Viruses: 41324373
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Entry
41324373 CDS
T40000
Symbol
FLA95_sLgp1
Name
(RefSeq) Jatobal virus; RNA polymerase
KO
K25345
Peribunyaviridae RNA-directed RNA polymerase L [EC:
2.7.7.48
3.1.-.-]
Virus
150058
Jatobal virus
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Bunya_RdRp
L_thumb_ring_vir
L_protein_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
41324373
NCBI-ProteinID:
YP_009666904
RS:
NC_043578
UniProt:
M1F368
LinkDB
All DBs
Position
NC_043578:43..6801
Genome browser
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2252 aa
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DB search
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DBGET
integrated database retrieval system