Viruses: 40524275
Help
Entry
40524275 CDS
T40000
Symbol
42, FK780_gp042
Name
(RefSeq) Bacillus phage PBS1; RNA polymerase beta subunit
Virus
2884423
Bacillus phage PBS1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
RNA_pol_Rpb1_5
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
40524275
NCBI-ProteinID:
YP_009664244
RS:
NC_043027
LinkDB
All DBs
Position
NC_043027:37999..39894
Genome browser
AA seq
631 aa
AA seq
DB search
MEKTYNLNDILLSNEYEKIKEDIKEEIINDMASKKVKYSNTSEFAKNDFLKDEFIDLVVD
GETYEITYGNLITLLIVARPFNHFKVPMTEDLLFDLSDLKEYQNYYTTLLEHFSYSNEIK
SIIKDVISELAIFSGDINVTFGNTVSIKSLIDLGNKVKRFRELLHYRLPNDEALEFNDIE
AIIKKNLDEIMKILSETDNMLRYYIDSGAGINSKQFGQVLSLVGSKPDLFGKIIPYPINT
SFLRGLDVRSFYINALGARKALITNYQQVRNSGYLTRKISMLLMDTKLIDLDDCGSHENN
YLSINVENKDVLKRFSKRSYLNNNGELVEIDINDESLIGQVIKIPSPTTCASNEGVCRKC
YGKLFDINKDLNIGMIAVLLLTDPLTQRLLSAKHLLETRSSKIDWGTNFEENFIVNRNLI
YPKVYNGTVIIKEDDFKEDEETEEQVFDTFTLKSGNRFISISSPMRLFLNKDLKKQLDES
FYNIEEMQFEIPLNKLDEGDSFATFIMDNNELSKPLREIKDLIETNKYIKDHNVNEVVNY
FIYLLNESGINIQSVHSELIIREMMKLDDSDRTQFKNDKMPDYEIFRITDANLKGDSLSR
SLLFEQVKKQLTTLDYDTFNKTKSSILDKLL
NT seq
1896 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggaaaagacttataatttaaatgatattctattatcaaatgagtatgaaaaaattaaa
gaggatatcaaagaagaaataattaatgatatggcatctaagaaagtaaagtatagtaat
acttctgaatttgctaaaaatgactttcttaaagatgaattcattgatttagttgttgat
ggggaaacatatgaaattacatatggaaatctaatcacattattaattgttgcaagacca
tttaatcactttaaagtaccaatgactgaagatttattatttgatctatctgatttaaaa
gaataccaaaattattatactacattgctagaacattttagttacagtaatgaaattaaa
tctattattaaagatgttattagtgagttagcaattttctctggggatattaacgtaaca
tttggtaatacagtttctattaaatcacttattgatttgggaaataaagtaaagagattt
agagaactattacattatcgtttaccaaatgatgaggcattagagtttaatgatattgag
gctattattaaaaagaatttagatgaaattatgaaaattctttctgaaactgataatatg
ctaagatattacattgattcaggtgctggtattaactcaaaacaatttggtcaagtatta
tcattagtaggttctaaaccggatttatttggtaaaattattccttatccaattaatact
agtttcctaagaggattagatgtacggtctttctatattaatgctttaggggcaagaaaa
gctttaatcacaaactatcaacaagtaagaaactctggctatctaacaagaaaaattagt
atgttattgatggatacaaaattaattgatttagatgattgtggaagccatgaaaacaac
tatctttcaattaatgttgagaataaagatgttctaaaaagattctctaaaagaagttat
ttaaataataatggtgaattagttgaaattgatattaatgatgaaagtctaattggacag
gtaataaaaattccttctccaactacttgtgcatctaatgaaggcgtttgtcgtaaatgt
tatggtaaattgtttgatatcaataaagatttaaatattggcatgattgcagttctacta
ttaacagatccattaactcagcgtttattaagtgcaaaacacttactagagactcggtct
tctaagatcgattggggaactaattttgaagagaactttatcgtaaacagaaacttaatt
tatcctaaagtttataatggaacggttattattaaagaagatgattttaaagaagatgag
gaaacagaagaacaagtatttgatacatttactttaaaaagtggtaatagatttatttct
attagttcaccaatgagattattcctaaataaagaccttaagaaacaacttgatgaaagc
ttttataatatagaagaaatgcaatttgaaattccattaaataagcttgatgaaggcgat
agttttgcaacattcatcatggataataacgaattatcaaaaccattaagggaaattaaa
gatcttattgaaactaataaatatattaaagatcataatgttaatgaagtggtaaactat
tttatttacctcttaaatgaatcaggtatcaatattcagtctgttcattcagagttaatc
attagagaaatgatgaaactagatgattcagatagaacacaatttaaaaatgataaaatg
ccggattatgaaatcttccgtattacagatgctaatttaaagggagatagtctatcaaga
tcattattatttgagcaagttaagaaacagctaactacactagattatgatacatttaat
aaaacaaaatcttcaattttagataaactactttaa
DBGET
integrated database retrieval system
