Viruses: 40072722
Help
Entry
40072722 CDS
T40000
Symbol
FDH13_gp005
Name
(RefSeq) Campylobacter phage vB_CjeM_Los1; homing endonuclease
Virus
1904491
Campylobacter phage vB_CjeM_Los1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Zn_ribbon_8
MTES_1575
Vsr
Cas12f1-like_TNB
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
40072722
NCBI-ProteinID:
YP_009597116
RS:
NC_041896
LinkDB
All DBs
Position
NC_041896:3901..5724
Genome browser
AA seq
607 aa
AA seq
DB search
MTLDEKIEFIISTGFNIVTHKSNSITLQCNHGHIFNKKLSNITTNTNIICDKCVVMSKEK
TLRELGFTPLLINGDKCTVKCDECNHTFNRTWYAFNTRKNTKCPECVETERWNNINSHLN
NMKVSYISDTQGNYTLQCKNGHIFKQGIAEIIKEVGCYQCEVEYRKEYIRNLDFTIIEYN
SKIFNVKCNKCNHVFTRDWNGFYNRKYTTCPNCTEIEKKNLAKKHGFTLTDTKFGNDIRE
FICDKCNTTFKRGWSSFTSRGNNKCYNCKQLSRISLVKSYGLDIINENITSKYTFKCNKG
HVFERPFTVVENKNQTKCPICYPRTSNFEIEVKNFLTELCIKYIQNDRNILDGLELDFYL
PDYNLSIECNGDYWHSDSVISDKKYHLNKTLKCNSQGIQLLHIFESNWIKNRNIWESIIK
NKLGLSFKIYARKCEIKEVNKIEEKEFLNKNHLQGFTGSAVCYGLYYQNELVELMSFGRS
RFNKNISWELIRLCTKINVNVIGGASRLLKMFENNYPNQTLLSYSNNLYSNGKIYNTLGF
EFNHTSSPGYFYYKNGMTYDRQQFMKHKLSSKLEKFDPNLTEAENMKLNGFYRVWDCGQG
VWVKYGG
NT seq
1824 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacattagatgagaaaatagagtttattattagtactgggtttaatattgttacgcac
aaatccaacagtataacattacaatgtaatcatgggcacatttttaataaaaaattaagc
aatattactacaaacacaaatataatttgtgataaatgtgttgttatgtctaaagaaaaa
acactaagggaacttggatttacacctttattgataaacggtgataaatgcactgtaaaa
tgtgatgaatgtaaccatacttttaatagaacttggtatgcttttaatactcgtaaaaac
acaaagtgccctgaatgtgttgaaacagaaagatggaataacataaattcccatttaaat
aacatgaaagtgtcatacatttctgatacacaaggtaactatacattacaatgtaaaaat
ggtcatatttttaaacaaggtatagcagaaatcattaaagaagttggatgttatcagtgt
gaagtagaatacagaaaagagtatataaggaatcttgattttactattattgaatataat
agtaaaatatttaatgtgaaatgcaataaatgtaatcatgtttttactagagactggaat
ggcttttataatagaaaatatacaacatgtcctaattgtacagaaatagaaaagaaaaac
ctagctaaaaaacatggatttactctcactgacacaaaatttggtaatgatataagagaa
tttatatgtgataaatgtaatacaacatttaaaagagggtggtcaagtttcacatcaaga
gggaataataaatgctataactgtaagcaacttagtagaataagtttagtaaagtcatat
ggattggatatcataaatgaaaatattacttcaaaatatactttcaaatgtaataaggga
catgtttttgaaagacctttcactgttgtagaaaataaaaatcaaacaaaatgccccatt
tgttatcctagaacctcaaactttgagatagaggttaaaaacttcttaacagaattatgt
ataaaatacatccaaaatgacagaaatatattagatgggttagaattagatttttattta
ccagattataatctatcaattgaatgtaatggagattactggcattcggatagtgttatt
agtgataaaaaatatcatttaaataaaactctgaagtgtaattcacaaggaatacaatta
ttacacatatttgaaagtaactggataaagaatagaaacatttgggaatctattattaaa
aacaaattagggttgagctttaaaatatatgctagaaaatgtgaaattaaagaagttaat
aaaatagaggaaaaagaatttcttaataaaaaccatttgcaaggatttactggttctgct
gtttgttatggactatattaccaaaacgaacttgttgaacttatgtcatttggtagatca
agatttaataaaaacatatcatgggaattgataaggttatgtactaaaataaatgttaat
gtaataggtggtgcatctaggttattaaagatgtttgaaaataattatccaaaccagaca
ttattatcttattctaacaacttatattctaatggtaaaatatataatacattagggttt
gagtttaatcacacatctagtccaggttatttttattataagaatggtatgacttatgac
agacaacaatttatgaagcataaacttagtagtaaattagaaaagtttgatccaaatttg
actgaagcagaaaatatgaaattgaatggattttatagagtgtgggattgtggtcagggt
gtttgggtaaaatatggtggttaa
DBGET
integrated database retrieval system
