Viruses: 40072866
Help
Entry
40072866 CDS
T40000
Symbol
FDH13_gp149
Name
(RefSeq) Campylobacter phage vB_CjeM_Los1; homing endonuclease
Virus
1904491
Campylobacter phage vB_CjeM_Los1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
MTES_1575
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
40072866
NCBI-ProteinID:
YP_009597260
RS:
NC_041896
LinkDB
All DBs
Position
NC_041896:complement(111955..113574)
Genome browser
AA seq
539 aa
AA seq
DB search
MDKVKFLNNLGYEVVSEDLVRNLYVKCKNNHIFKREFGDFKKGYIKCSKCEEEQKLEFIK
GLGYEVVTMDKKGKLLLKCRNGHTIKKYYGNFKKGTTTCNECIKEEKIKFIKSCGYEPAS
ENLAHDLFIKCKNGHIFKREYNDLKKGYINCPKCNEEDKVKLITSFGYTIINQYNSEELE
LMCKNGHISKRIFNNFKNFPLCSECVEDKRTSFIKELGYKIVEKNLFECKNGHTFSREVK
SFRKGCVYCPICNPSTSSFEKEMSELLGDYISNDYSVLGDKELDFYVPNHNLAIECNGDY
WHSESNGKDKNYHLDKTNKCLEKGIQLLHIFESSWIEKKDIWKSIINNKLGKSDKIMARK
CILKEVPKTEGKEFLESNHLQGFTGSTVCYGLYYQDELVCLMSFGKSRFTDKYDWELIRL
CTKKNTNVVGGASKLLKHFEKENEGSLISYSDRLYSDGSIYKQLGFEFSHYSKPGYFYYK
NGTKYSRQQFMKHKLKDKLEKFDPNLTESENMNINGYYKVWDCGQGVWVKNRKGILCHQ
NT seq
1620 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataaagtaaagtttttaaataatttaggttatgaagttgtatctgaagacttagtt
agaaacttgtatgtaaaatgtaaaaataatcatatttttaaaagagaatttggtgatttc
aaaaaaggatatataaaatgttctaaatgtgaagaagagcaaaaactagaatttataaaa
ggattaggttatgaagttgttactatggataaaaaaggaaagttattacttaaatgtaga
aatggacacactataaaaaagtattatggtaactttaaaaagggaactactacatgtaat
gaatgtataaaagaagaaaaaattaaatttattaaaagttgtggttatgagccagcgtca
gaaaacttagcacatgacttattcataaaatgcaaaaacgggcatatttttaaaagagaa
tataatgatttaaaaaaaggatacatcaactgcccaaaatgtaatgaagaagataaggta
aaacttataactagttttggttataccataataaatcaatataactcagaagaattagaa
ctcatgtgtaaaaatggtcacatatccaagagaatattcaacaattttaaaaacttccca
ttatgtagtgaatgtgttgaagataaaagaacatcatttataaaagaattaggctataaa
atagttgaaaaaaacttgtttgaatgtaaaaatggacatacttttagcagagaagtaaag
agctttagaaaaggatgtgtatattgtcctatatgtaacccttctactagctcatttgaa
aaagaaatgtctgaattattaggtgattatataagtaatgattattcagttttgggtgat
aaagaattagatttttatgtcccaaaccataacttagctattgaatgtaatggagattac
tggcattctgagagtaatggaaaagataagaactatcatttagataagactaataaatgt
ttagaaaaaggtattcagcttttacatatattcgaatcatcttggatagagaaaaaagat
atttggaaatcaattataaacaataaactaggtaaatcagacaagataatggctagaaaa
tgtattttaaaagaagtgcctaagacagaagggaaagagtttttagaaagcaatcatctc
caaggatttactggatcaactgtgtgttatggattatactaccaagatgagttagtgtgt
ttaatgtcatttggaaaatctagatttacagataagtatgattgggaattgattagatta
tgtactaagaagaacacaaatgtagtaggtggtgcttctaaattattgaaacatttcgaa
aaagaaaatgaaggttcattaataagttactctgacagattatattctgatggatcaatt
tataaacaattagggttcgaatttagccattattctaagccaggttatttctactataag
aatgggactaaatactctagacaacaatttatgaaacataagcttaaagacaaactagaa
aaatttgatccaaacttaactgagtcagaaaatatgaatataaacgggtattataaagta
tgggattgtgggcaaggtgtttgggtaaagaataggaaagggatattatgccaccagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
