Viruses: 40102271
Help
Entry
40102271 CDS
T40000
Symbol
FDJ55_gp253
Name
(RefSeq) Escherichia phage slur04; baseplate wedge subunit
KO
K26783
Straboviridae baseplate wedge protein Gp6
Virus
1720497
Escherichia phage slur04
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
gp6_C-domII
Gp6-like_1st
Gp6_C-III
Gp6_C-I
Gp6_2nd
GD_N
Phage_Gene47
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
40102271
NCBI-ProteinID:
YP_009625370
RS:
NC_042130
UniProt:
A0A0M7QDK8
LinkDB
All DBs
Position
NC_042130:63098..65080
Genome browser
AA seq
660 aa
AA seq
DB search
MANTPVNYQLTRTANAIPEIFVGGTFAEIKQNLIEWLNGQNEFLDYDFEGSRLNVLCDLL
AYNTLYIQQFGNAAVYESFMRTANLRSSVVQAAQDNGYLPTSKSAAQTEIMLTCTDALNR
NYITIPRGTRFLAYAKDTSVNPYNFVSTEDVIAIRDKNNQYFPRLKLAQGRIVRTEIIYD
KLTPIIIYDKNIDRNQVKLYVDGAEWINWTRKSMVHAGSTSTIYYMRETIDGNTEFYFGE
GEISVNASEGALTANYIGGLKPTQNSTIVIEYISTNGADANGAVGFSYADTLTNITVINI
NENPNDDPDFVGADGGGDPEDIERIRELGTIKRETQQRCVTATDYDTFVSERFGSIIQAV
QTFTDSTKPGYAFIAAKPKSGLYLTTVQREDIKNYLKDYNLAPITPSIISPNYLFIKTNL
KVTYALNKLQESEQWLEGQIIDKIDRYYTEDVEIFNSSFAKSKMLTYVDDADHSVIGSSA
TIQMVREVQNFYKTPEAGIKYNNQIKDRSMESNTFSFNSGQKVVNPDTGLEEDVLYDVRI
VSTDRDSKGIGKVIIGPFASGDVTENENIQPYTGNDFNKLANSDGRDKYYVIGEINYPAD
MIYWNIAKINLTSEKFEVQTIELYSDPTDDVIFTRDGSLIVFENDLRPQYLTIDLEPISQ
NT seq
1983 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaaatacccctgtaaattatcaattaacaagaacagcaaatgctattcccgagata
ttcgtcgggggtacgtttgctgaaataaaacaaaacctcattgaatggcttaatggccaa
aatgaatttttggattatgattttgaaggctcaagattaaacgttctgtgtgaccttttg
gcttataatacgctgtacattcaacagtttggtaatgctgctgtgtatgaaagctttatg
cgtactgctaacttacgaagttcagttgttcaagctgcacaagataacggatatttacct
acttcaaaatccgctgcgcagaccgaaattatgttaacatgcaccgacgcattgaatagg
aattacattactattcctcgcggaactcgctttttagcatatgcaaaagatacttctgtt
aatccatataacttcgtttctaccgaagacgttattgccattcgtgataaaaataaccaa
tattttccgcgtttaaaattggcccagggacgtatagtaagaactgaaatcatttatgat
aaattaacacctattatcatttatgataaaaatattgatagaaaccaggttaaattatat
gttgatggagcggaatggattaactggacgagaaagtcaatggttcatgctggttcaaca
tcaacgatttactatatgcgtgaaactattgatggaaacactgaattctattttggcgaa
ggtgaaatttctgttaatgcttctgaaggagctttgaccgctaattatatcggaggtctt
aaacctacccagaactctacgattgttattgagtacatcagtactaacggtgcagatgcg
aatggcgcagtcggattttcatatgcagatacattaacaaatataactgtcatcaatatt
aatgaaaatccaaacgacgacccagattttgtcggagcagatggcggcggtgatccagaa
gatattgagcgtattcgcgaattgggtactattaaacgcgaaactcagcaacgatgcgta
actgcgactgactacgatacattcgtttcagagagatttggttctattattcaagctgtt
cagactttcactgattctactaaacctgggtatgcatttattgctgctaaacctaaatca
ggattgtatttaactactgtgcaacgtgaagatattaaaaattatctcaaagactataat
ttagctcctattacgccatcaattatttctcctaattatctttttattaagactaattta
aaagtcacatatgctttaaataaactacaagaatccgagcagtggcttgaaggtcaaata
attgataaaattgatcgttattataccgaagatgtagaaatttttaactcgtctttcgct
aaatctaagatgttaacttatgtagatgatgcagatcattctgtcattggttcatcagcg
actattcaaatggttcgtgaagtacaaaacttctataaaacacctgaagcaggtattaaa
tacaataatcaaataaaagatcgttctatggaatctaatacgttttcatttaattctgga
caaaaggttgtaaatcctgatactggtttagaagaagatgtattatatgacgttcgtata
gtatcaacagaccgagattctaaaggaattggtaaagttattattggtccatttgcttct
ggcgatgttacagaaaatgaaaacattcagccatatacaggcaatgattttaataaatta
gcaaattctgatggacgcgacaaatactatgttatcggtgaaataaattatccggctgac
atgatttattggaatatcgctaaaattaatttaacatctgaaaaatttgaagttcagact
attgaattatattctgacccaaccgatgatgttatctttactcgcgatggttcactgatt
gtatttgaaaatgacttacgtccacaatacttaactatcgatttggagcctatatcacaa
tga
DBGET
integrated database retrieval system
