Viruses: 3953123
Help
Entry
3953123 CDS
T40000
Symbol
L, MblV_sLgp2
Name
(RefSeq) Mammarenavirus praomyidis; L protein
KO
K25303
Mammarenavirus RNA-directed RNA polymerase L [EC:
2.7.7.48
3.1.-.-]
Virus
3052325
Mammarenavirus praomyidis
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Arena_RNA_pol
ArenaCapSnatch
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
3953123
NCBI-ProteinID:
YP_516229
RS:
NC_007904
UniProt:
Q27YE5
LinkDB
All DBs
Position
NC_007904:complement(513..7175)
Genome browser
AA seq
2220 aa
AA seq
DB search
MEEQISEVKDIISKYLSNDDRLAKQKLAFLVQSEPKLLLIEGLKLLSLCIEIDSCEANGC
DHNTKELSVENFLSENRVLCPGLPMVVPDGFKLNGNVLMILECFVRSSPANFEQKYREDL
VKLNSLKEDLMTVGITMLPLIDGRTNFQTDRLPEWANERFRTLLFSLLAFSQESSRMFEE
AEYSRLCESLNVSGGKRSGIENINILSDHRSEHFDELLKLCHVGINNHMSSLDVKREIIQ
EFQAFRNKLQNGVIERQFLRVNREELIKAFNEMYTLRVGDKPELLDSLLNDYYHSCPLIT
MLYCELPNGKSCQSDISHVRGWRSLLNKVKSLRLINTRRKLMLIFDSILLLAHMKDLSVN
GHLVESEWMGSSFLSVNDRLVSLPATQKDLKTWLQRRTNRLSHSHQSQSAYEVFSTMVNR
VLNKAKEVLLLVNLTFKDYNVDEDILSESSFTEMMSLEVNGVEPTINYEKNPIDRFSYNI
QAMDPDNQSDLKRLSSISLALVNSMKTSSTVKLRQNEHGKLRYKCVRCKEAYYQDFLIEG
HRLMLIYQKTGECSKCYSVNDAVVGELCSFYADPKRYFPAIFSDSVLQEMIDTMISWLTE
CSELKEFIKEIKSLLKMVVMVVLTNPTKRIQKFLQNLRYFTMAYVSEYHHKDLLEKLRED
LITNCEFLLYRITRSILNIVFNVNVTTMITNRFKFILNLSYLCHLITKETPDRLTDQIKC
FEKFIEPKMKFDSVNVNPLEPADQEELRSLLMSADKFLSKPDCFGDEGILFKTPGVSRKI
FSMMVSSFNNGSLFKQAELKNGVKDPLVVSGCATALDLASNKSVVVNKYTDGDRIIEYDY
DKLVATAVCQLSEVFSRKGKYVLSKEDYDFKIQQIMSDLVIGRSKLHGSEIGLNSCEEVD
EVLIEGGAADYFDSIKQSVDTVMSKFSWSGSESSATLKSECSIDDLSLALQDKAQLRLIR
NELSCHMVEDFDVMTLPYDTYEEICKSVYSDPSLRSKYFYLESLESCPLTKMAQAVCTRT
FHDEEYFQCFKSLLLQMNANKLSGKFNHYKSKCLNFKLDRDRLFNETRISERESNSEALS
KALSLTNCTTAALKNLCFYSQESPQSYNSQGPDTGRLKFSLSYKEQVGGNRELYIGDLRT
KMFTRLIEDYFEALTSQFKGSCLNDEHEFENAVFSMKFNVSLGLLSYSLDHSKWGPMMTP
FLFLATLQNINWPSLDTLSDAKSRDYVSSMLSWHIHKLVEVPFNVVTAMMKSFIKSKLGL
KKNLSETMTERFFFEHFRLGKVPSHISSILDKGQGILQNTSDFYGLISERFINYCISCLY
EGNVDAFTSSDDQISLFDKSLSDLLEKDPDEFEYILEFHNYLSDQLNKFISPKSVKGNFA
AEFKSRFFVWGDEVPLLTKFVAASLHNIKCKEPHQLAETIDTIIDQAVANGVPVKLCNIV
QERTLNLLRYAQYPIDPFLMFCSSDVKDWVDGNRGYRIMRNIEMLEPNGTRKVRSFLRRL
YNNLKTGLLHEEFTAAYLSGDPYQSLAKLSKIFDTEILNDEELGLSWLNLSAYYPLRMVL
RQKVIYTGAVNVEEEKLPTIVKTLQNKLSSNFTRGAQKLLSEAINRSAFQSCIASGFVGL
CRTLGSKCVRGPERENFYIKSIMNQSMMMEGVSRELVMGVDVWRVRNPLDNSRAQQKWGN
YFRPILWDYLCIALSTALEIGSWVLGEPKLKSPLPQMKFRPCDYFPMKPSVTRLLEDKVG
FNHIIHSFRRLYPDIFEKHLLPFMSDLASTKMKWSPRVKFLDLCVMLDVNCEAMSLVSHI
VKWKREEHYVILSDELSISHDRSHESLADERVVSTEDVSENFLRQIYFESFARPFVATSR
TLGSFTWFPHKTSLPESEGLASLGPFGTFIEKVIFKGIERPMYRHDLFSGYAWLDFDFGE
FYINSSKLIQYGLTEMRYFEDLSEFMSMLSSLKPGSIEISLTVNFQVKSQGESLREKFFI
HCKFYGSFDVDGKFEFNNIGVQYSGAINRSAVLDCWRLILTNSHFLGDKVIWHLNTANIK
DYLKDGSMVGEVVPIEVIINRDALRLDTLDFERVGPDVNVVPLVVKDGYIFEGDKKLVPF
NPSIHDQDFEILVKELCIDDKELLKDMIQKMITVRGSQGLQWHSLDIVAVLTKNMPTNYK
DFITESLSVLDSWTGFKGYSLCFSKTKNTLMIHTSEGNLRLKGKLCRKLFDDPVHVEDIE
NT seq
6663 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagaacaaataagtgaagtcaaggacatcataagtaaatatctttcaaatgatgac
agattggcaaagcagaaactggcctttctggtccaatcagaaccaaaacttttattaatt
gaagggctcaaattgctatctctctgtatcgaaatagacagctgtgaagcaaatggttgt
gaccataatactaaagaactttctgtcgagaacttccttagtgaaaatcgagtgttgtgt
cctggattgccgatggtggttccagatggtttcaaattgaatgggaatgtactgatgatt
cttgagtgttttgttaggagttcaccagccaattttgaacaaaaatatcgggaagacctg
gtgaagctgaactcattaaaagaggatctcatgacggttggaattacaatgctcccatta
atagacggtagaactaactttcagacagaccgtcttccggagtgggcaaatgagagattt
agaaccctgttgttcagtcttttagccttttctcaagaatcaagtaggatgtttgaagaa
gctgaatattcgagactgtgtgagtctttaaatgtctcaggaggtaaaagatcaggcatt
gaaaatataaatattttatcggatcatagaagtgaacactttgatgaattgttgaagttg
tgccatgtaggaatcaataatcatatgagcagcttggatgtgaagagggaaataattcaa
gagtttcaagcatttcgcaacaaactacagaatggggtgatagagagacaattcttgagg
gttaacagagaagaattaattaaagcatttaacgagatgtacacactaagagttggggat
aaaccagagttattggacagcctattgaatgattactatcactcttgtccgttgattaca
atgttgtattgtgagttacctaacggtaaaagttgccaaagtgatattagtcatgtgcgt
gggtggagatcactgcttaacaaagtcaaaagtttgaggctaataaatactagaagaaag
cttatgttgatctttgactcaattcttctacttgctcacatgaaggatttaagtgttaat
ggtcacttggtagaatctgagtggatgggttcatcattcctcagtgttaatgataggttg
gtatcactgccagctactcagaaagacttaaaaacttggttacaaaggagaacgaatcga
ttgtcacattcacaccagagccagagtgcttatgaagtcttctccactatggttaatcgt
gttctgaataaggctaaagaggtactcctccttgtcaacctaacgttcaaggactataat
gttgatgaagatatcttgtctgaatccagttttacagaaatgatgtctttggaagtaaac
ggtgttgagccaacaatcaattatgaaaagaatcccattgatagattcagttacaacatt
caagcgatggatcctgataatcaatcagatttaaagagactctcaagcatttcactggca
ttggttaactccatgaaaacttcatcaactgttaaactcagacaaaatgagcatgggaaa
ctcagatacaaatgtgttagatgtaaggaggcctattaccaagattttcttattgagggg
catcggttaatgttgatttatcaaaaaactggggaatgctcaaagtgttattctgtaaac
gatgcggttgtaggagagttgtgttccttttatgcggacccaaagaggtattttcctgca
attttttcggactctgtgttgcaagaaatgatagacaccatgatcagctggttaacggag
tgctctgagctgaaggagtttattaaagaaataaagtctctcttaaagatggtagtgatg
gttgtcttgacgaaccctactaaaagaatacaaaaatttttgcagaacttaagatacttc
accatggcatatgtctctgaataccatcacaaggatctcctagaaaagttaagagaagat
ctaataacaaactgtgagtttctattgtatagaatcacaagatcaatactgaacattgtt
tttaatgtgaatgttacaaccatgattactaatagatttaaatttatccttaatttatcc
tatctatgtcatttgataaccaaagagacccctgatagattgacagatcagatcaaatgc
ttcgagaaatttattgaaccaaagatgaaatttgacagtgtgaatgtaaatccattagaa
ccagctgaccaagaggagttgaggtctttattaatgtctgctgataaatttttgagcaaa
ccagattgttttggtgatgagggaatcctattcaaaacgcctggtgtctcaagaaaaatc
ttttctatgatggtttcatccttcaataatggctcactattcaaacaagcagagttaaag
aatggtgtgaaggacccactggtggttagtgggtgtgctactgcactagatctagccagc
aataagagtgttgttgtcaataaatacacagacggagacagaataattgaatatgattat
gacaaattggttgcaacggctgtctgccagttgtctgaagttttctcgagaaagggtaag
tatgtattaagtaaagaagattatgatttcaagatacaacaaataatgagtgatttggtc
attggaaggtcaaaattacatgggtcagaaatagggttgaattcttgtgaagaggtcgat
gaagttctgatagagggcggagcagctgactattttgacagtataaaacagtctgttgat
acagtgatgagtaaattttcatggtccggttcagagtcttcagccacccttaaaagtgaa
tgttctatagatgacttgagtttggcactacaagataaggcacagctgaggctaatcagg
aatgaactgtcttgtcatatggttgaagattttgatgtaatgactctcccttatgatact
tatgaagagatttgtaaaagtgtctactcagacccaagccttagatcaaaatatttctat
ttggaatcattggaatcttgtcctctaactaagatggcccaggctgtctgtacaaggaca
ttccatgatgaggaatactttcagtgctttaagtccctattgctgcagatgaatgctaac
aaattgtctgggaaatttaaccattacaagagcaaatgtttaaatttcaagttagatagg
gacaggttgttcaatgagaccaggataagtgaaagggagagtaactcagaagcattgagc
aaagcactaagtctaactaactgcactactgcggcacttaagaatctttgtttttatagt
caagaatcccctcagtcttacaattcacaggggccagatactggtagactcaaattttca
ttgtcttataaagaacaagttggagggaacagagagctgtacataggagacctgagaacc
aaaatgttcacaagattaattgaagactactttgaggctttaaccagccaattcaaagga
agttgtctaaatgatgaacatgagtttgagaacgccgttttctctatgaagttcaatgtg
tcactgggccttctatcttatagcctggaccacagcaaatgggggcctatgatgaccccc
ttcttgttcttggcaacattacagaacattaattggccttctctagacacactttcagat
gctaagagcagagactatgtatcatcaatgttgtcatggcatatccataagttggttgag
gttccctttaatgttgttacggctatgatgaagtcctttatcaagtcaaagttgggattg
aaaaagaatctgtctgagaccatgacagagagatttttctttgaacactttaggctgggg
aaagtgccatcacacatcagttctattctggataagggtcaaggaattctgcaaaataca
tctgatttttacggcctaatttctgagaggttcatcaattattgtattagttgtttatat
gaaggaaatgttgatgcattcacttctagtgatgaccaaataagtctctttgacaaaagt
ttgtcagacttgctggagaaagatcctgatgaatttgagtacatcttggagttccataat
tatttgagtgatcagctgaacaaatttatcagccctaaaagtgtgaaggggaactttgct
gctgagtttaaatcaaggttctttgtttggggagatgaagtcccgttattgacaaagttt
gttgctgcatcattgcataatatcaagtgtaaagagccgcatcagttagcagaaactatt
gacacgataattgatcaagctgttgctaatggggtacctgtgaaattatgtaacattgtt
caggaacgcactttgaatctccttaggtatgctcagtatccaatagacccctttttgatg
ttctgctcctctgatgtcaaggattgggtagacggaaatagaggctatagaattatgagg
aacattgaaatgctagagcctaatggaacaaggaaagtaaggtccttcttaagaaggttg
tacaacaacctcaaaacgggccttcttcatgaagagttcactgcagcctatttgtcaggc
gatccgtatcagtcgcttgctaagcttagcaaaatttttgacactgaaatacttaatgat
gaagagctaggattgtcgtggttgaacttatctgcatattaccccttgagaatggttctt
cgacaaaaggttatatatacaggtgcagttaatgttgaggaggaaaaactaccaacaatt
gtaaagactctgcaaaataaattatcatctaacttcacaagaggagctcaaaaattatta
tctgaagctatcaataggagtgcttttcagagttgtatagcgtctggctttgttggcctc
tgtaggacattgggtagtaaatgtgtcagaggacctgagagagaaaacttttacatcaag
tctattatgaatcaatccatgatgatggagggggtgagtagggagctggtgatgggtgtt
gatgtttggagggtgagaaaccctcttgataattctagagctcaacagaaatgggggaat
tactttagacctatactctgggattatctttgcatagcattatcaacagctttggagatt
ggttcttgggtcttaggtgaacccaaacttaaaagccctttaccacagatgaagtttagg
ccatgtgattattttcctatgaaaccatctgtgacaaggttgttggaagataaagttggc
tttaatcatataattcattcttttagaaggttgtaccctgatatttttgaaaagcactta
cttccattcatgagcgacctggcttcaactaagatgaagtggtcacctagagttaaattt
ctggatttatgtgtaatgttggatgtaaattgtgaagccatgtcattagtctctcacatt
gttaaatggaagagggaggaacattatgtaattctatctgatgagctatcaatttctcat
gataggtcacatgaatccctagcagatgaaagggtagttagcacagaggatgtgtcagag
aacttcttgaggcagatttactttgagtcttttgctaggccttttgttgcaacatctagg
accttgggctcattcacgtggtttccacacaaaacatctttgccagagtcggaaggctta
gcatctctgggaccatttggaacctttattgaaaaagtcatcttcaaaggaatagaaaga
ccaatgtatagacatgatcttttcagtggctacgcatggttagattttgattttggagag
ttctatataaattcaagcaaattgattcaatacggcctaactgagatgagatatttcgaa
gacttatcagaatttatgtcaatgttgtcaagcttgaagccaggttctattgagatatcg
ttgactgtgaactttcaagttaaaagccaaggagaatcactgagggaaaagttttttatt
cactgcaaattctatgggagctttgatgtggatggcaaatttgagtttaacaacattggg
gttcagtacagtggtgccataaacaggtctgcagttctagattgctggaggcttattctg
actaacagccattttctaggagacaaagtcatctggcatctgaacacggctaacattaag
gattacctgaaagacggatcaatggtgggtgaggtagttccaattgaagtgataattaat
agggatgcactgagattagatacccttgactttgaaagagtgggacctgatgtaaatgtg
gtgcctttggttgtgaaggatggttacatctttgaaggtgataagaaactagttcccttc
aatccaagcattcatgatcaagactttgagatattagtgaaagagttgtgtattgatgat
aaagaacttttaaaagatatgattcagaagatgatcactgttaggggttctcagggtttg
cagtggcatagtttagatattgtggcggtcttgaccaaaaatatgcctacaaattataag
gatttcataacagagtccttgtctgtcttggattcctggactggttttaagggatatagc
ctttgttttagtaagacaaagaatactttaatgattcatacttcagaaggcaacttgaga
ttaaaaggaaaattatgtaggaagctatttgatgaccctgtgcatgtggaggacatcgag
tga
DBGET
integrated database retrieval system