Viruses: 40088291
Help
Entry
40088291 CDS
T40000
Symbol
FDI40_gp288
Name
(RefSeq) Agrobacterium phage Atu_ph07; tail fiber protein
Virus
2024264
Agrobacterium phage Atu_ph07
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
40088291
NCBI-ProteinID:
YP_009611953
RS:
NC_042013
UniProt:
A0A223W032
LinkDB
All DBs
Position
NC_042013:complement(222105..223937)
Genome browser
AA seq
610 aa
AA seq
DB search
MAYKTSRPEGMQKFGTTIADGPDSVTLIDSVDVQRGIMVLRGLVAGEGIKFTLVDADRSP
VTPGEVIEISVEGGAGGGDGAKWFAGNGVPSATLGVNGDMYIDQETADIYRKENGTWLFK
LNIKGEVGEQGPQGIQGPQGIQGIQGIQGEQGVAGAPGPTGPQGVAGPIGPQGIKGDTGD
VGPQGIQGVQGSIGPAGPQGDVGPAGPQGVAGVQGSTGPQGAPGAGMVPDQYGIFDESVI
TAIEAANVDWNFLVIAGGDDRTDNQQPAGIAGDMGGHLIHYDAATGVWDDIGPVVGVAGP
IGPQGPAGANGADGAEGPQGAEGPQGIQGVQGIQGEKGDKGDKGDKGDGILLKGAVDDVA
DLPTTGNVEGDAYSVNGDLYVWNGTEFVFGGRLTGPQGPVGPAGADGRDGVDGEQGPIGP
QGEQGIQGPVGPAGADGEGVPPGGTTGQVLAKSSDTDGDVEWVDQSGGDGVPPGGTTGQV
LTKTSNADGAATWQTPSSGPVVPPDAWIPLSYRFRLNLSGTEIGSFEEIPTGWTITKTGN
NALSITHDVGRFGQYFFTLGWTANNKYVSRVTGAVAPMNQPDTSTIEISTIGTSSAGIAG
GSHMYVYITF
NT seq
1833 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcttataaaacttcacgtcccgaaggaatgcaaaaattcggtacaactatcgcggac
ggaccagattccgttacgcttattgactcagtagacgttcagcgcggtattatggtactt
cgtggtcttgttgcaggcgagggtattaaatttacattagttgatgctgatcgttctcct
gtaacacccggcgaagttattgaaatttccgtcgagggcggcgcaggtggcggcgacgga
gcaaaatggtttgctggaaatggcgtaccttctgcaacactcggtgtcaatggtgacatg
tacattgatcaagaaaccgcagacatttaccgtaaagaaaatggcacttggctgtttaaa
ttaaacattaagggtgaagttggcgaacaaggtccacaaggcatccaaggcccacagggt
atccaaggtattcagggtattcaaggtgaacaaggtgttgctggcgcacccggccctacc
ggcccacagggtgttgctggcccgattggtccacaaggcattaagggcgacaccggtgat
gttggaccacagggtatccaaggcgttcagggttctattggtcctgctggcccacagggt
gatgttggtcctgccggtccacaaggtgtagcaggtgttcagggatcaaccggaccacaa
ggcgctcccggtgcaggtatggttcctgatcaatatggtatttttgatgaaagcgttatt
actgcaattgaagcagcaaacgttgattggaatttcttggttatcgctggtggtgatgat
agaacagataatcagcaaccggctggtattgcgggtgatatgggcggtcaccttattcat
tatgatgctgcaactggtgtttgggatgatatcggtcctgttgttggtgttgctggccca
attggtccacaaggaccagcaggcgcaaatggtgcagatggcgcagaaggcccacaaggc
gcagaaggcccacaaggtattcagggcgtacagggtattcagggcgaaaaaggcgacaag
ggcgacaaaggtgacaagggcgacggtattctgttaaagggcgcagttgatgatgttgca
gatttgcctacaacgggaaatgttgaaggcgatgcatattcagttaacggtgacctttac
gtatggaatggaacggagttcgtatttggtggtcgtttgaccggtccacaaggtccagtt
ggtccagcaggtgctgatggtcgtgacggtgttgatggtgaacaaggccctatcggccca
caaggcgagcaaggtatccaaggtccagtaggtccagcgggtgcagacggcgagggtgtt
cctcccggtggtacgaccggtcaggttcttgctaaatcatcggatactgatggtgatgtc
gaatgggttgatcaatctggtggtgatggtgttcctcccggtggtacaacaggtcaggta
ttgactaaaacatctaatgctgatggtgctgcaacttggcagactccatcaagcgggccg
gttgttcctccagatgcgtggattcctctttcttaccgtttccgtttgaatctttctggt
acagaaattggttcatttgaagaaattcctacaggttggactattactaaaacggggaac
aacgcattgagcatcacgcacgatgttggacgttttggtcaatacttctttactctcggt
tggacagcgaataacaaatatgtttctcgtgttactggcgcggtggctcctatgaatcag
ccggatacaagtaccattgaaatttcaactattggaacttcttctgctggtatagcaggt
ggttctcatatgtacgtttatattacgttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
