Viruses: 40076858
Help
Entry
40076858 CDS
T40000
Symbol
FDH45_gp099
Name
(RefSeq) Staphylococcus phage phiIBB-SEP1; RNA ligase
Virus
1340769
Staphylococcus phage phiIBB-SEP1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
RNA_lig_T4_1
AAA_33
Metallophos
KTI12
Zeta_toxin
AAA_18
Viral_helicase1
Metallophos_2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
40076858
NCBI-ProteinID:
YP_009601024
RS:
NC_041928
LinkDB
All DBs
Position
NC_041928:89130..91466
AA seq
778 aa
AA seq
DB search
MKQLLLMRGVPGVGKSTFIKEKGLENYTLSPDTLRLQFGSPIYNEEGRIAITQDKDNLVW
KTLFEILENRMSNGEFTVIDATHSTGKLIKRYEKLAKVYGYRVYVVTLEEDLDTLIERNN
QREKLKQVPVEVIENIYERLQHEHIPSVAKELKPEEVLSSLEWDKDFMEVNNYDKIHVIG
DVHSCFTALNEFASYNYIVDHPNELFIFVGDYFDRGLEPKETFDYLELIHNLDNVELLEG
NHERHLRKYAYLDTDTYKELHEVSDDFSKLFKLALDVFKARGFVYTLKSFLDNGITPKRV
RAILRNLQQVLYFNYRGQYYVINHGGILPNMLDNLNKVSTHQLINGVGSYEFDVDSKWKD
SSVIQIHGHRNLYRERLDLTKNSINLEGRVEKGGYLRAVTINSDNSIDPVLIKNEKFNHK
FLVNEDYLKSIDKDLTVDKYLSLAKEEKKSIKVIEQYNYVVSVNFTKKAFDKKRWNQLTV
SARGLFIDTLVNKILGRGYNKFFNINERPETKLDALPDIIKFPLYGYKKENGYLGLVYFD
SNIDDLVFCSKSKTHLSKHNNDYALWFKDLFDKQFDDIQVETIVKYLKEHDRTLVFEVID
IENDPHIIEYDKSHIVLLDIIHNTLEFKKESYSNTYTFALSIGVPFKSWSLMFDTWVEFY
DWYKNNHNSLDIKHEGYVFEDSNGFMFKYKSKYYNDWKYMKGIVESLAKGNDRRPIQRIL
QENESLRAFYYWVRDYSNLTRKELKNTDIITLRKMQEEFAKNETGRTHNEINQVWRDS
NT seq
2337 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacaattattattaatgagaggtgtaccaggtgtaggtaaatctacttttattaaa
gagaaaggactagaaaattacacattaagtccagacactttaagattacaattcggttca
cctatctataatgaagaaggtagaatagcgattactcaagataaagataatctagtttgg
aaaacactatttgaaattttagaaaatcgtatgagtaatggtgaatttactgtaattgat
gctacacactctacaggtaagttaattaaacgatatgagaagttagctaaagtatacggt
tatcgtgtttatgtagtaaccttagaagaagacttagatacattaattgaacgtaataac
caaagggaaaaattaaaacaagttcctgtagaagttattgagaatatttatgaaagacta
caacatgaacatattcctagtgttgcaaaagaattaaaacctgaagaagtattaagttct
cttgagtgggataaagattttatggaagtaaataattatgataaaattcatgttatcggt
gatgtacattcttgtttcacagctttaaatgaatttgctagttataattacattgtagac
caccctaatgaattatttatttttgtaggggattatttcgatagaggtttggagcctaaa
gaaacttttgattacttagaacttatccataacttagataatgtagaattattagaaggt
aatcatgagagacatttacgtaagtatgcttacttagatacagatacgtataaagagctc
catgaagttagtgatgactttagtaagttatttaaattagccttagatgtatttaaagct
agaggttttgtgtacacgttaaaatctttccttgataatggtattacacctaaacgagta
cgtgctattttaagaaacttacaacaagttttatactttaattatagaggacaatactat
gttattaatcatggtggtatcttacctaatatgttagataatttaaataaagtatcaaca
catcaacttattaatggtgtaggtagttatgaatttgatgtagacagtaaatggaaagat
agttcagttattcagattcacggtcatagaaatttatatcgtgaacgtttagatttaaca
aaaaattctatcaacctagaaggtagagttgaaaaaggtggttacttaagagcagtaacg
attaatagtgacaactctattgaccctgtattaattaaaaatgaaaaatttaatcataag
ttcttagttaatgaagactatttaaaatcaattgataaagatttaacagtagataaatat
ttaagtttagctaaagaagagaaaaaatctatcaaagtcattgaacagtacaattatgta
gtatctgttaactttactaaaaaagcatttgataaaaaaagatggaaccaattaacagta
agtgctagaggattatttattgatactctagtaaataaaattttaggtagaggttataat
aaatttttcaatattaatgaaagacctgagacaaaattagatgcattacctgatattatt
aaatttccgttatatggttataaaaaagagaatggttatttaggtttagtttactttgat
tctaacattgatgatttagtcttttgtagtaaatcaaaaacacatttaagtaagcataat
aatgattatgctctatggtttaaagatttatttgataagcagtttgatgatattcaagta
gaaacaatcgttaagtatcttaaagaacatgatagaactttagtgtttgaagttattgat
attgaaaacgacccacatatcattgaatatgataaaagtcatatcgttttattagatatt
attcataatactttagaattcaaaaaagaaagttattccaatacttatacatttgcttta
tctatcggagtaccttttaaatcatggtctcttatgttcgatacttgggtagagttttat
gattggtataagaataatcataattctttagatattaaacatgaaggatatgtatttgaa
gattcaaatggttttatgtttaagtataaatctaagtactataatgactggaaatacatg
aaaggtatcgtagaaagcttagctaaaggtaatgatagacgacctattcaaagaatttta
caagaaaacgaaagtttaagagctttttattactgggttcgtgattattctaatttaact
agaaaagaacttaagaatacagatattatcactttaagaaaaatgcaagaagaatttgca
aaaaatgaaacaggaagaactcataatgaaataaatcaagtttggagagatagttaa
DBGET
integrated database retrieval system