Viruses: 37616478
Help
Entry
37616478 CDS
T40000
Symbol
D1P33_gp1
Name
(RefSeq) enterovirus D68; polyprotein
KO
K25281
Enterovirus genome polyprotein
Virus
42789
enterovirus D68
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Rhv
Pico_P2A
RdRP_1
Peptidase_C3
Rhv_5
Pico_P2B
RNA_helicase
Pico_P1A
P3A
Calici_coat
RdRP_4
nSTAND3
AAA_16
NPHP3_N
Zeta_toxin
Torsin
SLFN-g3_helicase
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
37616478
NCBI-ProteinID:
YP_009505605
RS:
NC_038308
UniProt:
Q68T42
Structure
PDB
PDBj
LinkDB
All DBs
Position
NC_038308:733..7299
Genome browser
AA seq
2188 aa
AA seq
DB search
MGAQVTRQQTGTHENANIATNGSHITYNQINFYKDSYAASASKQDFSQDPSKFTEPVVEG
LKAGAPVLKSPSAEACGYSDRVLQLKLGNSAIVTQEAANYCCAYGEWPNYLPDHEAVAID
KPTQPETSTDRFYTLRSVKWESNSTGWWWKLPDALNNIGMFGQNVQYHYLYRSGFLIHVQ
CNATKFHQGALLVVAIPEHQRGAHDTTTSPGFNDIMKGERGGTFNHPYVLDDGTSIACAT
IFPHQWINLRTNNSATIVLPWMNVAPMDFPLRHNQWTLAVIPVVPLGTRTMSSVVPITVS
IAPMCCEFNGLRHAITQGVPTYLLPGSGQFLTTDDHSSAPVLPCFNPTPEMHIPGQIRNM
LEMIQVESMMEINNTDGANGMERLRVDISVQADLDQLLFNIPLDIQLDGPLRNTLVGNIS
RYYTHWSGSLEMTFMFCGSFMATGKLILCYTPPGGSCPTTRETAMLGTHIVWDFGLQSSI
TLIIPWISGSHYRMFNSDAKSTNANVGYVTCFMQTNLIVPSESSDTCSLIGFIAAKDDFS
LRLMRDSPDIGQSNHLHGAEAAYQVESIIKTATDTVKSEINAELGVVPSLNAVETGATSN
TEPEEAIQTRTVINQHGVSETLVENFLGRAALVSKKSFEYKNHASSSAGTHKNFFKWTIN
TKSFVQLRRKLELFTYLRFDAEITILTTVAVNGNNDSTYMGLPDLTLQAMFVPTGALTPK
EQDSFHWQSGSNASVFFKISDPPARMTIPFMCINSAYSVFYDGFAGFEKNGLYGINPADT
IGNLCVRIVNEHQPVGFTVTVRVYMKPKHIKAWAPRPPRTMPYMSIANANYKGRDTAPNT
LNAIIGNRASVTTMPHNIVTTGPGFGGVFVGSFKIINYHLATIEERQSAIYVDWQSDVLV
TPIAAHGRHQIARCKCNTGVYYCRHRDRSYPICFEGPGIQWIEQNEYYPARYQTNVLLAA
GPAEAGDCGGLLVCPHGVIGLLTAGGGGIVAFTDIRNLLWLDTDVMEQGITDYIQNLGNA
FGAGFTETISNKAKEVQDMLIGESSLLEKLLKALIKIISALVIVIRNSEDLITVTATLAL
LGCHDSPWSYLKQKVCSYLGIPYVPRQSESWLKKFTEACNALRGLDWLSQKIDKFINWLK
TKILPEAREKYEFVQRLKQLPVIEKQVSTIEHSCPTTERQQALFNNVQYYSHYCRKYAPL
YAVESKRVAALEKKINNYIQFKSKSRIEPVCLIIHGSPGTGKSVASNLIARAITEKLGGD
IYSLPPDPKYFDGYKQQTVVLMDDLMQNPDGNDISMFCQMVSTVDFIPPMASLEEKGTLY
TSPFLIATTNAGSIHAPTVSDSKALSRRFKFDVDIEVTDSYKDSNKLDMSRAVEMCKPDN
CTPTNYKRCCPLICGKAIQFRDRRTNARSTVDMLVTDIIKEYRTRNSTQDKLEALFQGPP
QFKEIKISVAPDTPAPDAINDLLRSVDSQEVRDYCQKKGWIVIHPSNELVVEKHISRAFI
TLQAIATFVSIAGVVYVIYKLFAGIQGPYTGIPNPKPKVPSLRTAKVQGPGFDFAQAIMK
KNTVIARTEKGEFTMLGVYDRVAVIPTHASVGEIIYINDVETRVLDACALRDLTDTNLEI
TIVKLDRNQKFRDIRHFLPRCEDDYNDAVLSVHTSKFPNMYIPVGQVTNYGFLNLGGTPT
HRILMYNFPTRAGQCGGVVTTTGKVIGIHVGGNGAQGFAAMLLHSYFTDTQGEIVSNEKS
GMCINAPAKTKLQPSVFHQVFEGSKEPAVLNSKDPRLKTDFEEAIFSKYTGNKIMLMDEY
MEEAVDHYVGCLEPLDISVDPIPLENAMYGMEGLEALDLTTSAGFPYLLQGKKKRDIFNR
QTRDTSEMTKMLEKYGVDLPFVTFVKDELRSREKVEKGKSRLIEASSLNDSVAMRVAFGN
LYATFHNNPGTATGSAVGCDPDIFWSKIPILLDGEIFAFDYTGYDASLSPVWFACLKKVL
IKLGYTHQTSFIDYLCHSVHLYKDRKYVINGGMPSGSSGTSIFNTMINNIIIRTLLIKVY
KGIDLDQFKMIAYGDDVIASYPHKIDPGLLAEAGKHYGLVMTPADKGTSFIDTNWENVTF
LKRYFRADDQYPFLIHPVMPMKEIHESIRWTKDPRNTQDHVRSLCYLAWHNGEEAYNEFC
RKIRSVPVGRALTLPAYSSLRRKWLDSF
NT seq
6567 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggagctcaagttactagacagcaaactggaactcatgagaatgctaacattgctaca
aatggatcccatattacatacaatcagataaatttttacaaggatagttatgcagcttca
gccagcaagcaagacttttcacaggatccatcaaaattcactgaaccagtggtggaaggc
ttaaaagcaggggcaccagttttgaaatctcctagcgctgaggcttgtggctacagtgat
agagtactacaactcaaattgggcaactcagctattgtcactcaagaagcagcaaactac
tgttgcgcttatggtgaatggcctaattatttaccagatcatgaagcagtagctattgat
aaacctacacaaccagaaacttctacagacagattttatactttaagatcagtcaaatgg
gagagtaatagcacaggatggtggtggaaactacctgatgcattaaacaacataggcatg
tttggacaaaatgtacaatatcactacctatacagatctggcttcttaattcatgtgcag
tgcaacgctacaaagttccatcaaggcgcgctgttggtggtagcaataccagagcatcag
agaggggcacacgacaccaccactagtccagggtttaatgatatcatgaaaggtgaaaga
ggagggacgtttaaccacccatatgttcttgatgatggaacatcaatagcttgtgcgaca
atatttccacatcaatggataaatctaagaaccaacaattcagcaacgattgttcttcca
tggatgaatgttgcaccaatggactttccacttagacacaatcagtggacactagcagta
ataccagtggttccattgggtacacgcacaatgtcaagtgttgtcccaataacagtttca
attgcccctatgtgttgtgagtttaacggactcaggcacgccatcacccagggtgttcca
acatatcttctaccaggttcaggacaatttctgactactgatgaccatagctcagcacca
gtcctcccgtgtttcaacccaactccagaaatgcacattccagggcaaatccgcaacatg
ttggaaatgattcaagtggaatcaatgatggagattaacaatacagacggcgcaaatggc
atggagcgtctcagagttgacatatcagtacaagcagatcttgatcagttattatttaac
attccactagatatacaactggatggaccacttagaaacactttagtagggaacatatcc
agatattatactcattggtctggatctctagaaatgacattcatgttttgcggtagtttt
atggcaacagggaaattgatcctatgttacacacctccaggtggatcatgcccaacaact
agagaaactgccatgttaggcactcacatcgtctgggactttggattacaatctagtatc
accttaataataccttggattagtggatcccactacaggatgttcaatagcgacgctaag
tcaaccaatgctaatgttggctatgtaacctgtttcatgcagaccaacctgatagtcccc
agtgagtcctctgatacttgttctttaataggattcatagcagcaaaagatgacttttcc
ctcaggttaatgagagatagtccagatattggacaatcaaaccacttacatggagcagag
gcagcctatcaggtggagagtatcatcaaaacagcaactgatactgtgaagagtgagatt
aacgccgaacttggtgtggtccctagtctaaatgcagttgaaactggtgcaacttccaac
actgaaccagaagaagccatacaaactcgcacagtaataaatcagcatggtgtgtcggag
acgttagtggagaattttcttggtagggcagccctagtgtcaaagaaaagttttgaatac
aagaatcatgcctcatccagcgcagggacacacaaaaacttttttaaatggacaattaat
actaagtcttttgtccagttaagaagaaagctggaattattcacataccttaggtttgat
gctgaaatcaccatactcacaactgtggcagtaaatggtaataatgacagcacatacatg
ggtctccctgacttgacactccaagcaatgtttgtaccaactggtgctcttactccaaag
gagcaggattcatttcattggcaatcaggcagtaatgctagtgtgttctttaaaatttct
gatcccccagctagaatgactataccttttatgtgcatcaactcagcatattcagttttt
tatgatggctttgctggatttgagaaaaatggtctatatggaataaacccagctgacact
attggcaacttgtgtgtcagaatagtgaatgaacatcaaccagttggttttacagtgacc
gttagggtttacatgaagcctaaacatataaaagcatgggctccacgaccaccgcgaacc
atgccatacatgagcattgctaatgcaaattacaaaggtagagatacagcaccaaacaca
cttaatgccataattggtaatagagcgagtgtcacaactatgcctcacaacatagtaacc
accggtccaggttttgggggagtctttgtagggtcctttaagataattaactatcactta
gccacaatagaagagagacaatcagccatctatgtggactggcaatcagatgttctagtc
acccccattgccgctcatggtagacatcaaatagcaagatgcaagtgtaatacaggggtt
tactattgccggcacagagatagaagctacccaatttgctttgaaggtccaggaattcaa
tggattgaacaaaatgaatactacccggcaagataccagactaatgtacttctagcagct
ggccctgcagaagcaggagattgtggtggtctattagtctgcccacacggggtgattggc
ctccttacagcaggagggggtgggattgtagccttcacagacatcagaaatttactgtgg
ttagatactgatgttatggaacaaggtattactgattacatacaaaatcttggtaatgct
tttggagcaggattcacagaaacaatctccaataaggctaaggaagtgcaagacatgtta
attggagagagttcattattggaaaaattactaaaagctctaatcaaaattatatcagca
ctggtgattgtcattagaaattcagaagatttgataacagttacagctacactagcattg
ttagggtgtcatgactcaccatggagctacttgaagcaaaaagtatgctcatacttgggt
attccctatgtgcctagacaaagtgaatcatggcttaagaagttcacagaggcgtgcaat
gctcttaggggtttagattggctatcacaaaagatagacaagttcattaattggctcaaa
actaaaatattaccagaggctagggagaaatatgaattcgtgcaaagactcaagcagcta
ccagtaatagaaaaacaagttagcactattgagcatagttgcccaacaacagaacgacaa
caggccttattcaacaatgttcagtattactcacattactgtaggaagtacgcaccactt
tacgcagtggaatcaaaaagagtggccgctcttgaaaagaaaataaacaattacatccag
ttcaagtccaaatctcgcattgaaccggtttgtttaataatacacggctccccaggaact
ggcaaatcagtagcctcaaatttaattgctagagctatcacagaaaaattaggcggggac
atttactccctacccccagaccctaaatactttgatggatataaacagcaaacagtagtc
cttatggatgatttaatgcaaaatccagatgggaatgatatatctatgttttgccaaatg
gtttcaactgtggattttattcctccaatggctagtttggaagagaaaggaactctatat
accagtccattcttaatagccactactaatgctggttcaatacatgcaccaacagtctca
gactcaaaggctttgtcacgcagattcaaatttgatgtggacattgaagttacagattca
tacaaagactcaaacaaactagacatgtccagagcagtggaaatgtgcaaaccagataac
tgtacccctactaattataaaagatgctgcccactgatttgcggaaaagctattcaattt
agagatcgtagaaccaatgcaagatccacggttgatatgctagtgactgacattattaag
gaatacagaaccaggaatagcacacaagacaaattagaagccctatttcaaggacctcca
caattcaaggagattaaaatctcagtcgctccagacacaccagcccctgatgccataaat
gaccttcttaggtcagtggactctcaagaagttagagattattgtcaaaagaaggggtgg
attgtaatacacccgtcaaatgagctagttgtagaaaaacatattagtagagctttcatc
actctgcaagctattgccacctttgtatcaatagctggtgtggtctatgttatatacaaa
ctttttgctggtattcagggcccatatacaggaattcctaatcctaaacccaaagtgccc
tctcttagaacagccaaagtgcaaggaccaggatttgattttgcgcaagccataatgaag
aaaaatactgttattgctagaactgaaaaaggcgagttcacaatgcttggtgtgtatgat
agagtggcagtcattccaacacatgcatctgttggagaaatcatttacatcaacgatgta
gaaaccagagttctagatgcatgtgcacttagagacttgacagacacaaacctagaaata
actatagtcaaattggatcgcaatcaaaaatttagagacatcagacactttttacccaga
tgtgaggatgattacaatgatgctgtgcttagtgtacatacatcaaaattccctaacatg
tacattccagttggacaagtcactaactacggcttcttgaacctgggcggcacaccaaca
catcggattttaatgtataattttccaacaagagctggtcagtgtggtggtgtggtgaca
accacaggtaaagtgataggaatacacgtgggcgggaatggagctcagggattcgcagca
atgttgctccactcttactttactgatacacaaggtgagatagttagcaatgagaagagt
gggatgtgtattaatgcaccagcaaaaacaaaactccaacccagtgtcttccatcaagtt
tttgaaggttcaaaggaaccagcagtactcaattcaaaagatcctagactcaagactgat
ttcgaggaggctattttctcaaaatatacaggtaacaaaattatgttaatggatgagtac
atggaagaagcagtggatcattatgtgggatgtttagaaccactggatattagtgtagat
cccataccccttgaaaatgctatgtatggaatggagggtcttgaagcattggacttaacc
accagtgcgggcttcccttatttgttacaagggaaaaagaaaagggacatattcaacaga
caaaccagagatactagtgagatgacaaagatgttggaaaaatacggagttgacctacct
ttcgtgactttcgtgaaagacgagcttagatcaagagagaaagtcgaaaaggggaagtca
cgcctgattgaagccagttccttgaacgactcagttgccatgagggttgcctttggaaat
ctctacgctacatttcataacaatccaggcacagcaactggtagtgcagttggttgtgat
ccagatatattctggtcaaaaatccctattttgttagatggagagatttttgcttttgat
tacactggttatgacgctagtttatcaccagtgtggtttgcctgtttgaaaaaggttctg
attaaattaggttacacccaccaaacatcttttatagattatctatgccactcagtgcat
ttgtacaaggatagaaaatatgtaattaatggtggaatgccctctggttcttcaggtact
agtatatttaacactatgattaataacataattataagaactttattaattaaggtttac
aaaggcatagatctggaccagtttaaaatgatagcatacggagatgatgttattgctagt
tacccacacaaaattgatccaggtttattagcagaagcaggcaagcactatggattggta
atgacaccagcggacaaaggtaccagtttcattgacactaattgggaaaatgtaactttt
ttgaaaagatacttcagagcagatgatcaatacccctttcttatacatccagtgatgcca
atgaaagagatacatgaatctattagatggactaaagatcccagaaacacacaagatcat
gttagatccttgtgttacctggcgtggcataatggagaagaggcttacaatgaattttgt
agaaaaattagaagtgtgcccgtggggagggcattgacactacctgcatattctagtctt
agacggaaatggttagattcgttttag
DBGET
integrated database retrieval system