Viruses: 36841070
Help
Entry
36841070 CDS
T40000
Symbol
SOPV-ELK-073, DP163_gp073
Name
(RefSeq) Sea otter poxvirus; RNA polymerase associated protein
KO
K21080
Poxviridae RNA polymerase-associated transcription-specificity factor
Virus
1416741
Sea otter poxvirus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Pox_Rap94
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
36841070
NCBI-ProteinID:
YP_009480611
RS:
NC_037656
UniProt:
A0A2U9QHP3
LinkDB
All DBs
Position
NC_037656:complement(69745..72123)
Genome browser
AA seq
792 aa
AA seq
DB search
MDSKEAILVDIIPKIKNYLDDQNIEPKSYTDFISRNKTIFVVNLYNVSSVTDEDIKLLYA
TIEQNPSADIQTLVSIFSYIGYKFEKTVKENVSVSLSVGERITDDMTYAIYDLFFNMLDL
YIRQRNVNILVNDESSSDVAINYRQSTIVSSFDETMVPTVREIPFSMKDLLSYLAKNLDQ
LRFSKKYLEFAYLCRHIGIPISKRKFNVRYVYSYRVNDIDIPIVIKDYLDVKYVFLQETN
KVYKNSFSEEHNTALVDWGSVLIPRLKGNYIYNYLFLSSYHLKDFFLEILDLKSWSFRQQ
SNDTMIYVEYDNWETGITYEMIPCEHQIKLTEVLKIDIDYFTRINDFVTEFIYYEDGVAY
CSICGMNIPIFNSDAADVVKSNVIISTFNKSIFLSEPYSYFVHSQRFIFNIIMSFDTIMK
SYTWGMKYNINRLILNFLIALNSKRHEYEKKFMTEIKKGVFFLRLTANLFDIHVSASELF
YKAKVLNLNFIVALVIVLNSSADFIITYMKTKNKQVTENTLKYSISTIIYDFLLKTHITD
KGTLDTIILLTDVYTSIMPDELNVHYSRILIELHRLVSIQRNTDPVFYDVESTAETIKER
NIIFFDSAIISAKQLILTHPIQNIIPIQPIPIIEDNEHNKQEFKKLIEVESRVLIRVYDT
NAVNLEIFTEHLKIEIEKKKVIIPLKNLFITNVLKYYFSKTEMIVFKFGDPFPFNPILIS
KEHVRYKINGYNLLRSTLIPKSDIFVYFNDSLNRYDLEFAFYLYLASYVNVSEWINENSS
KIKELYMINYNN
NT seq
2379 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcaaaggaagctattctggtagatataatacctaagataaagaattatttagat
gatcagaatatagagccaaaatcatatacagacttcatatctcgtaataagaccattttt
gttgttaacctttataacgtatcatctgttactgatgaagacattaaattgctatatgct
acaatagaacaaaacccatctgctgatatacaaacactagtatctattttctcttatata
ggatataaatttgaaaagacagtaaaggagaatgtcagtgttagtctatctgtaggtgaa
cgtataactgatgacatgacatatgctatatatgatctatttttcaatatgttagattta
tatatacggcaaagaaatgttaatattctagtaaatgatgaatccagtagcgatgttgct
ataaactatagacaaagtacaattgtttcatcgtttgatgaaacaatggttcctacagtt
agagaaataccatttagcatgaaagacctactgtcatatctggcaaaaaatctagatcaa
ttgagattttctaaaaagtatcttgaatttgcatacttatgcaggcatataggtatacct
atttccaaacggaaatttaacgttcgctatgtgtattcttatagagtaaacgatatagac
atacctattgtaattaaagattatttggatgtgaaatatgtatttctacaggagactaat
aaagtatacaaaaattcattttctgaagaacataatacagcattggtagattggggtagt
gtattgattccaagattaaagggaaattacatttataattacctatttctatctagttat
cacctgaaggattttttcttggaaatactagacttgaaatcatggtcttttagacaacaa
agcaatgacactatgatatacgttgagtatgataattgggaaacaggtatcacatatgaa
atgattccgtgtgaacaccaaattaaattaacagaagtattgaagattgacattgattac
tttactagaataaatgacttcgttacagagttcatatactatgaagatggtgttgcgtat
tgttctatatgtggtatgaatataccaatatttaattcagatgctgcagatgttgttaaa
tcgaatgtcattatatcaacattcaataaatctatattcctcagtgaaccatatagttat
tttgtacatagtcaacgatttatttttaatattataatgtcgtttgatactataatgaaa
tcatatacatggggtatgaaatataatattaatagattgatactaaattttctaatagct
cttaattcaaaacgacacgaatatgaaaaaaaatttatgactgagattaaaaaaggcgta
ttctttttacgtcttactgcaaatttatttgacatacatgtttctgcatcagaacttttt
tataaagcaaaggtattaaatctaaattttatagttgcattggtaatagtcttaaatagt
agcgcagactttataataacatacatgaaaacaaaaaataaacaagtaacagaaaataca
ttaaaatattcaatttcaacaattatatatgactttctacttaagactcacataacagat
aaagggacactcgataccatcattctgctaacagatgtatatacatctataatgcctgat
gaattaaatgttcattattcacgtatactaattgaattacatagattagtatcgatacag
cgaaataccgatcctgtattttatgatgtagagagtacagcagaaacaataaaggaaaga
aatataattttttttgattctgctatcatatctgcaaaacagttaattttgactcatccc
atacaaaatattattcctattcaaccaattcctattattgaagacaatgaacacaacaaa
caagaatttaaaaagttgatagaggtagaatctagagtacttatacgagtatacgataca
aatgctgttaatttagagatatttactgaacatttaaaaatagagatagaaaagaaaaaa
gttataataccattaaaaaatttatttattaccaatgtactaaagtattatttttcaaag
accgaaatgatagtttttaagtttggagatccttttccatttaatccaatattaattagc
aaagaacatgttagatataaaattaatggatataacttacttagaagtacactaattcca
aaaagtgatatatttgtatattttaatgactcattaaacagatatgatttagaatttgca
ttctatctgtatttagcaagttatgtcaatgtatctgaatggataaacgaaaattcttct
aagataaaggagttatatatgattaattataataactaa
DBGET
integrated database retrieval system