Viruses: 40074873
Help
Entry
40074873 CDS
T40000
Symbol
FDH30_gp078
Name
(RefSeq) Providencia phage vB_PreS_PR1; straight fibre tail protein
Virus
1931407
Providencia phage vB_PreS_PR1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
PB4_spike
Fn3-III_PB4
Fn3-I_PB4
Fn3-II_PB4
Collagen
Flavodoxin_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
40074873
NCBI-ProteinID:
YP_009599168
RS:
NC_041913
LinkDB
All DBs
Position
NC_041913:complement(82598..85714)
Genome browser
AA seq
1038 aa
AA seq
DB search
MIKNPSPAKMVLSSIAVGYTKALVYHSPFTDPDTIGKTFWITTGNKEVAQTSQDLNTFYM
ILEKLTPNTKYSVTGAYWDSMVDSELLANKLSILISDSSNITTLLAPRIKSYKAEMEAAV
VGVGTSYLIVDFEGAGQIVELQLSKDGKTWETIYSGEIKEGVRLANIPAGTYKARCRGRV
ALPDGFTTDISDWTQYPADLVVNYAFTPPSKPTNLTFTAARILDGNERYDVQVKWNWSAG
SGANIREFVMYYVSKAEFDKTGWAKAARVNTGATQAAIITGFPWEIPTVFKVEAISWGPS
DKNTTASDNANFTLNASIPLDSSFTKTTGIEITYSHIKGQKQVNGKWEQTFLLNASDGSF
SLGMLNDKGVAPISMDPVTGTVNVDGRIISNEIYAASVVLSNLTGQDNPKIYSTGKTYGG
DTSGVWMGMGKDGLARFDVGNKDSFIRFDGEKIWMSAGVTIGTPNGDITIGDGITGIRQV
TIYQLNTAAPSIPVSQEYPPPGWSKTPPSIQDPFKQKIYASTGQLDPVTDKLVSGTNYSQ
PVQWSGTTGSDGKPGSNGSNGLDGKGTVSIYQLGNKGTVPVASTLPDYPPNGWSTTPPAI
PNPLTQCVYVSIGQLDPKTNKLVSGTKWATPVQFTGNNGNNGQDGKPGADGKPGSNGTNG
LPGKDGFGLTYVYQVSRTQPVIPGGIEYPPTNWSKTPPANYNPTVEAVYASMGTLDPRTN
KLVAGTGWSTPIQWSGIPANPVNNNLLTGTTDLVIVDSSNTSVSKSSMLSTEFMPTVESF
NLLKGKKVTVSCFIETNGIVEGTAGGRHRIGCEMSITYVDGQTQHIGTWYDRGTATSAVS
KATITIQNKEVKSVAAMGVHIQGKTTFGKVSQVKLEEGDVATAWVDAGKNGKPGADGKPG
ANGTNGTPGANGQRGPGFYRQGRGAAGWSDADATAFFKSTFSSTPVQYDVLTQYHTANPK
AGITRQWNGSSWTNPALMVHGDMVLDGTITSKKIVADQAFFAQTGINVIYDRAAALSSNP
EGTYKMKIDLQNGSIHIR
NT seq
3117 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaaaaacccatctccagcaaagatggttctgagttcaatagcggtagggtacact
aaggctttagtgtaccactccccttttacagacccagatactatcggtaagacattctgg
attaccacaggtaataaagaagtagcacaaacttcacaagacctaaatactttctacatg
atcctagaaaaattaactcctaatactaaatatagtgtcacaggagcatattgggattct
atggtagattctgaattattagctaataagctaagtatcttaatatccgactctagtaat
ataacaactcttctagctccacgaataaaatcttataaagcagagatggaagcggcagtt
gttggggtaggtacatcttatttaattgttgattttgaaggggcaggacaaatagttgaa
ctacaattatctaaagatggtaaaacgtgggaaactatctattccggagagattaaagaa
ggggtacgactagctaacattcctgctggtacatacaaggctcgttgtaggggacgtgtt
gcactaccagacggcttcactactgatatctctgattggactcagtatccagcagacctg
gttgttaattatgcatttactccgccaagtaaacctactaacctaacttttactgctgct
agaattttagacggtaacgaaagatacgacgtccaagttaagtggaattggtcggcaggt
agtggtgcaaacatccgggaattcgttatgtactatgtatctaaggcagagtttgataaa
actggttgggctaaagcagcacgtgttaataccggtgctactcaagcagcaattattact
ggattcccttgggaaattccaacagtatttaaggtagaagccatctcgtggggcccttct
gataagaatactaccgcaagtgataatgctaactttacattaaacgcaagcataccatta
gactcttcatttactaagactacaggtattgagataacttattcccatatcaaaggtcag
aaacaggtaaatggtaaatgggaacagactttcctattaaatgcgtcggatgggtctttt
agtcttggtatgttaaatgataaaggggttgctccaatatctatggacccagttactggt
acagtaaacgttgatggtagaatcatctctaatgagatatacgctgctagtgttgttcta
tctaaccttactggacaagataaccctaagatatactctactggtaagacttatggtggt
gatacatcgggtgtttggatgggtatgggtaaggacggtcttgcaagatttgacgttggt
aataaagatagttttatccggtttgacggtgaaaagatctggatgtctgctggagtaact
attggtacacctaatggggatattaccataggtgatggtattactggtatcagacaagtt
actatttaccagctaaacaccgcagctcctagtatacccgtttctcaagagtatccgcct
ccaggatggagtaaaactcctcctagcattcaagatccttttaaacaaaagatctatgca
agtactggtcagttagatcctgttactgataagctagtttctgggactaactattctcaa
ccagttcaatggagtggtactacggggtctgatggtaagcctggtagtaacggtagtaat
ggtctagatggtaaaggtactgtatcaatttaccagctaggtaataaaggtacagtacct
gtggcttctacattaccagattatcctccgaatggttggagcacaactcctcctgctata
ccaaatccattgacccagtgtgtgtatgtatcgattggtcaactagatcctaagactaat
aaactagtttcaggaactaaatgggcaactccagtacagtttacaggcaacaatggtaat
aatgggcaagacggtaagcctggtgcggatggtaaacctggctctaatggtactaatggg
ttaccgggtaaagacggttttggtcttacatacgtttatcaagtatctagaacacaacca
gttattcctggaggtatcgagtacccaccaactaactggtctaaaacaccaccagctaac
tataacccaacagtagaagctgtatatgcctctatgggtacactagatcctagaactaat
aaactagttgcaggaacaggttggtcaactccgattcagtggagtggtataccagctaac
cccgttaataataacttgcttacgggtactacagatctagttattgtggactctagtaac
actagtgtaagtaagtcttcaatgctatctactgagtttatgccaacagtagaatccttt
aacctacttaaaggtaagaaagtaactgtatcctgttttatagaaactaacggtattgta
gagggtactgctggcggtagacataggattggttgtgagatgagtattacttatgtagac
ggtcaaacccaacatattggtacttggtacgatagaggtactgctacttctgcggtatcc
aaggctactataactattcagaataaggaagttaaatctgtagctgcaatgggtgtgcac
atccaaggtaaaactacttttggtaaggtatcacaagttaaactagaggagggagatgta
gctaccgcttgggtagatgcaggtaagaatggtaagcctggagcagatggtaagcctgga
gctaacggtaccaatggtactccgggtgcaaacgggcagcgtggtcctgggttttacaga
cagggtagaggggcggctggctggtcagatgctgatgctactgcgttctttaaatccaca
tttagctctacccctgttcagtatgacgtattaacccaatatcatacggctaaccctaaa
gcaggtatcactagacagtggaatggtagttcatggactaatccagcacttatggtacat
ggagacatggttctagacggtacaattacatctaagaaaattgttgccgatcaggcattc
tttgcacaaactggtattaacgttatatatgaccgtgctgctgcattatcatctaatcca
gagggtacatataagatgaagatagacttacaaaatgggtctattcatataaggtaa
DBGET
integrated database retrieval system