataacattggtaaatgagacttctgaagaaattgttctaatgttaaagggaact
agtgcatctgacaccttcatatcgtctgataatatcaccgaatgtttgagaacattaatc
aataatacatcgaataatactgatgtaactataacagaaaatgttaatgtaacatctaat
tgtgataaatgttcaatggatttaatgacatctgttgttcctattgttactgagtttaat
aacacgttggaaaaaattggtgcaaaatatagcaatacaacatacagctattatcattgt
aaactaactacaaattctaattgtaacgagttaatcaatttaaatgaaattattaacaat
ataactctgacaaatattataagtagtagttccaagactaacaccagaaaaagacgagat
ctaaatcctgagattggattttctacacccaaggaattagattgtctttacgaatcatat
ggtgtaaaagatgatgtaagtcattgttttgcatcacctagacatagaagatctgatgac
aaggaatatatagaaatgaaattactagaccacgcaaaaagagatttaggaatagacagt
gttattcctagaggtacaactcatttccaagtaggtgtatctggtgcaagtggcggtgtt
gtaggagatagttccccatttcaaaatgttaaatcacgtgccagtctattggcggaaaaa
ataatgcctaaagtacctattactactactgaagatgatttatacgctacagtaaataaa
caagccaagttacctgcaggtgttaaaagtactccgtttacagaggcagttgtgtctaca
ataaaccaaaaactttctagtgttaaagatgtaacctatgcttctctcgagctaccaaga
tcaagtggttatattcatagaccatctgaatctgttatttacagcactataagacggcca
cgtatatcgagtagtagtagtagtgattttgaagatatagatactgttgttaaagaatat
aatcaaaaatatggtggtcgtgttagaacactgtcatcaagtagtgattttgaagatata
gatactgttgttaaagaatataatcaaaaatatggtggtcgtgttagaacattgtcatca
aatagtgattttgaagatatagatactgttgttaaagaatataatcaaaaatacggcaat
gctatgacaagaggacgtagtacttctcctaaacctgatcctttatatagtacggttaag
aaaacacctaaaagtctagcagcgggtgtagaaatagctacaaaacaaacagagtattct
atattaccagatgtgaatactggcagttctattatgacaccactcaccagaagaggagcc
actagacgacctaaacgcccatctccgccttcaagcaacaatctaccaccacttcctcca
aatcctcctcctcgtaatcctcgtccacagcttcctccacgtgatgattcttctcctcca
cgtagacctcctccaccacttcctcctaaaccagttccagctgttccacctagagatagt
caaccagataagaaaggatttagtaagtttgtatctcctagacggtgtagaagagcaagc
tctggagttatatgtggtttaatacaatcaagaccaaacgatgatacttattcactactt
caaccaccaaatcgtaattatccacaatatgaagaagtaggtaatggtatagccaggaac
aatgttcctgtaataggtgataaacgtagtaaaaaatacacatcatcaatgacaaaaata
tcaacaaaatttgataaatctatggcatttggagcagcaatgttgctaactggtcaacag
gctattaaccaacagattagatcaactgctttgattagaaaagatcagatgagcaaggaa
gaaaagatatttgaagcagtttcaatgggtttatcaagtataggttcaacattaacaact
gcaggtatggtcgctggtccaaaactgatgattgcaggaatgggagtatcgtttatagca
ggtataatagatactgtaaaagatatatattacctattgtcaggagctgagaggccagaa
gatcctgttattaaattatttaatacttactctgatctggtatctgatagtaacaaaatg
ggtgtaaggaaatgtttgacacctggagaagatacaattattttcatggcgtataaaaac
gattccagttttaaaccgaatatcgataatgctatttatttcttagatgttatcaactct
gagattctatatctaaacacttcaaatttagttctagagtatcaactaaaggtggcttgt
cccataggaacattgagatcggtagatgtggacatcactgcctatacagtattatatgat
acatcagataatattaagagatacaagtttgtcagattggcgaccttactatccaaacat
cccgttattagattaacgtgtggtttagatgcaacgttggtaattaaaccgtacgaggta
cctattagcgatatgcaactactaaaaatggcaacacctggtgaaccagaatcgactaaa
tctataccatctgatgtttgtgataaatatcctctaaagaaattctatcttttggcgagt
ggttgtccatatgatacatctcaaacttttattgtacatactacttgcagtattctacta
aaaacagctacatgggatcagtttagaaacagatgggtattacaaaacccattcaaacaa
gaaggtacatttaaacaactgtttacttttagtaaatatgactttaacgacactataatt
gatcctaatggtgtggaaggacatgctagcttttgtaccaataaaagtagcaaccaatgt
ttctggtccgaacctatgatattggaagatgtaacatcgtgtaattctagaactagaaaa
atatacgtaaaattgggattgtttaatactggaggttttaatagttttgtactaaactgt
ccaagtgggtcgacacccacatatatcaaagataaaaatacagataatagcaattttatt
atagaattacctgttggtgattatggtactgcaaaattatattcatctacaaagcagtca
aggatagctgtattctgtactcataactatgataaacgattcaaatcagatattatagtt
ctaatatttgatcgttttagtagtctttcatttacaagcatagatacaacgggtgtatat
ggtaaaaatactctgttttacaggttgtctggaggaatgccatttaggtcattgttttgt
gacaatagacgacgagcaggttgtaattatgcaggaataccatttaacgaagaaagtgta
gaaatagatgtacatcatggttcagaaataatgtttaaggaaacatatgatgcgaatagt
gtcgatccagtaattatatcaaagtcaaaaacacactttcctagtccattaaatataaaa
ttccatgttaataatttaggaaatggatataagaatcatgattcattttggaaagatgct
aaaaataaaaaaagaacgtatagtgccataacattaaaaatttcaccatgtacaataaga
aataaaaatatagattttgggccttttgtttctaatatggtttatttacaatctactagt
tatgattacggagatggtagcaaatacacatttaaatccgtaaataaaacaaatcacgag
tgtgaagcttctttagatttgacatctaaagaagtaatcgtaacatgtcctgcatttagt
ataccaagaaatatatcgaaatatgaaggtctatgctttactattgttacatctaaagat
cattgtgctacaaatgatgatgggttaaaatctcatggttatgaaaaggaagatgcgtat
aaacaacgttactgtcatcatcattggctttataatattaaaccgtatgactattattgt
atggattcatattttaaacaccgctttcctgactatgatccttgcaattcatatatcaat
gtagagtatagagatacatggatagaatctaaggtgttacaacaacctccttacacattc
gaattcatacatgatgattctaatgaatatgttgataaagaaattagtaacaaattaaat
gatttatacaatgaatacaagaacattatggaatatagtgatgggtcattgcctgcttct
ataaacagattagcgaaggcattgactttagagggaagagaaataacaagcgttaatata
gatggtaatctgcttgatatcgcatatcaagcagataaggaaaagatgattgagatacag
aacaaaatagatgatatcacaagagatttattcattcacactctatcagataaagatata
aaagacattatagaatccgaagaaggcaagagatgttgtataatagatgttaagaacaat
catgttgaaaaatattatcctattgataattatctatgtggtactttagatgattatata
tacacctctgtagagactaacaaatcttatgtgttagtaaacgacacttatatgagctat
gactatcttgaagcatcaggtatcgttgttctatcatgttatgaaatgactataatatcc
ttggacacaaaagacgcaaaagatgctgtagaaaatgagataatagaaagtgctgtagca
gaagcgttaaatgacatgtttaaggaatttgataaaaatgtaagtgctattctaataaaa
gaagaagataattatctaaacaataaggatatctacaacataatatatatcataggtagc
gctattctgttactattagtcattgttttaatattggtaatgtatatagcactcaataga
tataaaacacgaaaatataaactgataaagaaatatgacaatataagcattaaatctgaa
catcataatagtctagagactatatctatggaaatcatagatcattaa
DBGET
integrated database retrieval system
