Viruses: 40068512
Help
Entry
40068512 CDS
T40000
Symbol
parE, FDG80_gp028
Name
(RefSeq) Escherichia coli O157 typing phage 6; DNA topoisomerase II large subunit
KO
K26040
Straboviridae DNA topoisomerase large subunit [EC:
5.6.2.2
]
Virus
1508681
Escherichia coli O157 typing phage 6
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
DNA_gyraseB
HATPase_c
TOPRIM_C
Toprim
DNA_gyraseB_C
HATPase_c_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
40068512
NCBI-ProteinID:
YP_009593015
RS:
NC_041864
UniProt:
A0A0F6TI26
LinkDB
All DBs
Position
NC_041864:complement(20915..22732)
Genome browser
AA seq
605 aa
AA seq
DB search
MIKNEIKVLSDVEHIKKRSGMYIGSSAKEAHERFLFGKYQQVEYVPGLVKLIDEIIDNSV
DEAIRTSFKFANKIDVQIKNNQVSVEDNGRGIPQGLVTDQTGEQIPGPVAAWTIPKAGGN
FGDDSERKTGGMNGVGSSLTNIFSTLFTGITSDGENEITVNCSNGMENKSWSSKKSKGKG
TKVIFTPDFSSFEEHNLSQIYLDITLDRLQTLAVVYPDIKFTFNGKKVDGNFKRFAKQFG
EDNIIQENDKVSIAFTTSPDGFRHLTYVNNIHTKNGGHHVECVMDDICEHLLPGIKKKYK
GIEVTKARVKECLTMLMFIRDMSNMRFDSQTKERLTSTYGDIRNHIQLDAKKIAQALLKN
EALIMPIVEAALARKLAAEKAAETKAAKKATKAKVHKHIKANQCGKDADTTLFLTEGDSA
IGYLIDVRDRELHGGFPLRGKVMNSWGMSYADMMKNKELFDICAITGLILGEKAENTNYR
NIAIMTDADHDGLGSIYPALLAFFSNWPELFEQGRIRFVKTPVIIAQIGKAQKWFYTVAE
YEEVKDTLPKHSIRYIKGLGSLEKSEYREMIQNPVYDVVKLPENWKELFEMLLGDDSELR
KEWMS
NT seq
1818 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaaaaatgaaattaaggtactgtcagatgtagaacatattaagaaacgtagtggc
atgtatattggttcttcggccaaagaagcccacgagcgttttttgtttggtaaatatcaa
caagttgaatatgttcctggtctggttaaattaatcgatgagattattgacaactcggtt
gatgaagctattcgtacatcatttaagtttgcaaataaaattgatgtgcaaattaaaaat
aatcaagtttcggtggaagataacggacgtggtattcctcaaggtttagttaccgaccaa
acaggtgaacaaattcctgggcctgtagcagcctggactattccaaaagctggtggtaac
tttggcgatgattctgaacgcaagactggtggtatgaacggcgtcgggagtagtttaact
aatatcttctctacgttgtttacaggcatcacgtcagatggcgaaaatgaaatcactgtt
aactgttcaaacggaatggaaaacaaatcatggtcttctaagaaatctaaaggtaaaggc
actaaagtaatcttcactcctgatttctcttcatttgaagagcataatttatctcaaatt
tatttagatattactttagaccgacttcaaacattggcagtcgtttatcctgatatcaag
ttcacatttaatggtaaaaaggttgatggtaattttaaacgatttgctaaacaatttggt
gaagataacatcattcaagaaaatgataaagtctctatagcattcacaacatcaccagat
ggcttccgtcatttaacttatgtgaataacatccatactaaaaatggtggtcatcatgtt
gaatgtgtaatggacgatatctgcgaacatcttttgccgggtattaaaaagaaatataag
ggtattgaagtcactaaagctcgtgttaaagaatgcctcacaatgttgatgtttattaga
gacatgagcaacatgcgttttgattctcagactaaagaacgtttaacgtcaacgtatggt
gatattcgtaatcatatccaattagatgctaagaaaattgctcaggcacttcttaaaaac
gaagccttgattatgcctattgttgaagcagcattagctcgtaaattggcagcagaaaag
gctgcagaaactaaagcagctaaaaaggcaactaaagctaaggttcataagcatattaaa
gctaaccaatgtggtaaagatgcagatacgacattgttcttaacagaaggtgattctgca
attggttatctcattgatgttcgtgaccgtgaactacacggcggattcccattacgtggt
aaggtgatgaatagctggggtatgtcatatgctgatatgatgaagaacaaagagctcttt
gatatctgtgctatcacaggtcttattcttggtgaaaaggcagagaatacgaactatcgt
aatattgcaattatgactgatgcagatcacgacggtcttggaagtatctatccggctttg
cttgctttctttagtaattggcctgaattgtttgaacaaggacgtattcgctttgttaaa
acgcctgtaattattgcacaaattggcaaagctcaaaaatggttttatactgtagctgag
tatgaagaagttaaagatacactgcctaagcatagtattcgatacatcaagggattaggc
tcccttgaaaagtcagaatatcgtgaaatgattcagaaccctgtgtacgacgtagttaaa
cttcctgaaaattggaaagaactctttgaaatgttgttgggtgatgattcagaacttcgt
aaagaatggatgtcctaa
DBGET
integrated database retrieval system
