Viruses: 37616490
Help
Entry
37616490 CDS
T40000
Symbol
D1P40_gp1
Name
(RefSeq) Rodent hepatovirus CIV459Lopsik2004; polyprotein
KO
K27798
Hepatovirus genome polyprotein
Virus
1987141
Rodent hepatovirus CIV459Lopsik2004
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
RdRP_1
HAV_VP
Rhv
RNA_helicase
RdRP_4
Peptidase_C3
Peptidase_C3G
Rhv_5
Calici_coat
RdRP_2
7TM_GPCR_Srx
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
37616490
NCBI-ProteinID:
YP_009505612
RS:
NC_038314
UniProt:
A0A0S1M3C3
LinkDB
All DBs
Position
NC_038314:550..7269
Genome browser
AA seq
2239 aa
AA seq
DB search
MEHFGLLQTLGEGVDKILTLSDLEQEQVMQTPDRVSVAGASYFTSVDQSSVHSSVVGSHQ
DERLLTSVDMPASKKTQGERFFLIHTAEWTTTNANLNEIAKLDVVKLLYNQQFSVDGFLK
YHTYARFGVEVQVQINPTSFQQGGLICALVPADQGYGSLTCLTCYPHGLLNCNINNVVRI
KVPFVYTRGAYNLREPQYPIWELTIRVWSPLHIGTGTSTYVTVNVLARLTDLELHGLTPV
SQMMRNEFRVSTTDNVMNLCNYEDARAKISLALDQESWRSDLSEAGGVKISNFSSWTSIP
TLAAQFAFNASATVGQQIKIIPVDPYYYTIHTESPEQKCVTALASISQMFCFWRGDIVFD
FQIFPTKYHSGRLLFCFYPGHENLDVSRVTLQQATSSPCAVMDITGIQSTLRFRVPWISD
TPYRVNRYTKSAHVKGEYTAIGKLIVFCYNRLSHPSNVANFVSINVYMSAVNLECFAPIY
HNMTYQAQAGDDSFSSTPEIEQNAPDEFGGITTPKDLKGKANSGKMDLAAGRVPAGTVTI
LEDPLLAKKTPQTFPERAPGVSRHTSDHMNIYKYMGRAHFLCTFTFTSNNKVYTFPLTLS
ATQDPPHGLPSTLRWFFSLFHLYRGPLDLSIAIDGATDVDGMIWFTPVGLASDTIWTEKA
SELSIDYKSSLGGVKFNTRRTGNVQLRLPWYTYLYAISANLDGTGDASDSTFGMLSIQIS
NYTSTDEYLSFSVYLSVTEESQFLFLRAPMNNGVLKESDGRMSVRARRALGDLESSVDDP
RSDSDKKFEQEISNEIGPVEQIPSNTKLGQVYKDLRMDVGKLRMKYAQESLRKRKERETN
FVSQSSFQDFLLLGKKTCPYRAFTFDGDIWVLNTPGYIQRKWGGNIKAFVKYNNSGDPGL
DFLDWTVLPTDMKILQALSNLTQNRRLLDIEIMVKIFDYEKLDERFGECVSNAPWSFLGV
ELSTYFLNFFRCTNESKSVISKLMDASNSSEEFLSEFRSLSSEVNGFLDTVKSAVSGFVF
ELSEKKWMWILRTVLRMIRSGTFIWMANRIENGSKLYMGMLALELVDLGIDIVDAGMWFS
VILKRQFEFKCDDKMMGLRSEASSLAEFLRNAVCGVSLFKSAKDAIIWLYDKVKDWYDEN
YGLKRQALVALMKHQEDLENVLSLVDDYCVTVVQESNKEQMCTTGLKILRCLRTFYSLTS
GMDDLKSYMHPIQDAITKVHMKVRNIGHINQTVVSRPEPVVCYMYGERGGGKSLTSMALA
VRICKLMKVDPKKNIYTKPVGSDYWDGYCGQMVCIMDDMGQNTDDEDWQNFCQLVSGCPL
RLNMAALEEKGRHFVSPFIICTSNQSDPCPKTIYVKEAITRRLHFKVEVTPKNDYVCGNN
MLDVEKAKMDGQIAEMSCVNIVSNCSRYTLLSLADEMVGCVQSRTKNMEEFMSLWSQAFY
DGENVSIDAEIEELLRVPKASAVRIHLRKMFEAVKQNKWWLLGAALGVCGLAFGAWKSYK
WFTSSTELESDGVYHGVTKPKNVVKLDQPVRPESQSIIEISNLVHKNLCRFGIGKKNGEQ
IWVLNCLGLKDDYVLIPSHAYQFDTNKEEFLFEREHVVYSISPGNVEVYSLDTGLQDVVI
MRVPNMPKFRDITSHFIKRKDLDDVTNKMATLCTNYRGVYQMIAEGPVSIEKMGTYTHVD
SEGNKHELTVNDIIRGKAHTLPGMCGGAVVSSNQKLQNPIIGIHVAGGHGNTMAKVVWQE
MFEVINTKVLHSQRIRKVEFSQRKLNVGTKTLFHKSPIYDLVSKNLINYPASLPFSKQND
IDPIQVMLSKYDTKMVDEPDCWHSAIEAFKVDACAGFKQNKRLTIREAILGVGGMDGINM
KSSPGIPYVFEHFRKEDLIEIDGDSCVLHPWLESRIKNNAIMMEKGGSLDVVYATSPKDE
LRPLEKVCCGKTRAIEVCPVDFTILCRVMWGEAIVYFQSNPSFTTGIAVGIDPDTDWDSL
FRAMCLFGDKGMDLDFSGFDASLSPFMIWSAVRILGEMCGNAEIHDQSLFRSISNSVHQM
CDLIFHVEGGMPSGTPCTSLLNSIVNCLCLYYVFSKALGVSCFDVKSVVKWITYGDDVLI
VFNRDVDINFDSLCPEIMEQFSMLGLSATSSEKGVPRVVSLGELTFLKRKFHFEDDRFRP
SINEKTIWSLVAWKRSDADFIQNLETASWFAFLKGFEYYSKFSEQLEAKLDIAKVEYKLK
PYAYWLSRFKQLEFCRDMN
NT seq
6720 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaacattttggcttactacaaactttgggagaaggtgttgacaaaattttgactctt
tcagacttggaacaggaacaagttatgcaaacccctgatagagtgagtgttgctggtgca
agttattttactagtgttgatcagtctagtgttcattctagtgtagttggttcacatcag
gatgaaaggttgttgacttctgttgacatgccagcatcaaagaaaactcagggtgaaaga
tttttcctcattcacacagctgagtggactacaacaaatgccaatttaaatgaaattgca
aaattggatgtggtgaaattgttatataatcaacagttctctgtggatgggttcttgaag
tatcatacttatgccagattcggagtggaggtacaagttcagattaatcctactagtttt
caacagggtggtttgatttgtgcattagtgcccgctgatcaaggttatggttcacttaca
tgtttaacttgttatcctcatggtttgttaaattgcaatataaataatgttgttagaatt
aaagtaccttttgtttatactagaggagcatataatttgagagaaccacaatatcctatt
tgggagttgactataagagtgtggagtcccttgcatattggaactggaacatcaacctat
gtgactgtaaatgtcttagcaaggttaactgacttggagctacatggtctaactccagtg
tcccagatgatgagaaatgagttcagagtttcaacaactgataatgtgatgaatttgtgt
aattatgaagatgctagagccaaaatatctctagctttggatcaagagtcatggaggagc
gacctatctgaagcaggaggtgtgaagatttcaaatttttcttcttggacatcaattcca
acattagcggcgcagttcgcttttaatgcttcagccacagtgggacagcaaatcaagatc
attcctgtggatccatactactataccattcacactgaaagtcctgaacaaaagtgtgtt
actgctttggcatcaattagccaaatgttctgtttttggaggggagacattgtttttgat
ttccaaatattccccaccaaatatcattcaggacgattgttgttttgtttttacccaggt
catgaaaatttagatgtctcaagagtgactttgcaacaggctacttcatcaccttgcgcg
gttatggatataactggcattcaatcaacattaagatttagagtaccatggattagtgac
accccataccgtgtgaataggtacacaaaatcagctcatgtgaaaggagagtacactgca
attggaaaacttatagtgttttgttataacagactcagtcacccgtcgaatgttgcaaat
tttgtgtcgataaatgtgtacatgagcgcagtgaatttggagtgctttgcccctatttat
cataacatgacttatcaagcacaggcaggtgatgattctttcagctctaccccagaaata
gaacagaatgcccctgatgagtttggtggtataacaacacccaaggatctgaaaggaaag
gccaactcagggaaaatggaccttgcagccggtcgtgtacctgctggaactgtgactata
ctggaagatcctttgttggcaaagaaaactccccaaactttcccggagagagctcctgga
gtgtcaagacacacttcggatcatatgaatatatacaagtacatgggtagggcacacttc
ttgtgcacttttactttcacttcaaataataaggtatacacatttcccttaactttgtca
gctacacaagacccaccccatggcttgccatcaactttgagatggttcttttctttgttt
cacttgtatagaggacctttagatttatctattgctattgatggagcaactgatgttgat
ggaatgatttggttcacccctgttgggttggcgtcggacactatctggacagaaaaggca
tctgagctctcaattgactacaagagttcgcttggtggtgtgaagtttaatacaagaagg
accggaaatgttcagttgcgcttgccctggtatacatatttgtatgctatcagtgcaaat
ctggatggaactggtgatgcaagtgattcaacttttgggatgttgtccattcagatttca
aattacactagcactgatgagtatttgtccttttctgtgtacctttcagtgactgaagaa
tcgcaatttctttttctaagggccccaatgaataatggtgttttaaaagagtctgatgga
agaatgtctgttagagctaggagggctctgggtgatctagagtcttctgttgatgatcca
agatcggactcagataaaaaatttgaacaagaaatttcaaatgaaatagggccagtcgaa
caaattccttcaaatacaaaacttggtcaggtttacaaagatttgagaatggatgtgggg
aagttgaggatgaagtatgcacaagaatctctaaggaaacgaaaagagagagaaacaaat
tttgtttcccagtcatcattccaggattttctcctccttggaaagaaaacatgcccatac
agggcattcacatttgatggtgatatctgggttttgaacacaccgggttacattcaaagg
aagtggggaggaaacattaaagcctttgtcaagtacaataatagtggcgatcctgggttg
gatttcctagattggactgttttgcccactgatatgaaaattttacaagcattatcaaat
ttgactcaaaatcgtcgcctactggatatagaaattatggtaaagatctttgattatgaa
aagctggatgaaaggtttggtgaatgtgtgtcaaatgctccttggtcttttcttggtgtt
gaattgtcaacttattttttaaatttttttagatgtacaaatgagtctaaaagtgtgatc
tcaaaattgatggacgcttctaattctagtgaggaatttctttctgagtttaggtctttg
tcttctgaagttaatggttttttggatactgtcaagtctgctgtgtctggctttgtgttt
gaattgtcagagaaaaaatggatgtggattctgaggactgttttgagaatgatacgatct
ggaacattcatatggatggcaaatcggatagagaacggttcgaagctatacatggggatg
ttggctttagaactagttgatttgggcattgacatagttgatgccgggatgtggttttct
gtaatattgaagcgacagtttgaattcaagtgtgatgacaagatgatggggttaagatct
gaggcatcaagccttgctgaatttctgagaaatgcagtttgtggagtgtctttgttcaag
tctgcaaaagatgcaataatctggctttatgataaagtaaaggactggtatgatgaaaat
tatggactgaaacgccaggctcttgtggcgttgatgaagcatcaggaggatctggagaat
gtgctgtctcttgtggatgattattgtgtgacagtggtccaggaatcaaacaaagaacaa
atgtgtaccactggtttgaaaattcttagatgcttgagaaccttctatagtttgacatct
ggaatggacgatttgaaaagctacatgcatcccatccaagatgctataaccaaagttcac
atgaaagttagaaatattgggcacataaatcaaactgtagtgtcaagaccagagccagtt
gtctgttacatgtatggtgaaagaggtggtggtaaatctttaacatctatggcgctggct
gtcagaatttgcaagctaatgaaagttgatccaaagaaaaacatatacacaaaaccagtt
ggttctgactactgggatggttattgtggacaaatggtgtgtatcatggatgacatggga
cagaataccgatgatgaagactggcagaatttctgccagttggtgtctggctgtccatta
aggttgaatatggctgcactggaagagaagggcagacattttgtctcgcctttcataata
tgtacatctaaccagtcagacccttgtccaaaaaccatctatgtaaaagaggccataaca
agaagactccacttcaaggttgaggtaactccaaaaaatgactacgtctgtggaaataat
atgttggatgtggaaaaagcaaagatggatggtcaaatcgctgaaatgtcatgtgtaaac
attgtgtcaaattgcagcagatacactctactatcattggctgatgaaatggtggggtgt
gtacagtctagaaccaaaaatatggaagagtttatgagtctgtggtcacaagctttctat
gatggtgagaatgtctccattgatgccgagattgaagaactgttgagagtgccaaaggcc
tcggctgtgagaatccatttgaggaaaatgtttgaagctgtgaagcagaataaatggtgg
ttgttgggggcagccctaggtgtgtgtggtcttgcttttggtgcgtggaaaagttacaag
tggtttacttcaagcactgaattggaatcagatggagtctatcatggtgtgacaaaacct
aaaaatgtagtcaagttggatcaacctgttcgaccagaatctcaatcgattattgaaatt
tctaatttagtacacaaaaatttgtgtcgatttggaattggaaaaaagaatggagaacaa
atatgggtgttgaattgtcttggattaaaagatgattatgtgctgataccctcacatgct
taccagtttgatactaataaggaagaatttttgtttgagcgtgaacatgtagtatactcc
atatcacctgggaacgtggaagtgtattctctggacactggattgcaggatgttgttatt
atgagggtccctaacatgcctaagtttagagacataacatctcattttataaaaagaaaa
gatctggatgatgtcacaaataaaatggcaaccttgtgcactaattataggggtgtttac
caaatgatcgcagaagggccagtttcaattgaaaagatgggaacatacacacacgttgat
tctgaaggtaataaacatgaattgacagtaaatgatataattagagggaaggcacatacc
ttgcctggaatgtgtggtggagcagtggtctctagcaatcaaaaacttcaaaatccaata
attgggattcacgtggcggggggtcacggtaacactatggcaaaagtagtgtggcaggaa
atgtttgaggttatcaatacaaaggtgcttcattcacagaggattagaaaagttgagttt
tcacaacgcaaactaaatgtgggtacaaaaacgctttttcataaaagccccatttatgat
ttggtttcaaaaaatttgattaactaccctgcttcactccccttctctaaacagaatgat
attgatcccattcaagtcatgctttcaaaatatgacacgaagatggttgatgaacctgat
tgttggcatagtgcaattgaagcttttaaagtggatgcttgtgctgggtttaaacaaaat
aaaaggctgacgatcagggaggctattcttggtgttggaggaatggatggaataaacatg
aagtcttctcctgggataccgtatgtgtttgaacactttagaaaggaggatctgattgaa
atagatggtgactcttgtgtgctacatccatggcttgagagcagaatcaaaaacaatgca
ataatgatggaaaaaggaggaagtcttgatgttgtttacgccacgtctcctaaggatgaa
ctgaggccactggagaaagtgtgttgtgggaaaacacgagcaattgaagtgtgcccggtg
gattttaccatcttgtgtagagtgatgtggggagaggcaattgtctacttccaatctaat
ccatctttcacaactggtattgctgttggaattgatccagacacagactgggattcattg
tttagagctatgtgtttgtttggtgataaggggatggatttggatttttccggctttgat
gcttccttaagccctttcatgatttggagcgctgtacgcattcttggagaaatgtgtgga
aatgcagaaattcatgaccaatcactgtttagatccatttctaatagtgttcatcaaatg
tgtgatttaattttccatgttgagggtggaatgccttcaggcaccccatgcacttcattg
ctaaattccattgtgaattgtttgtgtttgtattatgttttttctaaggcattgggggtg
tcttgttttgatgtcaagagtgtggtgaagtggataacatatggtgatgatgttctgatt
gtctttaacagagatgtggatataaattttgattctttgtgccctgaaataatggaacag
ttttcaatgttgggactgagtgcaacatcttctgagaagggagtcccgagggttgtttca
ttgggtgagttaacttttttaaagagaaaatttcactttgaggatgatcgttttcgtccg
tctattaatgagaagacaatttggtccttagtcgcttggaagcggagcgacgcagatttt
atccaaaatttagaaacagcctcctggtttgcatttctaaagggatttgaatattattca
aagtttagtgagcagttggaggcaaaattggatattgcaaaagtggaatataaactaaaa
ccttatgcctattggctctcaagattcaaacagttggaattttgtagagatatgaattag
DBGET
integrated database retrieval system