Viruses: 3654696
Help
Entry
3654696 CDS
T40000
Symbol
EhV064
Name
(RefSeq) Emiliania huxleyi virus 86; putative DNA-dependent RNA polymerase II largest subunit
Virus
181082
Emiliania huxleyi virus 86
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_5
RNA_pol_Rpb1_2
RNA_pol_Rpb1_1
RNA_pol_Rpb1_3
RNA_pol_Rpb1_4
RNA_pol_Rpb1_7
CBM39
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3654696
NCBI-ProteinID:
YP_293818
RS:
NC_007346
UniProt:
Q4A369
LinkDB
All DBs
Position
NC_007346:complement(join(64018..65274,65352..68501))
Genome browser
AA seq
1468 aa
AA seq
DB search
MIPVHGLSTNAKVVKKVNFSVYGSDAIRQNAVTRVNEIALYTRGIPTHNGVNSLAMGSSD
RRIRCTTCNELMQKCPGHNGEIRLPLPVYQALYIDHTLKVLRSVCFFCSEICLTDEDKVA
LMEKYTDDKTRFNHTYAIARTRKKCPHCKGIRPSYVRGPLGIKTEWVDKSFESEEEQEYA
MQKFTPALAYSILDNIKDTDATNFFGKGLHPRDLIATSVLVPPPIIRPAISTAEGSRTKG
QDDITLRLQEINRRGNELRLCMNKQEDSGLPTFLCDANKVLPQKTDTITYTVVDRLLNVD
ALTPDLIDRWNRLQADVFGLVNPAAIRGGMPASMANNNRNSANGKYIIDRIRGKNGRFRN
CLMGKRVNFSGRSVITPDSTIDVDQLGVPYELAMILTVPEKVTPSNIADLRTRILNGPTE
LIGAQSVINTEGDLISLKSCKNRADIVLRIGWIVERHLKNGDWVIFNRQPTLHRMGFNGH
RVVLTKGKTFRLNLSVCAVYNADFDGDEMNIHVCQSACATSEVSTLMAINRNIISAQNNK
PCFGIVQDSLVGAWLMTDPSVFLTRADMLRFRIYVKFANNGTTMLPPPAISKPKELWTGS
QLISFVFPYTLMYQRGSISGITSYDTKDLLIQNGQILFGRLSKSTLGATAGAISDIIHHE
HGGPKKAVEFLSDVQRVVNQWLLYKNSFSIGASDCVTNEQSHNEVVECIKSAVNNSKMIL
TSKVPKSLKEMAEGATTRILSDVIMKTATIIKNNAPPDNSIITCVTAGSKGSPLNIAQVC
GQVGQQIVGGARILNGTSGRTLPCFKHGEHATVNANGYIQNSFMLGLQPTEFFFSAMSGR
EGLVDTAVKTANSGYIQRCLVKASEDNMCNYDGTIRNAQGMVVQFKYADNFDPCKVERIK
VEPLLMTPEEIKRNAGPLEYDVIMSLRENAQKVLSQSNKPLMDVVLLPINISRMFESATW
NNDVPHEFDEESLLTAVSEVVHEIVKKHPVCKYVVPLYIQWCMRIGNIPEHLNVKAFLCE
VKHRCLSSVVAGGDAVGNTAALSIGEPSTQMTLNSFHTAGTGHAGVTMGIPRLKEVMGYS
KQLRTPQTTLEFSDKTPEELKAISAKLTRLTLSHVTENMNVVLEPSDVIDESYPEDVKFA
LKMDTYFAPDLSDPSMHVGVLELNKHLLNDYNLTPAKIAPIIKSLACNIIDTDVHVSYSE
VNTIDWWVRIRILDVSKHFPEVISNKEMCERGTVLRFVKLLCHEIKLGGFNGIEASAVDS
IERWNGEKNEIVNVIQTRSTILHRAYAIPGVDWTKVMTNDIHNVVNTLGIEAALTMIFNE
LHSTLTADGSYIDPRHIELTASTMTLRGYVMPLNRHGLNNIKTGPLTRSSFEETSEVLKD
AAIFAESEDVSGSVSASIMMGQLSAIGTGRFDVRIPKPESISVKETSRIIKTKGTATLIH
NKEDTWFIPRESASFKDRIPYVPYSPKR
NT seq
4407 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatccccgtacatggtttatctacaaatgctaaagttgttaaaaaggtaaacttttcc
gtatatggttctgatgctatccgtcaaaatgcggtgactcgtgtaaatgaaattgcgtta
tatacccgtgggatccctactcacaatggcgtaaactcacttgcaatgggatcttctgat
cgtcggattcgttgtacaacttgcaatgaacttatgcaaaaatgcccaggtcacaatggt
gaaattcgtctcccactaccagtataccaggcactgtatatcgatcataccctcaaggtt
cttcgttctgtttgctttttttgttctgaaatctgtcttacggatgaagacaaggtagca
ttgatggaaaaatatacggacgacaagacacgtttcaatcatacgtatgcaattgcacgt
acacgtaaaaagtgcccgcactgcaagggcatccgtccgagttatgtacgcggccccctc
ggaataaagacagaatgggttgataagagttttgaatccgaggaagaacaagagtatgca
atgcaaaagtttacacccgcacttgcatattcaattctagacaatatcaaagacaccgac
gcaacgaatttctttggaaaaggtcttcatccacgtgatttgattgcaacaagtgtactt
gttcctccgccgattattcgtcctgcaatttctactgcagagggatcacgtacaaaaggc
caggatgacattacactacgtctccaggaaattaaccgtcgcggaaatgaactgcgttta
tgcatgaacaaacaagaagactctggactaccaacctttttatgtgacgcaaacaaagtt
cttccacagaaaacagataccattacatatacggttgttgatcgtcttttaaatgtcgat
gcactgacaccggatctaattgatcgatggaatcggctccaggcagatgtatttggtctc
gtaaatcccgccgcaattcgaggtggtatgccggcgtccatggcaaacaacaatcgaaat
agtgcgaatggcaagtatatcattgatcgaattcgtggaaaaaacgggcgattccgtaat
tgtttaatgggtaagcgcgtaaattttagcggtcggtcggtaattacacctgattcgaca
attgatgtcgatcaacttggtgtaccatatgaacttgcgatgattctaactgttccagaa
aaggtgacaccgagtaatattgccgatcttcgtacgcgtattctaaatggtccaactgaa
ctcattggggcacagtctgtgattaacaccgaaggtgatttgatctcactcaagtcgtgt
aaaaatcgcgcagacattgttttgcgcattgggtggatcgttgaacgtcatctaaagaat
ggggattgggttattttcaatcgtcagccaacactacatcgcatggggttcaatggccac
cgtgttgttctcaccaagggaaagacgtttcgtcttaatttgtctgtatgtgcagtgtac
aatgcagatttcgacggtgacgagatgaatattcatgtttgtcaatctgcatgcgcaacg
tcggaagtatcaacactcatggcaattaatcgcaacatcattagtgcacaaaacaacaaa
ccatgttttggtatcgttcaggattctcttgttggtgcatggctaatgacagatccaagt
gtatttcttacacgtgctgatatgcttcggtttcgtatttatgtcaagtttgcaaacaat
gggacaaccatgctcccacctcctgcaatttccaaaccaaaagaattgtggacaggatct
cagttaatttcattcgtatttccatatactctaatgtaccaacgtggttcaatttcgggt
attacgtcatatgataccaaagatctgctaattcaaaatggtcaaatcctctttggacgt
ttatctaaatctacacttggcgcaactgccggtgcaatttcggacattattcaccatgaa
catggcggtccaaagaaggctgttgaatttttgagtgatgtacagcgcgttgtaaatcag
tggctcctatataagaattcattttcgattggtgcatctgattgtgttacaaacgaacag
agtcataacgaagttgtcgaatgcattaaatctgcggttaataattcaaagatgattctg
acatcaaaggtaccaaagtcacttaaagaaatggcagaaggagcaacgacacgtattctt
tctgatgtcatcatgaaaactgcaaccatcattaaaaacaatgcaccgccagataattca
atcatcacctgtgtaacagcaggttcaaaggggtctccgctaaatattgctcaagtatgt
ggtcaagttggccagcagattgttggcggtgcgcgcattttaaatggtacgtctggacgc
actctgccatgtttcaagcatggtgaacatgcgactgtaaacgcaaatggttacattcaa
aattcgtttatgcttggtctacaaccgactgagtttttcttttctgcaatgtccgggcgt
gaaggtctcgttgataccgcggtaaaaactgcaaacagtggttacatccagcgttgtctt
gtaaaggcaagtgaagataatatgtgcaattatgacggaacgattcgtaacgcacaagga
atggtcgtgcagtttaagtatgccgataattttgacccatgcaaagttgaacgaattaaa
gttgaaccacttttgatgacacccgaagagattaagcgaaatgcaggacctcttgaatac
gatgtaatcatgtcgctgcgtgaaaatgcacaaaaagtattatctcagtcaaacaagcca
ctaatggacgtggtcttacttccaattaatatttctcggatgtttgaaagtgccacgtgg
aataacgatgtgccacatgagtttgatgaagagtccttgctcactgccgtatcggaagtt
gttcatgaaattgtaaagaaacatccggtatgtaagtatgtggtcccactctacattcaa
tggtgcatgcgcattggaaatattccagaacacttgaatgttaaggcatttctatgtgaa
gtaaaacatcgttgtttgtcgtcggttgttgcaggcggtgatgcggttggaaatactgct
gcacttagtattggcgaaccttcaactcagatgacactcaacagtttccatactgcagga
accggtcatgctggtgtaacaatgggaatccctcgcctaaaggaagttatgggttattca
aagcagcttcgcaccccacagacaacgcttgagttctctgacaaaacgccggaagagtta
aaggcaatctccgcaaaactaacacgtctaacgttgtcacatgttacagagaacatgaat
gttgtacttgaaccatccgacgtaattgacgaatcgtatccagaggacgtaaagtttgca
ctaaagatggatacatattttgcgccggatttgtcagatccatcgatgcatgttggtgta
cttgaattaaataagcacctcctaaacgattacaatcttaccccagctaagattgcacca
attattaagtcgcttgcatgtaacattattgatactgatgtacatgtgtcatactcggag
gtcaacacaattgactggtgggtgcgcattcgtatcttggatgtatcgaaacatttcccg
gaagttatttccaacaaggaaatgtgtgaacgcggaacagtccttcgatttgtgaagctt
ttgtgtcatgaaatcaagttgggcggctttaatggaatcgaagcttctgctgttgatagc
atcgaacgatggaatggagagaaaaacgaaattgtgaatgtgattcaaacacgttctacc
attcttcatcgagcatatgcgattcctggcgtggattggaccaaggttatgacaaacgat
atccataatgtcgtaaacactcttggaatcgaagctgcactcactatgatttttaatgaa
ctccactctacattgactgcggatggatcatacattgacccacggcacatcgaacttact
gcaagtacgatgacacttcgtggttatgttatgccactgaaccggcatggtcttaataat
atcaagactggtccacttactcgttcgtcatttgaagaaacaagtgaagtgctaaaggat
gctgcaatttttgcagaatcggaagatgtaagtggttcggtatctgcttccattatgatg
ggacagttgtctgcaatcggaacaggacgatttgatgttcgtattccaaaacctgaatca
atttcggtaaaggaaacatcacgtatcatcaaaacaaagggtaccgcgacactaattcac
aacaaggaagatacgtggtttattccacgagagtccgcatcgtttaaagatagaatccca
tatgtcccatatagtcccaaacgttag
DBGET
integrated database retrieval system