Viruses: 3773132
Help
Entry
3773132 CDS
T40000
Symbol
VP4, HRCV_s3gp1
Name
(RefSeq) Rotavirus C; outer capsid spike protein
KO
K19249
Rotavirus outer capsid protein VP4
Virus
36427
Rotavirus C
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Rota_VP4_MID
VP4_helical
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3773132
NCBI-ProteinID:
YP_392514
RS:
NC_007572
UniProt:
Q82040
Structure
PDB
PDBj
LinkDB
All DBs
Position
NC_007572:21..2255
Genome browser
AA seq
744 aa
AA seq
DB search
MASSLYAQLISQNYYSLGNEILSDQQTNKVVSDYVDAGNYTYAQLPPTTWGSGSILKSAF
STPEITGPHTNTVIEWSNLINTNTWLLYQKPLNSVRLLKHGPDTYNSNLAAFELWYGKSG
TTITSVYYNTINNQNKTHDANSDCLILFWNEGSTQLEKQVVTFNWNVGGILIKPINSSRM
RICMSGMENFNNDSFNWENWNHEFPRSNPGININMYTEYFLASSDPYTYLKNLQQPTAKT
VDMKMMKKMNDNSKLGDGPINVSNIISKDSLWQEVQYVRDITLQCKILSEIVKGGGWGYD
YTSVTFKTVNHTYSYTRAGENVNAHVTISFNNVKERAYGGSLPTDFKIGRFDILDTDSYV
YIDYWDDSEIFKNMVYVRDVRADIGGFQYSYSSEMSYYFQIPVGSYPGLHSSRLQLVYDR
CLLSQQFTDYAALNSLRFVFRVVSTSGWFITTGDINTRRVASGTGFAYSDGHVANTVGTI
SFISLIPSNPNYQTPIASSSTVRMDLERKINDLRDDFNALASSVALSDILSLAMSPLTFS
NLLESVPAITSSVKDVAASVMKKFRSTKMFKKAAKQNYREFVIGDLLEDVTNVARNNNSL
NYSDITSAMMVSTTNRLQITDVDTFSEIVSRSADNFISNRSYRMIENNTVHEITPTRRFS
YDIKTLQQRNFDIDKFSKLASQSPVISAIVDFATIKAIRDTYGISDDIIYKLVASDAPTI
LSFINQNNPLIRNRITNLINQCKL
NT seq
2235 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgtcttcactgtacgcacaattaatctcacaaaattactattctctaggaaatgaa
attttatctgatcaacaaactaataaagtggtatcagactatgtggatgcaggaaactac
acctatgctcaattgccacctacaacgtggggatctgggtcaatacttaaatcggcattc
tctacacctgaaataactggaccacatacgaatacagtaattgaatggagtaacttaata
aatactaatacttggctgttatatcagaaaccattaaattcagttagattattaaagcat
ggtccagacacttataacagcaatctagcagcatttgagctatggtatggaaaatctgga
actactataacatccgtatattataacactatcaataaccaaaataagacgcatgatgct
aattcagattgtttaattttattttggaacgagggatctacacagttagaaaaacaagtc
gtaacattcaactggaacgtgggtggtatactaattaaaccaataaattcaagtagaatg
agaatttgcatgtcaggaatggaaaattttaataatgattcatttaattgggaaaattgg
aatcacgagtttccaagaagtaatcctggtattaatattaatatgtatactgagtatttt
ctggcaagtagtgatccatatacatatcttaaaaatttacaacagccaacagctaaaact
gtagacatgaaaatgatgaaaaagatgaatgataactcaaaattaggggatggtcctatt
aatgttagtaatattattagtaaggactcattgtggcaagaagttcaatacgtacgtgat
ataactttgcaatgtaaaatattatctgaaattgtgaaaggtggaggatggggatatgac
tatactagtgtaacgtttaaaacagttaatcatacatattcatacactagagcaggagaa
aatgttaatgctcatgtgactataagtttcaataatgtaaaagaacgagcatatggagga
tcactgcctactgattttaaaattggtagatttgatatactcgatactgattcatatgta
tatattgattattgggatgattcagaaatatttaaaaatatggtatatgttcgcgatgta
cgagcggatataggaggatttcagtattcttattcgtcagagatgtcatattattttcag
atacctgtaggatcatatcctggattacattcatcaaggttgcaacttgtttatgataga
tgtttattatctcaacaatttactgattatgcagctttgaattcgttaagattcgtattc
agagtagtttcgactagtggatggttcattacaacaggagatataaatactagaagagta
gcatcagggacaggatttgcttattcagacggtcatgtagctaatacagttggaactatt
tcatttatttctttaataccaagtaatccgaactaccaaactccaatagcttcatctagt
actgtaagaatggatttagagagaaaaatcaatgatttacgtgatgacttcaatgcttta
gcgagttcagttgcattaagtgatatactttccctcgctatgtcaccattaacattttct
aatctattagaatcagttccggctattacttcatcggttaaggatgttgctgctagtgtt
atgaaaaaatttagaagtactaaaatgttcaaaaaagcagcaaaacaaaattatcgggag
tttgtcattggagacttattggaagacgttactaatgttgctaggaataataattcgttg
aactatagtgatattacttcggccatgatggtttcaactactaacagattacaaattact
gatgtagatactttttcagaaatagtatcacgatcagctgacaattttatttcaaataga
tcttatagaatgatagaaaataatactgttcatgaaataacgcctacaagaagattttca
tatgacattaaaaccttacagcaacgaaatttcgacatagataaattctctaaactagct
tctcaatctcccgttatatctgcaatagttgattttgctaccataaaagcaatacgtgat
acttatggcattagtgatgatatcatatacaaattagtggcatctgacgctcctactatt
ttgtcatttattaatcagaataatccactcatacggaatagaattactaatctaataaat
caatgcaaattgtaa
DBGET
integrated database retrieval system
