KEGG   Viruses: 35381812
Entry
35381812          CDS       T40000                                 
Symbol
ORPV_1143
Name
(RefSeq) Orpheovirus IHUMI-LCC2; DNA-directed RNA polymerase subunit 1 RPB1
Virus
2023057  Orpheovirus IHUMI-LCC2
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb1_2 RNA_pol_Rpb1_1 RNA_pol_Rpb1_3 RNA_pol_Rpb1_5 RNA_pol_Rpb1_4
Other DBs
NCBI-GeneID: 35381812
NCBI-ProteinID: YP_009449349
UniProt: A0A2I2L692
LinkDB
Position
NC_036594:complement(1382211..1385264)
AA seq 1017 aa
MDNRINTTATLLGNTRGKRGVNLGQRIPVQNSASIQQVLPNSYSNYATININNMTETITV
VPPPENEKVSQNITLTRDELREYQNEMRRQLMSLPEYEPVGIFTQIFDNDIVGGNPRFAK
EIGVVEIINDKDSGTGSVNDPRMGPIKHDTPCDCGAVNCPGHYGFIRLPDDYPIIHPSHQ
KEVFQVLQSVCRNCGRLLLTEENMKDYGILKLSGLDRLAKIAEVCSIKEISCPFAKVTTP
PCVQNFLYLYKQYEGTNKIFFTNKTKAASSKTNTQGSQSFITAKNALEILRRIPREDLRL
MGFRDDSHPKNYIMTFIPVIPVPQRVPRQVSGRIMKHEYTLIYMDLFSNVKKLRDAIDNK
NKNDQDDAYKVLIDNYRHAITNKDEKYKKNNNPIEGFADSLGSKAGTFRGNGQGKRKNYT
ARSVAKIDPELEFGQIGVPKFVAENVPYPEYVFPANMQKCNRLIAEKKVLSIKKRDGRTT
QFTERISEMYITGQYKLATGDILYRKIMNGDWIVFNRQPTLHKESMMGAQAVIRDYDGIG
LHQAYTTPTNADFDGDDINLHIPQDLNTIAEIQELMSVKRCVITGQKNQPIMGTVYDGLI
GLYRMSKTENIEPDVFYHIYSKIVPEVPNTETPTSGDQYRRSRPAGTIPSDVIARANGSG
EIPHLFDLRERAEAVGVDANNFMTGRMLFSAILPRDFFYTKKSGDNNEVVIRNGILLKGY
LDKAIVGTSSGSIVQSLSMKYGNYGDVVSRFISNCYWVAYEFLEYYSFTIGPEDCRVDPK
IINPITNAETTKARMAVEQLGAVPDDPLAKKIHEDKVVGIVDVIKTMGVRTANEALSEGN
AMKDSAVSGVKGTYQNVGWVTAALGQQFLKGQRIPMGLTSEQRMLPHFAPGDDSIESKGF
ALNSFSSGLTPVEAFTHQETSREGLIATAINTSETGHNERKLVKNLEDYYAEYDGTVRGI
AFTIIQFIYGGDGYDPHHLKTQKTKTDDIVLPLDLQNLIFEINNTEDPEDIDDIPYF
NT seq 3054 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggacaatcgcattaacacaaccgcgacattgttgggaaatacacgtggaaaacgtggg
gttaaccttggtcaaagaataccagttcaaaatagtgcatcaatacaacaggttttaccc
aattcttattctaactatgcaactattaatattaataatatgacggaaaccataactgtt
gtaccacctcctgagaatgaaaaagttagtcaaaatattacattaactcgtgatgagcta
agggaatatcaaaatgagatgcgtcgacagttaatgtctctgccagaatatgagcccgtt
ggtattttcactcaaatattcgataatgatattgttggtggaaatcctcgttttgctaag
gaaataggtgtcgttgagatcattaatgacaaggattctggcactggatctgttaatgat
ccacgtatgggtcctataaaacatgatactccttgtgattgtggtgctgttaactgtccc
ggtcattatggctttattcgattacctgatgattatcctattattcatccttctcatcaa
aaagaggtcttccaggttttacaatccgtatgcagaaattgcggcagattacttctaact
gaagagaacatgaaagattatggcatattaaagcttagtgggctagatcgtttggcaaag
attgctgaggtatgttctattaaggagatatcatgtccgtttgcaaaggtgacaacacct
ccatgtgtccaaaacttcttatatctttataaacaatatgaaggtactaataagatcttc
tttactaataaaactaaagccgcttccagtaaaacaaatactcaaggttcacaatctttt
attactgctaagaatgcattggagattttaagaagaataccaagagaagatctacgactt
atgggatttagagatgattcccatccaaagaactatattatgacatttatacctgtcatt
ccagttcctcaacgtgtccctcgtcaagtaagtggtcgtattatgaaacatgaatacacc
cttatttatatggatctttttagtaatgtaaagaagttaagagatgctattgataataag
aataagaatgatcaggatgatgcatataaagttcttatagataattatagacatgctatc
actaacaaggatgaaaaatataagaagaacaataatcctatagaaggatttgcggatagc
ttaggtagtaaagctggtacattcagaggaaatggtcaaggtaaaagaaagaattataca
gcacgttccgtcgctaaaatcgatccagaattagaatttggacagataggtgttcctaaa
ttcgttgcagaaaatgtaccatatcctgagtatgtattccccgctaatatgcaaaagtgt
aatcgtctaattgcagaaaagaaggtgttatcgattaagaagagggatggtagaacaact
caatttacggagagaatcagcgaaatgtatataactggacaatataagttagctaccggt
gatattctatatcgtaagattatgaatggtgattggatcgtctttaacagacaaccgact
cttcataaggagtctatgatgggtgctcaagccgtcattcgtgattatgatggtattggg
ttacatcaggcatatacaactcccaccaatgccgattttgatggtgatgatatcaatctt
cacattcctcaagatttaaatactattgcggaaattcaagagttgatgagtgtaaaacgt
tgtgttatcacaggtcagaaaaatcaacctattatgggaaccgtttatgatggtcttatt
ggtttatatagaatgagcaaaaccgaaaatattgaacctgatgttttctatcatatatat
agcaagattgttcctgaagtacctaacaccgaaacacccacttccggcgaccaatatcga
agatccagaccagcgggaactattccatctgatgttattgcacgagcaaatggaagtgga
gaaatcccacatttatttgatttgagggaaagggcagaagctgtcggtgttgatgctaat
aattttatgacaggtcgtatgttatttagcgcaatattacctagagatttcttttatacg
aagaagagtggtgataacaacgaggtagtaattcgtaatggtattctgcttaagggatat
ttagataaggcaattgtaggtacttcatctggttctattgtgcaatcactgtctatgaag
tatggtaattatggagatgtggtttcgagatttattagtaattgttattgggttgcttat
gaatttttggaatattattcattcacaattggtccagaggattgtcgtgtcgatcctaag
attattaatcctattaccaatgcagaaactaccaaagctagaatggcggtagaacaatta
ggtgcggttcctgatgatcctttagctaagaagattcatgaggataaagttgttggtatt
gttgatgttattaagacaatgggtgttcgaactgccaatgaagctttatctgaaggtaat
gctatgaaggattctgcagtttctggtgtcaaaggtacttatcaaaacgtgggttgggtt
actgcagcactaggtcagcaattcttaaagggccaaagaattccgatgggattaacatca
gagcagagaatgttaccacactttgctcctggtgatgatagcattgaatctaaaggtttt
gcccttaatagtttctcatcaggattaactccagtggaagcctttactcatcaagaaaca
tctagagaaggtttgattgcaactgccatcaatacatcagaaactggtcataatgaacgt
aagctagtcaagaacttggaagattattatgcagaatatgatggtacagtccgaggtatc
gccttcactatcattcaatttatttatggtggggatggatatgaccctcatcatttaaag
acacaaaagactaagactgatgatattgttttgcctttagatttacaaaacttaatattc
gagattaacaatactgaggatcccgaagacatcgatgatatcccatatttctaa

DBGET integrated database retrieval system