Viruses: 3773114
Help
Entry
3773114 CDS
T40000
Symbol
CST183
Name
(RefSeq) Clostridium phage c-st; DNA helicase
Virus
12336
Clostridium phage c-st
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
UvrD_C
UvrD-helicase
AAA_19
UvrD_C_2
Viral_helicase1
AAA_30
AAA_22
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3773114
NCBI-ProteinID:
YP_398613
RS:
NC_007581
UniProt:
Q331U3
LinkDB
All DBs
Position
NC_007581:complement(170855..172633)
Genome browser
AA seq
592 aa
AA seq
DB search
MNFNEQQLKAINFKDGACAVIAGAGSGKTTVLIERVKKLVQEHNVIPSDILIISFTVNTV
KELKTKLKNINIEGVNIDTSHGICRRILLSEGIDIDAPVPWDIENLFNSNYSEKVDVDDI
LSFISFQKNNMKTYKDEFIFKDSKYEENKLRNYFKQYEDFKIKKNLKDSDDQLLDCYYLL
HNKKNKYDHTFKYVLVDESQDNNLVQNLLLHEWCKSGNIFCIGDFRQCIYSFRGSKPDMF
MNFDKEWNDATIINLDTNYRSCQDIVNKANNFVRRYYGNYRYYSNSKAYNNSKAHIDINT
YMHQQDESNEVVNKIQKLLQEGEKPNEIAVLYRLNSHSHHVEGELRRRKIPYYISNNSSF
FKRKEIEGVMSYLRLIDNPYDNSAFENIFKFRNYPIQFFSNKLLQDIKSFAGRNNLSLYE
AFTLFKYKENWQEKNMKIFENNIEKLRLQKDKNIDICKLIDNVKLAFNIEEYIECKYSNR
EDQEDRLNSIETLKSFVKGNNLQGFINYAYNSSNKKKQDNKDCVKLMTIHSSKGLEFKHV
FIIGIEDGKFPHKKSEIIDEARLFYVGVTRPKENLYLSQINQGNKFIEEYVS
NT seq
1779 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattttaacgaacaacaattaaaagctattaactttaaagatggtgcttgtgcagta
attgcaggagcaggaagtggcaagacaaccgttcttattgaaagggttaagaaattggta
caagaacataatgttattcctagtgatatattaattataagttttacagtaaatacagtt
aaagaattaaaaacaaaattaaaaaatataaatattgaaggagtaaacattgatacatct
catggaatatgcagaaggatattattgtctgaaggaatagatattgacgcacctgtacct
tgggatattgaaaacctatttaatagtaattatagtgaaaaggtagatgtagatgatata
ttaagttttataagttttcaaaaaaataatatgaaaacttataaggatgaatttatattt
aaagatagtaaatatgaagaaaataaattaagaaattattttaaacaatatgaggatttt
aaaataaaaaagaatttaaaagatagcgatgaccaactattagattgttattatctttta
cataataagaagaataaatacgaccatacctttaaatatgttttagttgatgaaagccaa
gataataatttagttcagaatttattattacatgaatggtgtaagtcaggaaatatattt
tgcataggagatttccgtcaatgcatttatagttttagaggaagtaaacctgatatgttt
atgaattttgataaagaatggaatgatgctacaataattaatttagatacaaactatcgt
tcatgtcaagatatagtgaataaagcaaataattttgtaagaagatattatggtaattac
agatattatagtaattccaaagcttataataactcaaaagcacatattgatattaataca
tatatgcaccaacaagatgaaagtaacgaggttgtaaataaaattcaaaaattactacaa
gaaggtgaaaaacctaatgaaatagcggtattatatagattaaattcacattcacaccat
gtcgaaggagaattaagaaggaggaagataccatactatatatctaataatagtagtttt
ttcaagagaaaggaaatcgaaggtgtaatgtcttatttaaggttaatagataatccatat
gataacagtgcatttgaaaatatatttaaattcagaaattatccaatacaattttttagt
aataagttattacaagatattaaatcatttgcgggaagaaacaatttatcattgtatgag
gcgtttacattatttaaatataaagagaactggcaagaaaaaaatatgaaaatttttgaa
aataatatagaaaaattaagacttcaaaaagataagaatatagatatttgtaaattaata
gataacgttaaattagcatttaacatagaggagtatattgaatgtaaatacagtaacaga
gaagatcaagaagatagactaaactctatagaaactttaaagtcgtttgttaagggaaat
aatttacaaggattcataaactatgcttataatagtagtaataaaaagaaacaagacaat
aaggattgtgttaagttaatgactattcactcatccaaaggtttagagtttaaacacgta
tttattatagggatagaagatggaaaatttcctcataaaaaaagtgaaataatagatgag
gccagattattctacgtaggagtgacaagaccaaaagaaaacttatatttaagtcaaatt
aaccaaggaaataaatttatagaagaatacgtaagttag
DBGET
integrated database retrieval system