Viruses: 35381754
Help
Entry
35381754 CDS
T40000
Symbol
ORPV_1091
Name
(RefSeq) Orpheovirus IHUMI-LCC2; VETF-like early transcription factor large subunit
Virus
2023057
Orpheovirus IHUMI-LCC2
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
DUF5757
Prok-E2_D
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
35381754
NCBI-ProteinID:
YP_009449297
RS:
NC_036594
UniProt:
A0A2I2L618
LinkDB
All DBs
Position
NC_036594:1317787..1321770
Genome browser
AA seq
1327 aa
AA seq
DB search
MLNKFDNDVTRLYKFAVINKTLPRYVLRQVNEDTGETTYYLLLDYLTNRISDPSFDISTE
LDIIKQSYYTDDRLSPYNLLLFFINKIPGSNSPRFLQQINKTLLETNTIPTADLIPQQLP
GIINGWIDDYNNEFRKSEYAINSINTIQNSLDQISPLYTSPFTITHTTQVFNPTLLQPPT
TSQSPSINLETYKIEIFDRLLVSYEVPYIQYNTPSGDRLFKLFKGDTQYPAPKYDLFVPT
TESTFNAKDTIYIIIWKEEDESKKLTRESYTKVLYNLSLNKVEIQLPVGDEKELIISRLK
SFLQPVINLGEGREVRLGGYFYIYNCEVDEYSLLHAIMNDKLFSTYLYVEESIKPYAEKK
RLGLHFKSLPKVDLFEKQDVSKSSVSVTLFQNYSLANEKYNVKVYRLNGLPVLPNVPGAE
EVINKGYTWPERTPVLQMTINKADNQQVTGQFIEIISRLLSYYTNPIMVGAPSLKTQIQN
TYSSLIPGLYSSTGVEKGKLRSKKAMESTRLQRLQQIAPELFPSNYGRICQGSGSQPEII
SDAEVEAWQAQTFTKRGVTQNRQVLQFPIDVQAKLDKKPTGHYNIVCPNDSNPYPGVKIN
DGSRLKNADIYPVVPCCMYDDHIGKEVKNSVYYRFFTLRESIDQISKTKQQDIIRGNKLL
NPGSIGILPTAISDLTSAYKGSGIEAHMVRYGVIRSPNSFIHSLLVCKIDQNYLSLPTDE
AKEEYAKGIRRFVYNNTHPNLYRQEMYDYTDKDIRDYISGEEFLDPSLAYRGFEEWMGCN
IFVFTAKSNTATKTRATNGKNGNGTQEYLGYIELPRYKIFHSRYYRPDRPTILLFKHMGS
ESDGLKYPQCEIIADQVSEGKWDFSYRESMTKLVYYALKVASREISWNVDNNDIIARDTP
YSRVRLLDVVPKSLVPASQLIDPLGKCRAIAFRGPGFNVLISTIPSMPENLPTLLSTEIR
LPIGSLNTVLNGASANYITKNIDGEVDGVWYGALDIPNAFYIPIVPTSSAPSSISSLPLG
PNNPLFTTGRDPINRYRKLRRVLDIFLQVVYYLYMLDHNSNNGIEFINRYGYINNENIDS
LDMYSFVGIERLLPTEEQLLRGGGVDIVSAAMLYLSNTPFKSMFINVQGNIKILFHSYDL
AKKVANKLRRDPNGIVPVEIVGLYSMEEDFRQDSSTAIFLDDYDMREWLRTVEHPVFQNM
IIKPKLDLSYAILEDPYLYKDQQGIIYIVQNVQKGNMLKALQVSENWYQDRINTGYYTEE
YDINLSYDPGMSGVPPHLVFGISPDGTLTVSSINNPNSYPQEDLLLIMQYARGNYAAMLP
IYIPPSQ
NT seq
3984 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgaataagtttgataatgatgtcacaagactatataaattcgcggtcattaacaag
acattacctagatacgttctaagacaagtaaacgaggataccggggaaactacctactat
ttattacttgattatctaacaaatcgtatctcagacccttcctttgatatttccaccgaa
ttagatattattaaacaatcatattataccgatgatagactctccccctataatttactt
ttattcttcataaataaaattccaggctcaaattccccccgttttctacaacaaattaat
aaaactttattagaaactaataccatcccaaccgcagatcttattcctcaacaactaccc
ggcattattaatggctggattgatgactataataatgaatttcgcaaatctgaatatgcc
attaattccattaataccatacaaaattctttagatcaaatttcacctttatatacaagt
ccatttactatcacccacaccacccaagtttttaatcctacccttcttcaacctcccacc
acctcccaatccccctccattaatcttgaaacttacaaaatcgaaatttttgatcgttta
ttagtatcctatgaagttccttatattcaatataacacaccatccggtgatcgtttattc
aaattatttaaaggagatacacaatatccagcccctaaatatgatttatttgtcccaact
acagaaagtacattcaatgctaaagataccatttatattattatatggaaggaagaagat
gaaagtaagaaattaactagagaatcatatactaaagttttatataatttaagtttgaat
aaggtggaaatacaattacctgttggtgatgaaaaggaattaataatatcaagattaaaa
tctttcttacaacctgtcataaatctcggcgaaggccgcgaagttcgtctaggtggctat
ttctacatctataattgtgaagtagatgaatatagtttactccatgccatcatgaatgat
aaattatttagcacatatttatatgttgaagaatcaattaaaccctatgctgaaaagaag
agattaggtttacattttaaatccttaccaaaagttgacttattcgaaaagcaagatgta
agtaaatcatctgtatctgttactttattccaaaattattccctagcaaatgaaaaatat
aatgttaaagtatatagattaaatggtttaccagtattaccaaacgtcccaggtgccgaa
gaagttattaataagggatatacttggccagaacgaaccccagtattacaaatgactatt
aataaagctgataaccaacaagtcacgggtcaatttattgaaattataagtagattatta
tcatattatacgaatccaattatggttggagccccctctcttaaaactcaaattcaaaat
acttatagttcactaataccaggattatatagcagcaccggagtagaaaaaggaaaatta
agaagtaagaaggcaatggaaagtaccagattacaacgtttacaacaaattgccccagaa
ttattcccatccaattatggtcgtatttgccagggttcaggaagtcaaccagaaataata
agcgatgcagaagtggaagcatggcaagcacaaaccttcacaaaacgtggagtcactcaa
aatagacaagttttacaatttccaatagacgtacaagctaaattagataaaaagccaaca
ggtcattataatattgtctgtccaaatgatagtaatccttatcccggtgttaaaattaat
gatggtagtagattaaagaatgcagatatctacccagtagttccttgctgtatgtatgat
gatcatattggaaaggaggtaaagaatagtgtgtattataggttcttcactttaagagag
tccatagatcaaatctctaaaaccaagcaacaagatattattagaggaaataaattacta
aatcctggaagtatcggtattctcccaacagctatctccgatcttacttctgcttacaaa
ggtagtggtattgaagctcatatggtaagatatggtgtcataagaagtcccaattccttt
atccattctttgttagtatgtaaaatagatcaaaattatttatcattgccaacagacgaa
gcaaaagaagaatatgcaaaaggtatccgacgatttgtctataataatactcatccaaat
ttatatagacaagaaatgtatgattatacagataaggatattagagattatatttctgga
gaggaatttttagatccatctctcgcatatcgtggctttgaggaatggatgggctgtaac
atcttcgtattcaccgccaaatccaataccgccaccaaaactcgcgctactaatggtaaa
aatggtaatggcactcaagaatatcttggttacattgaattacctcgatataaaatattc
cattctaggtattatcgtcctgatagaccaactattctcctatttaaacatatgggctcg
gaatctgatggtcttaaatatcctcaatgtgaaatcattgccgatcaagtatccgaaggt
aaatgggatttctcatatcgcgaatctatgaccaaattagtatattatgcattaaaagtt
gcatctcgagagataagttggaatgttgataataatgatataattgctagagatacacca
tattctcgtgttcgtctccttgatgttgttcctaaatctcttgttcctgccagtcaactt
attgatccccttggtaaatgccgcgccatcgccttccgtggtcctggctttaatgtttta
atctccactattccttccatgcctgaaaatttacccactcttttatctactgaaattcgt
cttcctataggatcattaaataccgttctcaatggagcatccgcaaattatataactaaa
aatatagatggggaggtggatggtgtttggtatggtgccctcgatattcctaacgccttc
tatattcctattgtcccaacatcttctgccccatcttctatctcctctttacctctaggc
cctaataatccattgtttactacgggaagagatcctattaatagatatagaaaattaaga
agggttttagatattttcttacaagttgtatattatttgtatatgttggatcataatagt
aataatggtattgagtttataaatagatatggatatattaataatgaaaatatagattca
ttggatatgtattcctttgttggaattgaaagattattaccgacagaggaacaattgcta
agaggtggtggagtggatatagttagtgctgcgatgttatatttaagtaatacaccattt
aagtctatgtttattaatgtacaaggaaatattaagatattattccatagttatgatttg
gcgaagaaagttgctaataagttgagaagagatccgaatggaattgttccggtggagatt
gttggattatattctatggaggaagattttagacaggatagttcgactgcgattttcttg
gatgattatgatatgagggaatggttaagaactgtggaacatcctgttttccaaaatatg
atcatcaaacctaagctagacttatcttatgcaattttagaagatccatatttatataag
gatcaacaaggtataatatatatagttcaaaatgttcagaaaggtaatatgttgaaggca
ttacaagtttctgaaaattggtatcaagatagaattaacactggatattatactgaggaa
tatgatataaatttatcttatgatcctggaatgtctggggtacctcctcatttggtattt
ggtatatcaccagatggaactttaacagtttctagtattaataatccgaattcatatcca
caagaagatttattacttattatgcaatatgctcgtggtaattatgcagccatgttaccg
atttatattcccccttcacaataa
DBGET
integrated database retrieval system
