Viruses: 40088576
Help
Entry
40088576 CDS
T40000
Symbol
FDI40_gp573
Name
(RefSeq) Agrobacterium phage Atu_ph07; autotransporter adhesin
Virus
2024264
Agrobacterium phage Atu_ph07
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Beta-prop_EML_2
WD40_CDC20-Fz
DUF7225
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
40088576
NCBI-ProteinID:
YP_009612238
RS:
NC_042013
UniProt:
A0A2L0V0I2
LinkDB
All DBs
Position
NC_042013:complement(404199..408350)
Genome browser
AA seq
1383 aa
AA seq
DB search
MLLNVTEVTSNLSSTRNLAFSADGEWIAAVPQITTASTTFQVYKKTSAGNFDDPAINVSI
PVSNASIDYVTISPNSQKMAVATGINKVYLYNLVGGVWTYYNELTPPARPVSVKYAQDSN
DLLVNCNNGVSLVYNTDLLTQLYTVTRSVQQVLVDSSLSADTNIFISSSATTNSTSYGVF
IYTKTGGTYTTAQVTNFSNSIYGIKISADGLKIYISTNNGVYILRRASSTQTFNQSIYYS
KSTSPILIRDFGIYDGKYLIGPGATTGLFGAYDSTEANKYLETSVLYDTPIDGPSIPTTY
INSSTFSDNRFVAYVSGTAPKVYSVSKKTVTTAKFYDGNTISGYSTPVYQFVLSKDKTKF
FTMFSARYNNSPTYNFGDVKNGQLIPNNKLSFNNTQAVSVSAGTVSSFSPSNNYFALSSA
NVLRLFKLSTDGVYDELSYTPALSIAPVVAEFSPNEQYVVSFSRTVINVHSINGTLATNV
TVNLNGATLADLASIVWYSNTQFIVSSYSAGMYFFEYDSVNNRFNLKRSLLTSEYENRSM
VLSQDKRFIYAIKNTAVGSFWGAKYTITDFDNISYTGIITDNYSNTAAAIKFIRLSPDGT
KLFITGQSTPWFGMYTVDTVSGDITPITLTTKETINATAYGCDWLTNETFFVGYNGEYAN
NWSLKSYRYNSSTNSVTDDSTLLINMVTYSNINGAAITSDAKNIYVSAPSNITSTTGLTR
FEKNSDGRYVRVQQLNNVSTGGVLIVANGKYMLAITATATNNARLYERNSEGLFVDYTEF
TISGTISSSFFHKIDENNIVFITSTSGGGYFHYHISNEGVVTQKQTIDRINATSFYYVGQ
SYNSQYIYFSDTSTNLRIFEKQVSGDYTLKTSQAGVNANIFRLWSSPTNPSAGIMKLSTS
MTYVDINADGTINFGATIQTNTTAACWYNDGSGFFITGTNATNNGITSTYLFDNSSKKWF
KNPEVIYPTGSISGTLVNVNSGLDITNPAKDVVVYIQAQPTSISTSTITAGARAIGIQYV
ESEKVVTGSINVVLSSIETEGELVTDLAIDSDTLINPITTTGEIDTPIAATLDITLNPFI
ISGFFGEKSEYDIDLTLTTAFSIVRPDNWSELTTTPLEQPYAYGDVKLRPISNDGLLSLL
PDVSGDVLINSITSTGILGEERSISGDTVIPSVITDGMILSTPFLVGDVTLPTIETSGTL
SDGEEGSIEIILNRISTEGVLEQQQNATIDVTLNSITTEGLIETEFAINGDVTINSITTE
LNGYIIGNTLTGDVLISSIETTGSISYSLEANIDITLNNITTEGELRVSGNILPSDVLIP
SIQTEGQLAQTQEIDGPIVINNITTEGFLETRLEITGNVLINSISSNGELKKLSARRRFM
NIV
NT seq
4152 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctattaaatgtcacagaggtaacttcgaatttatcatcgacacgaaatcttgcattt
tctgcggatggggaatggattgctgccgttccacaaataacaaccgcaagcacaacattt
caagtttataaaaaaacaagtgccggtaattttgatgatcccgctataaatgtatcaata
ccagtatcaaatgccagtattgattatgtaaccatttctccaaattctcagaaaatggct
gttgctactggtatcaataaagtatacctttataatttagtaggaggcgtttggacttat
tataatgagttgacaccacctgcacgcccggtatcagtgaaatatgcacaagatagtaac
gacttgctcgttaattgtaataatggcgtatcacttgtatacaataccgatcttctgacg
cagttatacactgttacaagaagtgtacaacaagtattggtggattcgtcattaagtgca
gatacgaatattttcatttcgtcatcagcaacaacgaactcaacctcatatggtgtcttt
atatataccaaaaccggtggaacatacacaaccgcgcaagtaacaaatttttctaactca
atttatggtattaagatttcagcagacggtttaaaaatttatatttctactaataacggc
gtatatattcttagacgtgcgtcctcaacgcaaacatttaatcagagcatatattatagt
aaaagtacatcgccaatattgattcgtgatttcggtatttatgacgggaaatatcttatc
ggtcccggtgcaacaacaggtctatttggtgcatacgattctactgaagccaacaaatac
ctcgagacttcagttttatatgacactcctattgatggtccctctattccaacaacatac
attaattctagtacctttagcgataaccgttttgttgcatatgtttctggaacggcacca
aaagtatattctgtatctaaaaaaactgttactactgctaagttttatgatggcaatacc
atctctggatattctactccggtatatcaatttgttttatcaaaagataaaaccaaattt
ttcactatgttctcggctagatataacaatagccctacatataattttggtgacgttaaa
aatggtcaacttataccaaacaataagttatcatttaataatacacaagctgtttcggtt
tcagccgggacagtgtcgtctttctctccatcaaataattattttgcattatcatctgct
aatgttttacgcctatttaaattatctacggacggagtatatgatgaactttcatatact
cctgcgttgtcaatagcgccggtcgttgctgaattttctccaaatgaacaatacgtggta
tcttttagtagaactgttattaatgttcatagtattaatggtactcttgcaaccaacgta
acagtcaatctcaacggtgcaacattagccgatttggcaagtattgtgtggtattctaat
actcaatttattgtaagctcctatagcgccggtatgtatttctttgaatatgattcggtc
aataacagatttaatttgaaacgatcattattaacgtctgaatatgagaatagatcaatg
gtcttatctcaagataagcgttttatctatgcaatcaaaaacacggcggttggttcattt
tggggtgcaaaatataccattacggattttgacaatattagctataccggtattataaca
gacaactatagcaataccgctgccgctattaaattcatccgcctatcaccagacggtaca
aaattattcatcaccggtcagagtaccccttggtttggaatgtacacggttgataccgta
tcaggggatataactcctataacattaactaccaaggaaactattaacgcaacagcgtat
ggttgtgattggttaactaatgaaacatttttcgtaggttataatggcgaatatgctaat
aactggtcattaaaatcatacagatataattcttcaaccaatagtgttacagatgattct
acgttattaattaacatggtaacatatagcaatattaatggcgcggctataacaagtgat
gccaaaaatatatatgtatcagcaccatcaaacattaccagtacaactggcttaacaaga
tttgaaaaaaattcagatggaagatatgtcagagtccagcaattaaacaacgtttccact
ggtggcgtattaattgtcgctaatggaaaatacatgcttgcgataacggcgacagctacc
aataatgcacgcctttatgaacgtaatagtgaaggtctatttgtagattataccgaattt
accatatccggtacaataagtagttcattctttcataaaattgacgaaaataatattgtt
ttcattacaagcacatctggtggtggatattttcattaccacatttcaaacgaaggtgtt
gttactcagaaacaaactattgacagaattaatgcgacatcattctattatgtaggacaa
tcttataatagtcagtacatatatttttctgatacatcaacaaatcttagaatatttgaa
aaacaagtttctggagattatacactaaaaacatcgcaggccggtgttaacgccaatata
ttccgtctgtggtcaagcccaacaaacccatccgcaggtattatgaaactatcaacttca
atgacgtatgttgatataaatgcagatggaactataaattttggggcaactattcagaca
aatacaacagccgcttgctggtataatgatggtagtggtttcttcattacaggaacaaac
gctactaataatggtataacgtctacttatttgtttgataattcatcaaaaaaatggttt
aaaaacccggaggttatatatccaaccggttcaatatctggcacattagtaaatgttaat
agtgggctagatatcaccaatcctgcaaaagacgtggttgtttatatacaagctcaacca
acatccatatcaacatcaaccataacggctggcgctcgtgcaataggtatccaatacgtt
gaatcagaaaaagtagttacaggatcgattaatgtagttctaagtagcatcgagaccgaa
ggtgaactagtcactgatctagctatagactccgacacattaataaacccaataacaaca
acaggtgaaatagatacacctattgcagctacgttagatataacgttaaatccatttata
atttctggtttcttcggtgaaaaatcagaatatgacatcgatctaacattgactactgca
ttttctatagtaagacccgataattggagtgagttaacaacaaccccattagaacaaccc
tatgcatacggtgacgttaagcttcgtcctatatctaatgatggattgctatcactatta
ccagatgtatcaggggatgtgttgattaattcaattacatcaaccggtattcttggcgaa
gaaagatcaatctcaggcgatacagtaataccgtctgttataacggatggcatgatttta
agcacgcctttccttgttggcgatgtaacattaccaacaatcgaaacgtcaggaacatta
agcgacggtgaagaaggttcaatagaaatcatattgaatcgtattagtaccgagggtgta
ttagaacaacagcaaaacgctactattgatgtaacgctgaatagtattacaactgaagga
ttgattgaaacagaatttgcaatcaatggtgatgtaacaatcaatagcataactactgaa
ttaaatggttatattattggtaacaccctaacaggggacgttttaattagttctatcgaa
accacagggtctatttcgtattccctcgaggcaaacatagacataacattgaataatatt
actacagaaggtgaattgcgcgtttctggaaatattttaccgtctgatgtattgatacca
agtatccaaactgaaggtcagcttgctcagacacaagaaattgacggcccgattgttatt
aataatattacaacggaaggcttcttagaaacacgacttgaaatcaccggaaatgttctt
attaatagcatttcatcaaatggcgaattgaaaaaattatctgcaagaagaagatttatg
aatattgtataa
DBGET
integrated database retrieval system