Viruses: 40068736
Help
Entry
40068736 CDS
T40000
Symbol
FDG80_gp001
Name
(RefSeq) Escherichia coli O157 typing phage 6; tail fiber protein proximal subunit
KO
K26775
Straboviridae long-tail fiber proximal subunit
Virus
1508681
Escherichia coli O157 typing phage 6
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Gp34_2nd
Gp34_trimer
Gp34_C
DUF4410
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
40068736
NCBI-ProteinID:
YP_009592988
LinkDB
All DBs
Position
NC_041864:306..3137
Genome browser
AA seq
943 aa
AA seq
DB search
MNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASSVALLQFPKRSEYPPDAQWVSVTELEFNGTTSYVPVLE
LAYIEDTDSDTHYWVVQQNVPTVERVDAGNDATRARLGVIALATQAQANVDLENTPAKEV
AITPETLANRTATEARRGIAKIATTAQVNQNSTASFVDDTIVTPKKLNERTATETRRGLA
EIATQTETDAGLDDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVKYVSTTSATPAETRGAAGTNVYNK
TVNNLTISPKALDQYKATYAQQGAVILAVDSEVIAGQSQAGYSHAVVTPETLHKKTSTDG
RIGLIEIATQAETNAGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAELATQVEFDTGTDDTRIST
PLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTL
DDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATRAETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATT
AIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQPLESYEKNSYAISPYELNRVLANYLPLKAKAIDSN
LLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNSGT
ATRLIFEKGPQTGTNPAQTMTIRVWGNEFGGGSDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKAGN
ITFSINGTVMPINVNASGTLNANGVATFGRSVTANGEFISKSANAFRAISGDYGFFIRND
GGSTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLSINNQSGQITIGEGLIIANGATINSGGLTVNSRIRS
QGTKTSDLYTRAPTSDNVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVK
SPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPS
DIGALPSDNATIGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKSVKFEWIE
NT seq
2832 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaactacatgcgtaaaggccaaacagtaaaaattaaagctgccgaaggtgatacaatt
gcttcttctgttgcattgcttcagttccctaaacgttctgaatatccacctgatgctcaa
tgggtctctgttactgaactagaattcaatggcactacttcatatgttcctgtattagaa
ttagcgtatatcgaagacactgattctgacactcactattgggttgtgcaacagaatgtc
cctacggtagaacgtgttgatgctggaaatgatgctacacgagctcgtttaggtgttatt
gctcttgctactcaagcgcaagcaaatgttgatttagagaatactccagctaaagaagtg
gctattactccggaaacattggcaaatcgtacagcaactgaagctcgacgtggtatcgct
aaaattgctacaacagcacaagttaaccagaattccacagcatcatttgtggacgatact
attgttacgcctaaaaaactaaatgagcgtacagcaactgaaactcgtcgcggtcttgct
gaaattgctactcagactgaaaccgatgctggtcttgatgacacaacgattattacacct
aagaaattgcaggcacgtcagggttctgaaacactatcaggtatagttaaatatgtatca
actacttctgctactcctgctgaaactcgtggtgctgcaggcactaacgtttataataaa
accgtaaataatttaactatttctcctaaagcccttgaccaatataaagcaacttatgct
caacaaggtgcagtaattttagctgttgatagtgaagtaattgctggtcaatcacaagca
ggttattctcacgctgtagtaactcctgaaacactacataagaaaacttctactgatgga
cgtattggtttaattgaaattgctacgcaagcagaaactaatgctgggactgattataca
cgtgcagtaacgcctaagacgttaaatgataggaaagctacggaaggattatccggcata
gccgaacttgctacgcaagttgaatttgatactggaactgacgatactcgtatctcaact
ccactgaaaattaaaactcattttgattcttctgaccgtaccagtgttaattctgattcc
ggacttattgaagaaggaaccttgtggaaccattatactcttgatatttctaaagcaaat
gaaacacaacgtggtacacttcgcgtagcgactcaggcagaatctaatgcaggaacttta
gatgatgttcttattactcctaaaaagcttttagggactaagtccactgaaacgtctgaa
ggcgtaattaaggttgctactcgggctgaaactgtaacaggaacttctgctaatactgct
gtatctcctaagaatttaaaatggattgtccagtctgaaccaacatgggctgctactacg
gcgattcgtggattcgttaaaacttcatctggttctattacattcgttggtaatgataca
gttggttcaacgcaacctttagaatcatatgaaaaaaatagctatgctatatctccatat
gaattaaaccgtgtacttgctaactatttgccgttgaaagctaaagccatagatagtaat
ttattagatggtctagattcatctcagttcattcgtagggacattgcacagacggttaat
ggttcactaaccttaacccaacaaacgaatctgagtgcccctcttgtatcatctagtact
gctacgtttggtggttcagtttcggcaaatagtacattaactatttctaactctggaaca
gctactcgactgatttttgaaaaaggacctcagaccggaacaaatcctgctcaaactatg
actatcagagtttggggaaatgaatttggtggtggttcagatacaacacgttctactgta
tttgaagttggcgatgaaacatctaatcacttttattctcaacgtaataaagctgggaat
ataacgtttagcattaatggtactgtgatgccaataaatgttaacgcttcaggcacgtta
aatgcgaatggcgttgcaacatttggtcgttcagttacagccaatggtgaattcattagc
aagtctgcaaatgctttcagagcaattagtggtgattatggattctttattcgcaatgat
ggcggcagcacatattttatgcttactgcatctggtgatcagaccggtggatttaatgga
ttacgtccattatcaattaataaccaatccggtcagattacaattggtgaaggcttaatc
attgccaatggtgctactataaattctggcggtttgactgttaactcgagaattcgttct
cagggtactaaaacatccgatttatatacccgtgcgccaacatctgataatgtaggattc
tggtcaattgatattaacgattcagccacttataaccagttcccaggttattttaaaatg
gttgaaaaaactaatgaagtgactgggcttccatacttagaacgtggcgaagaagttaaa
tctcctggtacattgactcagtttggtaatacacttgattcactttaccaagattggatt
acttatccaacaaccccagaagcacgtacaacccgttggactcgtacatggcagaaaact
aaaaattcttggtcaagttttgttcaagtatttgatgggggtaaccctcctcagccatct
gatattggtgctttaccttctgataatgcaacaatcggaaacttgacaataagggatttc
ttaaggattggtaatgtccgcattattccagaccctgtgaataaatctgttaaattcgag
tggattgaataa
DBGET
integrated database retrieval system
