Viruses: 40095820
Help
Entry
40095820 CDS
T40000
Symbol
FDJ03_gp125
Name
(RefSeq) Shigella phage Sf24; RIIA lysis inhibitor
Virus
2024309
Shigella phage Sf24
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
HATPase_c_3
HATPase_c
HATPase_c_2
DUF6174
PUD1_2
FAM25
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
40095820
NCBI-ProteinID:
YP_009619205
RS:
NC_042078
LinkDB
All DBs
Position
NC_042078:complement(93711..95888)
Genome browser
AA seq
725 aa
AA seq
DB search
MIITTEKETILGNGSKSKAFSITASPKVFKILSSDLYTNKIRAVVRELITNMIDAHALNG
NPEKFIIQVPGRLDPRFVCRDFGPGMSDFDIQGDDNSPGLYNSYFSSSKAESNDFIGGFG
LGSKSPFSYTDTFSITSYHKGEIRGYVAYMDGDGPQIKPTFVKEMGPDDKTGIEIVVPVE
EKDFRNFAYEVSYIMRPFKDLAIINGLDREIDYFPDFDDYYGVNPERYWPDRGGLYAIYG
GIVYPIDGVIRDRNWLSIRNEVNYIKFPMGSLDIAPSREALSLDDRTRKNIIERVKELSE
KAFNEDVKRFKESTSPRHTYRELMKMGYSARDYMISNSVKFTTKNLSYKKMQSMFEPDSK
LCNAGVVYEVNLDPRLKRIKQSHETSAVASSYRLFGINTTKINIVIDNIKNRVNIVRGLA
HALDDSEFNNTLNIHHNERLLFINPEVESQIDLLPDIMAMFESDEVNIHYLSEIEALVKS
YIPKVVKSKAPRPKAATAFKFEIKDGRWEKEELFTLTSEADEITGYVAYMHRSDIFSMDG
TTSLCHPSMNILIRMANLIGINEFYVIRPLLQKKVKELGQCQCIFEALRDLYVDAFDDVD
YDKYVGYSSSAKRYIDKIIKYPELDFMMKYFSVDEVSEEYTRLANMVSSLQGVYFNGGKD
TIGHDIWTVTNLFDVLSNNASKNSDKMVAEFTKKFRIVSDFIGYRSSLSDDEVSQIAKTM
KALAA
NT seq
2178 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattatcaccactgaaaaagaaacaattcttggtaatggttctaaatcaaaagcattt
agcatcacagcatctcctaaagtatttaaaatcttatcatctgatttgtatacaaataag
attcgcgcagttgttcgtgaattgattaccaacatgattgatgcccatgctctcaatgga
aatcctgaaaaatttatcattcaagttcctggacgtttagatccacgatttgtttgccga
gattttggtccgggtatgagtgattttgatattcagggtgatgataattctcctggtttg
tataattcatacttcagttcatctaaggctgaatctaacgatttcattggcggatttggt
ttaggttctaaatctccgtttagttatactgatacatttagtattacttcgtatcataaa
ggtgaaattcgtggttatgtagcttacatggatggtgatggtccacagattaaacctaca
ttcgtaaaagaaatgggtccagatgataaaactggtattgaaatcgtagttccagttgaa
gaaaaagactttagaaactttgcttatgaagtttcttatatcatgcgacctttcaaagat
ttagctatcattaatggtcttgaccgcgaaattgattattttccggattttgatgactat
tacggtgtaaatccagaaagatactggcctgatcgtggtggattatatgctatctatggc
ggtattgtttatcctatcgatggtgttattagagaccgtaactggctaagcattcgcaat
gaagtaaattacattaagtttccaatgggttcacttgatattgctccatcacgtgaagct
ctttcattggatgatcgtactcgtaaaaatattattgaacgagttaaagagcttagtgag
aaagcatttaatgaagatgtaaaacgatttaaagaatctacatctcctcgccatacgtat
cgcgagttaatgaaaatgggctattctgctcgagattatatgattagtaattcagtcaaa
ttcacgactaaaaatctgtcatataagaagatgcagagcatgtttgaacctgacagtaag
ttatgtaatgcaggcgtggtgtatgaagtaaatcttgaccctcgactgaaacgcattaag
caaagtcatgaaacttcagccgttgcatcaagttatcgtctgtttggtattaatacaaca
aaaattaatatcgttattgataatattaaaaatcgtgttaatattgtccgtggattagca
catgcgctagatgatagtgaatttaataacactttgaatattcatcacaatgagcgtctt
ctgtttattaatccggaagtagaatcgcagattgatttactacctgatattatggcaatg
tttgaaagtgatgaagttaacattcactatttgtcagaaattgaagctttggttaaaagt
tatattccaaaggtagttaaaagtaaagctcctcgtcctaaagctgctacagcatttaag
tttgaaattaaagacggacgctgggaaaaagaggaactatttacgctcacatcagaagca
gatgaaattactggttatgtagcgtatatgcatcgttctgatattttctctatggatggt
actacatcgctttgtcatccatctatgaatattttgattcgtatggctaatcttattggc
attaatgaattttatgttattcgtccgcttttacagaaaaaggtaaaagaactcggtcag
tgccaatgtatttttgaagctttgcgtgatttatatgtagatgcttttgatgatgtagat
tatgataagtacgtaggttattcaagttcagctaaacgatatattgataaaattatcaag
tatcctgagctagattttatgatgaagtacttcagtgtagatgaagtttctgaagaatat
acacgactcgctaatatggttagttcattacagggtgtatatttcaacggtggaaaagat
accatcggtcatgacatctggacagtaactaatctttttgatgtattatcaaataatgct
tcaaaaaacagtgataaaatggttgctgagtttaccaagaaattccgtattgtttccgac
ttcatcggatatcgcagctctttaagtgatgatgaagtttcccaaatcgctaaaactatg
aaggcccttgcggcctaa
DBGET
integrated database retrieval system