KEGG   Viruses: 37616500
Entry
37616500          CDS       T40000                                 
Symbol
polyprotein, D1P45_gp1
Name
(RefSeq) parechovirus A1; hypothetical protein
Virus
12063  parechovirus A1
SSDB
Motif
Pfam: RdRP_1 Peptidase_C3 Picorna_P3A RNA_helicase Parecho_VpG Rhv RdRP_4 NPHP3_N LRAT NACHT nSTAND3 DUF6116
Other DBs
NCBI-GeneID: 37616500
NCBI-ProteinID: YP_009505617
RS: NC_038319
LinkDB
Position
NC_038319:710..7252
AA seq 2180 aa
METIKSIADMATGVVSSVDSTINAVNEKVESVGNEIGGNLLTKVADDASNILGPNCFATT
AEPENKNVVQATTTVNTTNLTQHPSAPTMPFSPDFSNVDNFHSMAYDITTGDKNPSKLVR
LETHEWTPSWARGYQITHVELPKVFWDHQDKPAYGQSRYFAAVRCGFHFQVQVNVNQGTA
GSALVVYEPKPVVTYDSKLEFGAFTNLPHVLMNLAETTQADLCIPYVADTNYVKTDSSDL
GQLKVYVWTPLSIPTGSANQVDVTILGSLLQLDFQNPRVFAQDVNIYDNAPNGKKKNWKK
IMTMSTKYKWTRTKIDIAEGPGSMNMANVLCTTGAQSVALVGERAFYDPRTAGSKSRFDD
LVKIAQLFSVMADSTTPSENHGVDAKGYFKWSATTAPQSIVHRNIVYLRLFPNLNVFVNS
YSYFRGSLVLRLSVYASTFNRGRLRMGFFPNATTDSTSTLDNAIYTICDIGSDNSFEITI
PYSFSTWMRKTNGHPIGLFQIEVLNRLTYNSSSPSEVYCIVQGKMGQDARFFCPTGSVVT
FQNSWGSQMDLTDPLCIEDDTENCKQTMSPNELGLTSAQDDGPLGQEKPNYFLNFRSMNV
DIFTVSHTKVDNLFGRAWFFMEHTFTNEGQWRVPLEFPKQGHGSLSLLFAYFTGELNIHV
LFLSERGFLRVAHTYDTSNDRVNFLSSNGVITVPAGEQMTLSAPYYSNKPLRTVRDNNSL
GYLMCKPFLTGTSTGKIEVYLSLRCPNFFFPLPAPKVTSSRALRGDMANLTNQSPYGQQP
QNRMMKLAYLDRGFYKHYGIIVGDHVYQLDSDDIFKTALTGKAKFTKTKLTSDWVIEEEC
ELDYFRIKYLESAVDSEHIFSVDKNCETIAKDIFGTHTLSQHQAIGLVGTILLTAGLMST
IKTPVNAVTIKEFFNHAIDGDEQGLSLLVQKCTTFFSSAATEILDNDLVKFIVKILVRIL
CYMVLYCHKPNILTTACLSTLLIMDVTSSSVLSPSCKALMQCLMDGDVKKLAEIVAESMS
NTDDDEVKEQICDTVKYTKTILSNQGPFKGFNEVSTAFRHIDWWIHTLLKIKDMVLSVFK
PSIESKAIQWLERNKEHVCSILDYASDIIVESKDQSKMKTQDFYQRYSDCLAKFKPIMAI
CFRSCHNSISNTVYRLFQELARIPNRISTNNDLIRIEPIGIWIQGEPGQGKSFLTHTLSR
QLQKSCKLNGVFTNPTASEFMDGYDNQDIHLIDDLGQTRKEKDIEMLCNCISSVPFIVPM
AHLEEKGKFYTSKLVVATTNKSDFSSTVLQDSGALKRRFPYIMHIRAAKAYSKAGKLNVS
QAMATMSTGECWEVSKNGRDWETLKLKDLVDKITIDYNERVKNYNAWKQQLENQTLDDLD
DAVSYIKHNFPDAIPYVDEYLNIEMSTLIEQMEAFIEPKPSVFKCFANKIGSKISKASRE
VVDWFSDKIKSMLSFVERNKAWLTVVSAVTSAISILLLVTKIFKKEESKDERAYNPTLPV
AKPKGTFPVSQREFKNEAPYDGQLEHIISQMAYITGSTTGHMTHCAGYQHDEIILHGHSI
KYLEQEDELTLHYKNKVFPIEQPSVTQVTLGGKPMDLAILKCKLPFRFKKNSKYYTNKIG
TESMLIWMTEQGIITKEVQRVHHSGGIKTREGTESTKTISYTVKSCKGMCGGLLISKVEG
NFKILGMHIAGNGEMGVAIPFNFLKNDMSDQGIVTEITPIQPMYINTKTQIHKSPVYGAV
EVKMGPAVLSKSDTRLEEPVECLIKKSASKYRVNKFQVNNELWQGVKACVKSKFREIFGM
NGIVDMKTAILGTSHVNSMDLSTSAGYSFVKSGYKKKDLICLEPFSVAPLLERLVQDKFH
NLLKGNQITTTFNTCLKDELRKLDKIASGKTRCIEACEVDYCIVYRMIMMEIYDKIYQTP
CYYSGLAVGINPYKDWHFMINALNDYNYEMDYSQYDGSLSSMLLWEAVEVLAYCHDSPDL
VMQLHKPVIDSDHVVFNERWLIHGGMPSGSPCTTVLNSLCNLMMCIYTTNLISPGIDCLP
IVYGDDVILSLDKEIEPEKLQSIMADSFGAEVTGSRKDEPPSLKPRMEVEFLKRKPGYFP
ESTFIVGKLDTENMIQHLMWMKNFSTFKQQLQSYLMELCLHGKDTYQHYIKILEPYLQEW
NITVDDYDVVITKLMPMVFD
NT seq 6543 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggagacaattaagagtattgcagatatggctactggtgttgtaagttctgttgattct
accatcaatgcagtcaatgaaaaggtagaaagcgtcggtaatgaaattggaggtaatttg
ttaactaaagtagctgatgatgcttccaatatcctaggaccaaattgttttgcaacgact
gctgaaccagagaacaagaatgtagttcaagccactactactgttaatactaccaacttg
actcaacatccatcggcacctacgatgcccttttcaccagatttctccaatgtcgacaat
tttcactctatggcttatgacatcacaactggggacaaaaatcccagtaaattggttcgt
cttgaaacccatgagtggacgccatcttgggcaagaggataccagattacacatgtagaa
ttacctaaagttttttgggatcaccaagacaagcccgcatatggacaatcacgctacttt
gcggctgtaagatgtggctttcactttcaagtacaagttaatgtgaatcaaggtactgca
ggcagtgccttggtagtatatgaacctaaaccagttgtcacttatgattcaaaactggaa
tttggagcctttacaaatcttccacatgttttgatgaatttggctgaaaccacacaggct
gacttatgtatcccctatgttgctgacacaaactatgtcaagaccgattcgtcagactta
gggcagttaaaagtctatgtctggactccattgtcaatccccactggatctgctaaccaa
gttgatgtcaccatactgggtagcttgttgcaattagacttccaaaatccaagggtattt
gctcaagatgtcaacatatatgataatgcaccaaatggtaaaaagaaaaattggaagaaa
attatgaccatgagcacaaaatacaaatggaccagaacaaaaatcgatatagcagaaggt
cctggttcaatgaacatggcaaatgtcctttgtacaactggtgctcaatcagtggcttta
gtaggtgaaagagctttctatgatcctagaactgcaggcagtaaatcaagatttgatgat
cttgttaagatagcccagttattctcagtgatggcagattcaaccactccatcagaaaat
catggagttgatgcaaaaggatatttcaagtggtcagcaacaacagccccccagagtatt
gtccacagaaatattgtctacttaagactatttccaaatttgaatgtttttgttaacagt
tattcatactttaggggttcattagttttaagattgagcgtctacgccagtactttcaat
agaggtcgattgaggatgggcttcttccccaatgccacaacggactcaacttccaccttg
gacaatgctatatacacaatatgtgatataggtagtgacaatagttttgaaattacaatc
ccttactctttttccacttggatgaggaaaacaaatggccacccaattggattgtttcaa
attgaagtcttaaacaggctcacatacaacagttctagtccatcggaggtttattgtata
gtccaaggtaaaatgggacaagatgccaggttcttctgcccaactggttctgttgttaca
ttccagaattcatggggttcacagatggatttaaccgaccctctttgtattgaagatgac
acagaaaattgcaaacaaacaatgtctccaaatgaactaggactcacttcagcccaagat
gatggcccacttggtcaagaaaagccaaattattttctcaattttaggtcgatgaatgtg
gacatttttactgtatcacatactaaagtagataacctatttgggcgggcatggtttttt
atggagcatactttcaccaatgagggacaatggagagtgccattggaatttccaaaacaa
ggtcatgggtccttatcactgttgtttgcttattttactggtgaactgaatatccatgtt
ctgttcctaagtgagagggggtttctgagggttgcacacacatatgacactagtaatgat
cgagtcaattttctgtcatcgaacggtgtaataactgtaccagccggagagcagatgaca
ctttcagctccctactattcaaacaaaccattaagaactgtcagagataacaatagtctt
ggttatttgatgtgcaagcccttcttgactggaacctctactggtaaaattgaggtttat
cttagcctgagatgtccaaatttctttttccctcttcctgcccctaaggttacgagtagt
cgtgcactacggggtgatatggcaaaccttacaaatcagagtccatatggtcaacaacca
cagaatcgtatgatgaaactagcatatttagatagaggtttctacaaacattatggcatt
atagttggagaccatgtgtaccaactagattcagatgacattttcaagacagcattgaca
ggaaaagccaaatttactaaaactaagttgacttcagattgggttattgaagaagagtgt
gaattagactactttagaatcaaatatcttgaatcagctgtggattcagagcacattttt
tcagtagacaaaaactgtgaaaccattgccaaggatatttttggaacccatacactaagc
caacatcaagcaatagggttagtgggaaccattttattgactgctggccttatgtcaact
ataaaaaccccagttaatgctgtgacaataaaagaattctttaatcatgccatagatggc
gatgagcaaggtctttccttgcttgtacaaaaatgtactacattcttttcttctgctgca
actgagattttggataatgatttagtcaagttcatagtgaaaatcctggtgagaatactt
tgctacatggtactttattgccataaacctaacattttgactactgcttgcttatccact
cttttaataatggatgttacttcctcttcagtgctgtcaccttcttgtaaagccttgatg
cagtgtctgatggatggtgatgttaagaaactggctgaaattgtggcagaatcaatgtcc
aacactgatgatgatgaagttaaggagcaaatatgtgacacagtaaagtatactaagacc
atcctatcaaatcaaggaccttttaaaggattcaatgaagtttccacagcatttaggcat
atagactggtggatacatacattactcaaaatcaaagatatggttcttagtgttttcaaa
cccagcatagaaagcaaggctattcagtggttggagagaaataaggaacatgtttgtagt
atccttgattatgcctcagacattattgttgagtcaaaagaccaatctaagatgaagact
caagatttctaccaaaggtattcagattgtttggccaagttcaagccaatcatggcaatt
tgctttagaagctgccacaacagtatcagcaacacagtttacagacttttccaggagctg
gccaggatccccaaccgaatcagtaccaataatgatttaattagaattgagcccattggc
atttggatccaaggtgagccaggacaaggaaaatctttcttgacccacaccctctccaga
caattacaaaaatcatgtaagcttaatggtgtttttactaatccaactgctagtgagttc
atggatggttatgataatcaggacattcatttgattgatgacttgggtcaaacaagaaaa
gagaaagatattgaaatgttgtgcaattgcatttcttctgttccctttattgtgccaatg
gcacatcttgaagaaaaagggaaattttatactagcaagttagttgttgccaccactaac
aagtcagatttttctagcacggtcctccaggattctggggcactgaagaggagattccct
tacattatgcacattcgagcagcaaaggcctacagcaaggctggaaagctcaatgtaagc
caggccatggcaacaatgtcaactggtgagtgctgggaagtatcaaagaatggaagggat
tgggaaacactaaaattgaaagacctagttgacaaaattacaatcgattataatgagagg
gttaagaattataatgcttggaaacaacaattggaaaatcagactcttgatgatctagat
gatgctgtatcatacattaagcacaatttcccagatgccataccatatgttgatgagtat
cttaatattgaaatgtcaacattaattgaacaaatggaggctttcatagaaccaaagcct
agtgtcttcaaatgctttgctaacaaaattggttcaaaaatttctaaagcttctagggaa
gttgtggactggttttcagataaaattaaatccatgctcagttttgttgagaggaataag
gcttggctcacagttgtatctgctgtcaccagtgctattagtatacttttgttggtaaca
aagatcttcaagaaagaggaatctaaagatgagagagcttataatcctactttaccggtt
gccaaacccaagggcactttcccagtttcccagcgggagttcaaaaatgaagctccttat
gatggacaattggaacacatcatttctcaaatggcatatattactggttcaacaactggc
catatgactcattgcgccggttatcaacatgatgaaattatactccatggtcattccatt
aagtatttagaacaagaagatgaattgacactacattacaagaataaagttttcccaatt
gaacaaccatctgttacccaagtgacacttggtggtaaaccaatggatttggctattctc
aagtgtaagttgcctttcaggttcaagaaaaactctaaatattacaccaacaagattgga
actgaaagtatgctaatctggatgactgagcaaggcattattaccaaggaagtccaaaga
gtgcaccattcaggtggcatcaagacaagggaaggaactgaaagcacaaagactatcagt
tatactgttaaatcttgcaaaggaatgtgtggtggcctacttatttcaaaagtagaaggt
aacttcaaaatcctgggtatgcatattgctggtaatggtgaaatgggagtagctataccc
tttaattttcttaaaaatgacatgtctgatcaaggcattgttactgagatcactccaatc
cagcccatgtatataaacactaaaactcagatccacaagagccctgtctatggtgctgtt
gaggtgaaaatgggtccagctgtcctaagtaagtcagacaccaggttggaggaacctgta
gaatgtcttattaaaaaatcggcttccaagtacagagttaacaaattccaggtgaacaat
gaactctggcaaggtgtcaaagcatgtgttaaatctaaattcagagaaatctttggaatg
aatggtattgttgacatgaaaactgccattttaggaacttctcatgtaaattctatggat
ttgagcacttcagctggttatagttttgttaaatctggctacaaaaagaaagatctaatt
tgcttggaaccattctcagtagccccattgttagagaggcttgtacaggacaaattccac
aacttactaaaagggaatcaaataactacaaccttcaacacttgccttaaagatgagtta
agaaagctagataagattgcctcaggaaaaactaggtgtatagaggcttgtgaagttgat
tattgcattgtttacagaatgatcatgatggaaatttatgacaagatttatcaaactcca
tgttactactcaggactagctgttggaatcaacccatacaaagattggcacttcatgatt
aatgctctcaatgattacaattatgaaatggactattctcaatatgatggctcccttagt
tcaatgttgctatgggaggctgtggaagttctagcttactgtcatgattcacctgatctc
gtgatgcaactgcacaaaccagtcattgactctgaccatgttgttttcaacgagagatgg
ttgattcatggtggtatgccatcaggatctccatgtactactgtgttaaattcactatgc
aatttgatgatgtgtatttacactacaaatttaatcagtcctggaattgattgtctacca
atcgtatatggcgatgatgttattctttcattggacaaagaaattgaaccagagaaactg
caaagtatcatggcagattcatttggagccgaagtgactgggtcacgcaaagatgaacct
ccttcacttaaaccaagaatggaggttgaattcttaaagcggaaacctggttatttccca
gagtctacttttatagtaggtaaattagacactgaaaatatgatacaacatttaatgtgg
atgaaaaactttagcacatttaagcagcagctccaatcctatttaatggaactatgcctc
catggaaaagacacttatcaacactacattaagatcttggaaccatatctacaggaatgg
aatatcactgtggatgattatgatgtggttataactaagttgatgcccatggtgtttgat
taa

DBGET integrated database retrieval system