Viruses: 40095572
Help
Entry
40095572 CDS
T40000
Symbol
FDJ02_gp243
Name
(RefSeq) Shigella phage Sf21; tail collar fiber protein
KO
K26782
Straboviridae short tail fiber protein Gp12
Virus
2024308
Shigella phage Sf21
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
gp12-short_mid
S_tail_recep_bd
Collar
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
40095572
NCBI-ProteinID:
YP_009618969
RS:
NC_042077
LinkDB
All DBs
Position
NC_042077:87287..88837
Genome browser
AA seq
516 aa
AA seq
DB search
MSNNTYQHVSNESKYVKFDPTGSNFPGTVTTVQSALSKISNIGVNGIPDATMEVKGIAMI
ASEQEVLDGTNNSKIVTPATLATRLLYPNATETKYGLTRYSTNEETLKGSDNNSSITPQK
LKYHTDDVFKNRYSSESSNGVIKISSTPAALAGVDDTTAMTPLKTQKLAIKLISQIAPSE
DTATESVRGVVQLSTVAQIRQGTLREGYAISPYTFMNSVATHEYKGVIRLGTQTEINNNL
GGVAVTGETLNGRGATGSMRGVVKLTTQAGIAPEGDSSGALAWNADVINTRGGQTINGSL
NLDHLTANGIWSRGGMWKNGDQPVATERYASERVPVGTIMMFAGDSAPPGWIMCHGGTVS
GDQFPDYRNVVGTRFGGDWNNPGVPDMRGLFVRGAGTGGHILNQRGQDGYGKDRLGVGCD
GMHVGGVQAQQMSYHKHAGGWGEYNRSEGPFGASVYQGYLGTRKYSDWDNASYFTNDGFE
LGGPRDAHGTLNREGLIGYETRPWNISLNYIIKVHY
NT seq
1551 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaacaatacatatcagcacgtatcaaatgaatcaaaatatgttaaattcgatcct
actggatcgaattttcctggcactgttacgacagtacagtctgcattatcaaaaataagt
aatatcggcgtaaatggtattcctgatgcaactatggaagttaaaggaatagcaatgatt
gcgtcagaacaagaggttttagatggaactaataactctaaaatcgttacaccagctaca
ttagcaacaagattattgtatccaaatgctactgaaactaaatatggtttaacgcgttat
tcaacaaatgaagaaacattaaaaggctcagataataattcatcaataacaccacaaaaa
ctgaaataccacactgacgatgtgttcaaaaatagatattcgtctgagtcatcaaacggg
gttattaaaatatcatctacacctgcagctttggctggagttgatgatactactgcgatg
actccgctaaaaacccaaaaacttgcaataaaattaatttcgcaaatagctccttcagaa
gacactgcaacagaatcggtgagaggagtagttcaattatctactgttgcacaaattcgt
caaggaactctccgcgaaggatatgcaatttccccgtatacctttatgaattctgttgca
acacatgaatataagggtgttatacgcctaggaacgcagactgaaattaataataatttg
ggtggtgttgcagtaacaggtgaaacactaaatggtcgaggagctaccggttctatgcgt
ggagtagttaaattaacgacgcaagccggtattgcccctgaaggtgatagctctggagca
ttagcatggaacgcagatgtaattaatactcgtggtggacaaactattaatggttcttta
aatttagaccatcttacagcaaatggaatttggtcacgcggtggaatgtggaaaaatggc
gatcaacctgttgccactgaaagatatgcgtccgaacgagttccggttggaactattatg
atgtttgcgggtgattcagcacctccaggttggattatgtgtcatggtggaaccgtgtca
ggtgaccaatttcctgattatagaaacgtagttggaacaagatttggtggcgattggaat
aatcctggcgttcctgatatgcggggtcttttcgtcagaggagccggcacaggcggtcat
attttaaatcaacgtggacaagatggctatggaaaggatagactgggcgtaggatgtgac
ggaatgcatgttggtggtgttcaggcacaacaaatgtcataccataaacatgctggtggt
tggggtgaatataacagaagtgaaggcccatttggcgcgtcagtttatcaaggatatctt
ggaactagaaaatattccgactgggataatgcttcatacttcactaatgatggatttgaa
ttaggtggaccgagagatgctcatggtacacttaatcgtgaaggattaattggttatgaa
actagaccatggaatatatcattaaactatattattaaagttcattactaa
DBGET
integrated database retrieval system