Viruses: 40091341
Help
Entry
40091341 CDS
T40000
Symbol
FDI68_gp131
Name
(RefSeq) Shigella phage Sf22; DNA topoisomerase II large subunit
KO
K26040
Straboviridae DNA topoisomerase large subunit [EC:
5.6.2.2
]
Virus
2024320
Shigella phage Sf22
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
DNA_gyraseB
HATPase_c
TOPRIM_C
Toprim
DNA_gyraseB_C
HATPase_c_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
40091341
NCBI-ProteinID:
YP_009614926
RS:
NC_042039
LinkDB
All DBs
Position
NC_042039:complement(114756..116573)
Genome browser
AA seq
605 aa
AA seq
DB search
MIKNEIKILSDIEHIKKRSGMYIGSSANEMHERFLFGKWESVQYVPGLVKLIDEIIDNSV
DEGIRTKFKFANKINVTIKNNQVTVEDNGRGIPQAMVKTPTGEEIPGPVAAWTIPKAGGN
FGDDKERVTGGMNGVGSSLTNIFSVMFVGETGDGQNNIVVRCSNGMENKSWETIPGKWKG
TRVTFIPDFMSFETNELSQVYLDITLDRLQTLAVVYPDIQFTFNGKKVQGNFKKYARQYD
EHAIVQEQENCSIAVGRSPDGFRQLTYVNNIHTKNGGHHIDCVMDDICEDLIPQIKRKFK
IDVTKARVKECLTIVMFVRDMKNMRFDSQTKERLTSPFGEIRSHIQLDAKKISRAILNNE
AILMPIIEAALARKLAAEKAAETKAAKKASKAKVHKHIKANLCGKDADTTLFLTEGDSAI
GYLIDVRDKELHGGYPLRGKVLNSWGMSYADMLKNKELFDICAITGLVLGEKAENLNYHN
IAIMTDADHDGLGSIYPSLLGFFSNWPELFEQGRIRFVKTPVIIAQVGKKQEWFYTVAEY
ESAKDALPKHSIRYIKGLGSLEKSEYREMIQNPVYDVVKLPENWKELFEMLMGDNADLRK
EWMSQ
NT seq
1818 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattaagaatgaaattaaaattctgagcgatattgaacatatcaaaaagcgtagcggc
atgtatattggctcttctgctaatgaaatgcatgagcgctttctgtttggtaaatgggaa
agtgttcagtatgtacctggtcttgttaagcttattgatgaaattatcgataactcagta
gatgaaggtattcgtactaagtttaaattcgcaaataaaattaatgttactatcaaaaac
aatcaagtaacagttgaagataacggtcgtggtattccacaagcgatggttaaaacacct
accggtgaagaaattcctggtccagttgctgcttggactattccaaaagcgggtggtaac
tttggtgatgataaagaacgtgtcaccggtggtatgaatggtgttggttctagtttaact
aacattttttctgtgatgtttgtcggtgaaactggcgatggtcaaaataatattgtagtt
cgttgttcaaatggcatggaaaataaatcctgggaaactattcctggaaaatggaaagga
actcgtgttactttcattccagattttatgtcatttgaaactaatgagctgtcccaagtt
tatcttgacattacactggatcgtctccagacacttgcagtagtttatcctgatattcaa
tttacctttaatggtaaaaaggttcagggcaattttaagaaatatgcacgacagtatgat
gaacatgctattgttcaagaacaagaaaattgttctattgcggttggtcgttcaccggat
ggatttcgccaattaacttatgtgaataacattcacactaagaatggtggccatcacatt
gactgtgttatggatgatatttgtgaagaccttattccacaaatcaaacgtaagttcaaa
attgatgtaactaaagcacgtgtcaaagaatgtttgactatcgttatgtttgtccgtgat
atgaaaaacatgcgatttgattctcaaactaaagagcgtttgacttctccatttggcgaa
attcgtagtcatattcagcttgatgctaaaaagatttcacgcgctattctaaataatgaa
gcaattttaatgccgattattgaagctgccttggcccgtaaattggcagcagaaaaagca
gctgaaactaaagcagctaaaaaggcttctaaagctaaagttcataaacatatcaaagcg
aatctttgcggtaaagatgctgatactactcttttcttgactgagggtgattcggctatc
ggatatcttattgatgttcgtgataaagaacttcacggtggttatccattgcgtggtaaa
gttctcaacagttggggtatgtcttatgcagatatgcttaaaaacaaagaattatttgat
atttgcgcaatcactggtctagttctcggtgaaaaagctgaaaacttgaattatcataat
attgctattatgactgatgctgaccatgatggtttaggaagcatttatccttctctgctc
ggattttttagtaattggccagaattgtttgagcaaggacgaattcgctttgtcaaaact
cctgtaatcatcgctcaggtcggtaaaaaacaagaatggttttatacagtcgctgaatat
gagagtgccaaagatgctctacctaaacatagcatccgttatattaagggacttggctct
ttggaaaaatctgaatatcgtgagatgattcaaaatccagtatatgatgttgttaaactt
cctgagaattggaaagagctttttgaaatgctcatgggagataatgctgaccttcgtaaa
gaatggatgagccagtag
DBGET
integrated database retrieval system