KEGG   Viruses: 3773137
Entry
3773137           CDS       T40000                                 
Symbol
VP1, HRCV_s1gp1
Name
(RefSeq) Rotavirus C; structural protein VP1
  KO
K25309  Rotavirus RNA-directed RNA polymerase [EC:2.7.7.48]
Virus
36427  Rotavirus C
SSDB
Motif
Pfam: Rotavirus_VP1 RdRP_4
Other DBs
NCBI-GeneID: 3773137
NCBI-ProteinID: YP_392464
RS: NC_007547
UniProt: Q91E95
LinkDB
Position
NC_007547:12..3284
AA seq 1090 aa
MAQSIVVDGDYDALASRYLKFVYDFENVTYQNNYFATDKFKKDIEQYLKSIHDGEKITQS
KIDEKEKILLDRVPAEERCLISKLVFAYGKHGNVENKLVKYGVKDALSHAPQKDAKPYEN
NIITSEIFKEKSEYTDIYMDPSINTSCQSNCQAMMFTISEMKLNNIKNAARLEKLFTIIA
ATINKYGMPRHNTRYRYEWETMKNKPYHLAAWINSSIEMIACVVDHHTYMIARELIVKSF
TNRTSLAKLVSSPMTVLTAMLPIRGTFITTENLELEYSNKSINYLISKEMAEDFMQAIKQ
LRDEGLEYIPDYYEKWFKSPDPLTFPNIALIYSFSFHVGYRKQALSDAVYDQITVTYSDN
VNMEMYKEYSERIENEIFTILKDKIIHEDKRLEEYELSALLSMSSASNGILREINFGGQK
VRSTKKNMHVIDDIYHKKYTTDIPPVDARNPIPLGRRDVPGRRTRAIFILPYQYFIAQHS
FAEIMLNYAKREREYSEFYSQANQVLSYGDVTRYLDSNSILCFTDVSQWDASQHNTKVLR
RSIIRAMKRLKQLTHNINIHKAINIYIQSQENLENSYVLIDKKAIQYGATASGEKQTKIM
NSIANKALIQTVLGKLMTDYTFDVKMIRVDGDDNYAIVRFPIAITEKLLSEFTSKLRSYY
SEMNVKVKALASLTGCEIAKRYVAGGMLFFRAGVNILHHEKRNQDSAYDMAATLYANYIV
NALRGLTMSRTFILTKICQMTSIKITGTLRLFPMKSILALNSAFKVFDEVDYVINYPISN
LFIQLQRKLSSIKAKSKIADNIAKSPQFKSYVELLNKSLTTDENPIVSDGIRLTEKAKLN
SYAPIALEKRRDQFSIMVSFLQNPTTFKSETVVTINDVLYFISGFIKIDSSTVLPKEENN
TMPLLPAIIKRTLSYFGLRTHDYDIKGSSSTVSKIIKQYSVYTPGIEELYEIVNKSVDTI
RGYFASFNVPKADVDTYISTQMYKHDRFKILQAYIYNLLSVNYGMYQLVDLNSARFFDHV
IHTPMAKTPTAVFMIDLALRLKIINHCIEKGEIITVSVHANKTDYLKLWRMLWNVKTMNS
PYSKNSMFDE
NT seq 3273 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggcgcaatccatagtcgtagatggggactacgacgctcttgctagtagatatcttaaa
tttgtttatgattttgaaaatgtaacttatcaaaataattacttcgccacagataaattt
aaaaaagacatagagcaatatcttaaatcaatccatgatggagaaaagattacacagtct
aagattgatgaaaaggaaaaaatactgttagatagagtgcctgctgaagaaagatgttta
atttcaaaattagtattcgcatatggaaaacatggaaatgtagaaaataaactagtaaaa
tatggagtaaaagatgcgttatcgcatgcacctcaaaaagacgctaaaccttatgaaaac
aacataattacgtctgaaatttttaaagaaaaatcagaatacactgatatatacatggac
ccatcaattaatacatcctgtcaatcaaattgtcaagctatgatgttcacaatttctgaa
atgaaattaaataatattaaaaatgctgctagattagaaaaactatttacgattattgct
gctacaattaataaatatggaatgcctagacataatactcgatatagatatgaatgggaa
acgatgaaaaataaaccatatcatttagcggcgtggataaattcaagcatcgaaatgatt
gcatgtgttgttgatcatcacacttatatgatagccagagaattaattgtaaagtcattt
acaaacagaacatcattagcgaaattagtatcatcaccaatgacagtactgacagccatg
ttaccgatacgaggtacatttataactacagagaatttagaactggaatattctaataaa
tcaattaactatttaatatcaaaagagatggctgaagattttatgcaagcaataaagcaa
ttaagagatgaaggtttggaatatataccagattattatgagaagtggtttaaatctcca
gatcctttaacttttccaaatatagccttaatatactcattcagttttcatgttggttat
agaaagcaagcgttgtcagatgctgtatatgatcagattactgtaacgtatagcgataat
gtcaatatggaaatgtataaagaatattctgaacgtatagagaatgaaatatttaccatt
ttaaaagataaaataatacatgaagataaaagattagaagaatacgaattatcagcgtta
ctatcaatgtcatctgcatcaaatggaatactaagagagataaattttggaggacaaaaa
gttagatcaacgaaaaagaacatgcatgtgattgatgatatctatcataaaaaatataca
acagatataccacctgtggatgcaagaaatccaatcccattaggaagaagagatgttcca
ggacgtagaacaagagctatttttatattaccatatcagtattttatcgctcaacattca
tttgctgaaataatgcttaactatgcaaaacgtgaaagagagtattcagagttttattct
caagcaaatcaagtattatcgtatggagatgtaactagatatcttgattcaaatagtata
ttgtgctttactgatgtatcacagtgggatgcttctcaacataatactaaagtattacga
agatcaataatacgagcaatgaaaagactaaaacagttgacgcataatataaatatacat
aaagctattaatatatacatacaatctcaagaaaatttagaaaattcatatgtattgata
gataaaaaagccattcaatatggcgctacggcatcaggcgaaaaacagactaagatcatg
aattcaatagcgaataaagctttaatacagacagttctcggaaaacttatgacagattat
acatttgacgttaaaatgatacgggttgatggagatgacaattatgctatagtacgcttt
cctatcgcaataactgaaaaattactgtcagaattcacatcaaaattaagatcatattac
tcagaaatgaatgtaaaagtaaaagcattagcatcactcacaggatgtgaaatcgcaaaa
agatatgtagctggtggaatgttgttttttagagctggtgtgaacatactccatcatgaa
aagagaaaccaagattcagcatatgatatggcggctacattatatgcaaattacatagta
aatgctttaagaggacttactatgtcaagaacatttatattaactaaaatatgtcagatg
acttcaattaaaatcactggtacattgagattgtttccaatgaaatcaatattggcattg
aattcagcattcaaagtatttgatgaagtagattatgttattaactatccaatatcaaat
ctatttatacagttgcaaaggaagctaagttcaattaaagcgaaatctaaaattgctgat
aatatcgcaaagtcaccgcagtttaaatcatacgttgaattgctcaacaaatcactaact
actgatgaaaatccaattgtttcagatggaattcgattgactgaaaaagcaaaactcaat
agttatgcaccaatagcattagaaaaaagacgggatcaatttagtataatggtatcattt
ctacaaaatccaactacttttaaaagtgaaactgtagttactataaatgatgttttatat
ttcatatcagggtttatcaagattgattcttcaacagtactaccgaaagaagagaataac
acaatgccactattacctgcaattataaaacgtacattgagctatttcggtctgagaaca
cacgactatgatataaaaggatcctcatcgactgtgtcaaaaataatcaaacagtattct
gtatatactcctggaattgaagaactgtatgaaatagttaataaaagcgtagatactata
agaggttattttgcatcgtttaatgtaccaaaggctgatgttgatacctatattagtact
cagatgtataaacatgacagatttaaaatactgcaagcttatatttacaatttattgtca
gttaattatggaatgtaccaattggtggatctaaattcagcgagattctttgatcatgtt
attcatacaccaatggctaaaacaccaacagctgtttttatgatagatctagcattaaga
ttaaagatcataaatcactgtatagaaaagggtgaaataataactgtgtcagtacacgct
aataaaactgactatcttaagctgtggcgtatgctatggaatgttaaaacgatgaattca
ccatattcgaagaattcaatgtttgatgagtaa

DBGET integrated database retrieval system