Viruses: 40524445
Help
Entry
40524445 CDS
T40000
Symbol
212, FK780_gp235
Name
(RefSeq) Bacillus phage PBS1; DNA binding protein
Virus
2884423
Bacillus phage PBS1
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
HTH_32
HTH_24
MarR
HTH_11
Sigma70_r4
HTH_3
HTH_23
HTH_31
HTH_37
HTH_17
HTH_28
HTH_19
Tau95
HTH_Tnp_IS630
DUF1697
HTH_6
DUF6563
DUF7188
DUF5997
ISN1
CSN4_RPN5_eIF3a
Cro
WGG
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
40524445
NCBI-ProteinID:
YP_009664413
RS:
NC_043027
LinkDB
All DBs
Position
NC_043027:181478..182272
Genome browser
AA seq
264 aa
AA seq
DB search
MGKKINKEILEKIIKENPDWSQKQIADHLNLSISYIGQLIKKYNIDYTIKKKNKKIIISK
EKLIEIINEHPDWTQKQIADHLGVVESYIGRLIKKYDIIYVKKGNQSRNKFMEKNLISQY
FMNEEIMADLLFSVIKNNNKLNQKEIADLLVKRLINEYNLNYKLKTITKDDLLDVIKEHP
DWTQKQIADHFLALPNTINSILVRNNINQKEIREEYMVEKLRELIKEHPDWTQAQLAEPL
GITKTYIRNLIIKYKLEYNKKKLK
NT seq
795 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtaaaaagattaataaagaaatattagaaaaaataattaaagaaaatcctgattgg
tcgcaaaaacaaatagctgatcatttaaatttatctatatcttatattggacaattaata
aaaaaatataatattgattatactataaaaaagaagaataaaaaaataattatttcaaaa
gaaaaattaattgaaattattaatgaacaccctgattggacacaaaaacaaatagctgat
catttaggagttgtagaatcctatatcggtaggttaataaaaaagtatgatataatatat
gttaaaaaaggaaatcaaagcaggaataaatttatggaaaaaaatttaatttcacaatat
tttatgaatgaagaaattatggcagatttattattttcagtaattaagaataataataaa
ttaaatcaaaaagaaatagctgatctattagtaaaaagattaattaatgaatataatcta
aattataaattaaaaactataactaaagatgatttattggatgtaattaaagaacatcct
gactggacacaaaaacaaatagctgatcatttcctagctcttccaaatacaattaattct
atactagtaagaaataacatcaatcaaaaagaaattagagaagaatatatggttgaaaaa
ttaagagaattaattaaagagcatcctgactggactcaagctcaattagctgaaccatta
ggaattacaaaaacatatataaggaatttaattattaaatataaattagaatataataag
aagaaattaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
