Viruses: 40080479
Help
Entry
40080479 CDS
T40000
Symbol
FDH92_gp02
Name
(RefSeq) Acinetobacter phage WCHABP5; tail fiber protein
Virus
1983525
Acinetobacter phage WCHABP5
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Pect-lyase_RHGA_epim
TSP_Ig-like
Phage_T7_tail
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
40080479
NCBI-ProteinID:
YP_009604582
RS:
NC_041967
LinkDB
All DBs
Position
NC_041967:3183..5282
AA seq
699 aa
AA seq
DB search
MNILRSFTETVVTTPTDIFPISFEYDEKYDAVHVFLNDVAVEDLGYTVSQVNAVTLKIEP
AIPDGTVRIERETDIDKMKYIFDAGALFIDQNVDADFRQIVHSQQEVRDGFIKLRGDVLP
LVHGLQEALQQAQEASEAAQEAANAAEVAASQTQYYLKYFNPEIVYPKNARIMLDNGDIV
RSTVVNNTSNPNVDMTGWVKVNSVSQIFDETYNITQSVINGNLITVDNFGAKGDGVTDDS
AAFQAYCNSPLTGQNLYLGAKGRYIIKNQVDLKGKGIVGNGCGKVSEFYYNLGCIDVDGS
SPDLQGKTAFINCGPTIQNLTARCSNGAGKQVSFVEIDGYLANISYVTIVNFYNQIVVKE
ALVGFNINNAWLYYSQNAGIYCEDPNNRVSTTGTFHNMYFQLGDGYAMIFDRDIHGCDFD
NIIFESMNGGIKARTVAHCGFGKFWCENLKTATSKAWLEVTGANSCYGNSFTGYVKLLGG
WTSKTSPTLDSLSTNNYGGVLVSAEGISIVNAGNKAKMLMLPSGFKTGNATIDETHISSS
TVTPLVKRRVIGADGSGAQYLASDTYTKLSRKWGTYNHGSNNAGAFYAPMMLTYDQSFST
PQNNNGWKIVKESTGVYRVERVSGNTSVITNGHIVVGSPLMGSRLGTGTGATHGIQMIET
YAGSWTSYTEAAGFKVFWRDSSNALVDPHRFTVAFTATS
NT seq
2100 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatatactacgctcatttacagagacagtggtgactacacctacagatattttccct
atcagttttgagtacgatgagaaatatgatgctgtacatgtctttcttaatgacgtagca
gttgaagacttggggtacactgtatctcaagttaatgctgttactctaaaaattgaacct
gctattccagatggtacagttcgtattgaacgcgaaacagatattgataagatgaagtac
atctttgatgctggtgcgttattcattgaccagaatgtggatgcggattttagacaaatc
gtacattcccagcaagaggtacgtgatggttttattaaactacgtggtgatgtactacca
ttagtacatggtttacaagaagctttgcaacaagcacaagaagctagtgaagctgctcaa
gaggctgctaatgcagcagaagtagctgcttcacaaacacagtactacttaaagtacttc
aaccctgaaatagtgtaccctaaaaatgcgcgcattatgcttgataatggcgatattgtt
cgctctaccgttgtgaataatacatccaatccgaatgttgatatgactggatgggtaaag
gttaattctgttagtcagatttttgatgaaacttataatatcacccaatcagtaattaat
ggaaatctaattactgttgataattttggcgcaaagggtgatggggttacagatgatagc
gcagcatttcaagcatattgtaatagtcccttaactggacaaaatctgtatcttggtgcg
aaaggtcgatacattatcaagaaccaagtagaccttaaaggcaagggcatagtggggaac
ggttgtggtaaggtaagtgaattttattataatcttggttgtattgatgttgatggctca
agccctgatcttcagggtaaaacggcattcattaattgtggtcctacaatccaaaatctt
actgcaagatgctctaatggagccggaaaacaagtttcatttgttgaaatcgacgggtat
ttagcaaatatttcttatgtcacgattgtaaacttttacaatcaaatcgtagtaaaagag
gcacttgttggctttaacatcaataacgcttggttgtactactctcaaaacgctggtatc
tactgcgaagatcctaataaccgtgtaagtacaaccggaacattccataacatgtatttc
cagttaggtgacggttatgcaatgattttcgacagggatatccatgggtgtgatttcgat
aatattatattcgaatctatgaatggaggtatcaaggctcgaacagtagcacattgcggg
tttggtaaattctggtgtgagaacttaaagacagctacatctaaagcttggctagaagtc
actggtgctaatagctgttatgggaatagctttactggctacgttaaattattaggcggg
tggacgtcgaaaacatcaccaacgctagactctttgtcaacaaataactatggtggtgta
ttggttagtgcagagggtatctctattgttaatgctggcaataaagcaaaaatgcttatg
ctgccaagtggttttaagactggcaacgcaacgattgatgaaacgcacattagctcatct
accgtaacacccttagttaagagacgtgttattggcgcagatggctctggagcacaatac
cttgcatcagacacctatacaaagctttctcgcaagtggggaacatataaccacggatca
aataatgctggggcgttttatgcaccaatgatgcttacttatgatcagtcatttagcaca
ccacaaaacaataatggttggaaaatcgttaaagaatctactggcgtttatcgggttgaa
cgtgtttctgggaatacttcggtaatcacaaatgggcatattgttgttggctcaccacta
atgggttctcgtctgggtactggaacaggtgctacgcatggaattcaaatgattgagacc
tatgcaggttcgtggacttcttacacagaagctgctggttttaaagtgttttggcgcgat
tctagcaatgccctagtcgatcctcatagatttacagtcgcatttacagcaacgagttaa
DBGET
integrated database retrieval system