Viruses: 3773136
Help
Entry
3773136 CDS
T40000
Symbol
VP2, HRCV_s2gp1
Name
(RefSeq) Rotavirus C; structural protein 2
KO
K24598
Rotavirus core capsid protein VP2
Virus
36427
Rotavirus C
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Rota_VP2
DOCK_C-D_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3773136
NCBI-ProteinID:
YP_392489
RS:
NC_007546
UniProt:
Q91E96
LinkDB
All DBs
Position
NC_007546:37..2691
Genome browser
AA seq
884 aa
AA seq
DB search
MISRNRRRNNQQKNIEKEKQLETIINKEVKENKDSMKEDKLVVTEESNGDVTTAKEQSNN
INLQKNDLVKEVMNIQNQTLNTVVTENKVEIEEIVKKYIPSYNTDSLIVKKLTEIQESSA
KTYNTLFRLFTPVKSYLYDINGEKKLSTRWYWKLLKDDLPAGDYSVRQFFLSLYLNVLEE
MPDYIMLRDMAVDNPYSAEAGKIVDGKSKEILIELYQDQMTEGYIRRYMSELRHKISGET
NTAKYPAILHPVDNELNQYFLEHQLIQPLTTRNIAELIPTQLYHDPNYVFNIDAAFLTNS
RFVPPYLTQDRIGLHDGFESIWDSKTHADYVSARRFIPDLTELVDAEKQIKEMAAHLQLE
AITVQVESQFLAGISAAAANEAFKFIIGSVLSTRTIAVEFITSNYMSLASCMYLMTIMPS
EIFLRESLVAMQLAIINTLIYPALGLAQMHYQAGEVRTPFELAEMQVANRSIRQWLHHCN
TLQFGRQITEGIIHLRFTNDIMTGRIVNLFSTMLVALSSQPFATYPLDYKRSVQRALQLL
SNRTAQIADLTRLIVYNYTTLSACIVMNMHLVGTLTVERIQATSLTSLMMLISNKTVIPE
PSSLFSYFSSNINFLTNYNEQIDNVVAEIMAAYRLNLYQQKMLMLVTRFVSKLYIFDAPK
IPPDQMYRLRNRLRNIPVERRRADVFRIIMNNRDLIEKTSERICQGVLLSYTPMPLTYVE
DVGLTNVINDTNSFQIINIEEIEKTGDYSAITNALLRDTPIILKGAIPYVTNSSVIDVLS
KVDTTVFASIVKDRDISKLKPIKFIINSDSSEYYLVHNNKWTPTTTTAVYKARSQQFDIQ
HSVSMLESNLFFVVYNDLFKYIKTTTVLPINAVSYDGARIMQET
NT seq
2655 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgataagcagaaacaggcgcagaaataatcaacaaaaaaacatagaaaaagagaaacaa
ttagagactataattaacaaagaagttaaggaaaacaaagattctatgaaagaagataag
ctagtagttacagaagaaagcaatggagacgtcacaactgctaaagaacaatcgaataat
attaatttacaaaagaatgatttggttaaagaagtcatgaatatacagaatcaaacatta
aatacagtagttactgagaataaagttgaaatagaagaaatagttaaaaaatacattcca
tcatataatactgatagcctcattgttaaaaagttaactgaaatccaggaatcaagtgct
aaaacatataatacattgtttagattatttactccagttaaaagttatttatatgatata
aatggtgagaaaaaattatcgactagatggtattggaaattgctcaaagatgatttacct
gctggtgattactcagttagacaattcttcctgtcactatatttaaatgttttagaggaa
atgcccgattacataatgcttcgtgatatggcagtggataacccatattcagcagaagca
ggtaaaatcgtagatggaaagtctaaagaaattttgattgaactatatcaagaccagatg
acagaaggatatattagaagatatatgtctgaattaagacataaaatatctggagagaca
aatactgcaaaatacccagctattctacatcccgtggataatgaacttaatcaatacttt
cttgagcatcagttaattcaaccattaactacaaggaacattgcagaattgattccaact
caattatatcatgatccaaattacgtttttaatattgatgcagcctttttaacaaattca
agatttgttccaccatacttaacacaggataggattggattacatgatggatttgaatca
atatgggattcaaaaactcatgctgattacgtttcagctagaagatttatacctgattta
actgaactggtggatgctgaaaagcaaataaaagaaatggctgcacatttacaactagag
gctattacggtacaggttgaatcacaatttttagcaggaattagtgctgctgcagctaat
gaagcgtttaaatttataattggctcagttttatctaccagaacaatagctgtagaattc
ataacctcaaactatatgtcactagcatcatgtatgtatttaatgactattatgccatca
gagattttcttaagagaatcattagttgctatgcaattagcaataataaatacccttatt
tatccagctctaggtttagcgcaaatgcattatcaagcaggtgaagtgaggactccattc
gaattagctgaaatgcaagtagctaatagatctattagacaatggttacatcattgtaat
acacttcaatttggtagacagataacggaagggataattcatctacgatttactaatgat
atcatgacaggcaggatagtgaacttattttcaacaatgttagtggctctatcatctcag
cctttcgctacatatcctttagactataaaagatctgtacaaagagcgttacaactttta
tcaaatagaacagctcaaatagcagatttaaccagattaatagtatacaattatactaca
ttatctgcttgtatagttatgaatatgcatttagtaggaactcttactgttgaacgtata
caagccacttctctaacttctttaatgatgttaatctctaataagacagttattccggaa
ccatcgtctcttttttcatatttctctagtaacattaattttcttacaaattataatgag
caaattgataatgtggtagcagaaataatggccgcatatagattgaatttatatcaacag
aaaatgttgatgctcgttaccagatttgtgtcaaagttatacatatttgatgctcctaag
ataccaccagatcagatgtatagattaagaaaccgattaagaaatattccagttgaaaga
agaagagctgacgtattcagaattattatgaataatagagatttaatcgaaaaaacatca
gaacgtatatgccagggtgtgctgttatcttatacaccaatgcctttaacttacgttgaa
gatgtcgggttaacaaatgtaattaatgacactaatagctttcaaataattaatattgaa
gaaattgagaagaccggtgactattcagctataacgaatgcattacttcgggatactcca
atcatattgaaaggtgcgattccatatgttactaactcatcagtaattgatgttttatct
aaagtggacaccacagtgttcgcaagcattgtaaaagatagggacatttcaaagttaaaa
ccaataaaattcataattaattcagattcatccgaatattatttagtacataataataaa
tggacaccaacaacaactacagcagtatataaagctagatctcagcaatttgatatacaa
cattcagtatcaatgctagagtcaaacttattttttgtggtatataatgatttatttaaa
tacattaaaaccactacagttctgccgataaatgctgtctcttatgacggtgcaagaatt
atgcaagaaacataa
DBGET
integrated database retrieval system