KEGG   Viruses: 41324373
Entry
41324373          CDS       T40000                                 
Symbol
FLA95_sLgp1
Name
(RefSeq) Jatobal virus; RNA polymerase
  KO
K25345  Peribunyaviridae RNA-directed RNA polymerase L [EC:2.7.7.48 3.1.-.-]
Virus
150058  Jatobal virus
SSDB
Motif
Pfam: Bunya_RdRp L_thumb_ring_vir L_protein_N
Other DBs
NCBI-GeneID: 41324373
NCBI-ProteinID: YP_009666904
RS: NC_043578
UniProt: M1F368
LinkDB
Position
NC_043578:43..6801
AA seq 2252 aa
MSQLLLNQYRNRILHCREPEIAKDIWRDLLNDRHNYFSVEFCRAANLEHRNDVPAEDICA
EVVDMSKARKVRFCTPDNYLLHDGKMFIIDFKVSIDERSSRLTRDKYNEIFGEIFNPEGI
DYEVVIIRLDPSNMTIHIDSREFTDIIGPLTLNIDLQWFFDMKDFLFGKFRDDDKFHAII
NQGEFTMTLPWIEEDTPELLTHPVYLEFMHSMPLEEQQLFNNSLNFKSFGAEKWNIFLKE
VLSNYEDYYKKFIKDNAKSIFLTTGNYPKPDKQQISAGWNEMVARVGTERELVDDINQEK
PSLHMIWSQNDSTSNNNIQKLIKLSKLLQSISGSGTYINAFRSLGKLMDISADTRKYEAF
CNQLKSLARSSVKKLDRKIDPIQIGTSTVLWEQQFKLDTEVIKREDRIHLLKDFFGIGKH
KSFNKKLNSDINLEKPKILNFNNEDLIRKCKNKYNQAVYNLSQPNQLDKIGNYLEHFSAK
INNCSVDMWDFIYNTTKTRYWQCINDYSMLMKNMLAVSQYNRHNTFRIVSCANNNLFGLV
MPSSDIKTKKATLVYAIIAIHNDEKEVVELGSLYSTFKTNTGYLSISKAFRLDKERCQRI
VSSPGLFLMTSCLLFNGNKSLELNELLGFSFFTSVSITKAMLSLTEPSRYMIMNSLAVSS
HVKEYISEKFSPYTKTCFSVIMTDLIKKGCYSAYEQRKKVQIRDIKLTDYDITQKGVDSK
RDLKSIWFPGKVSLKEYLNQIYLPFYFNSKGLHEKHHVLIDLAKTILEIERDQRESLPEP
WSEIPKKQTVNLKILIYSIAKNLNLDTSRHNFVRSRVENANNFNRSITTISTFTSSKSCI
KIGDFEDLKKKKVKSDTKKLSKEIKKVSIANPLFLDEITNENEIKHSTYEDLKQSVPEYT
DYMSVKVFDRLYEKIKNKEMEDSETVKLILETMKTHKTFYFGFFNKGQKTAKDREIFLGE
FEAKMCLYLVERIAKERCKLNPEEMISEPGDSKLRVLEKQSEEEIRYISNSVKTFKNTVE
NLKSGKLNWSEIDENKTRGLKIEINADMSKWSAQDVLFKYFWLISLDPILYPAERKRILY
FLCNYMQKKLILPDELLTTILDQRVPHSNDIIGMMTNNYRTNTVEIKRNWLQGNLNYTSS
YLHSCSMSVYRDIIKEGAMLLEGEALVNSMVHSDDNQTSICMIQNKLSDDSVIEFCINVF
EKICLTFGNQANMKKTYLTNFIKEFVSLFNIHGEPFSIYGRFLLTAVGDCAYLGPYEDLA
SRLSATQTAVKHGCPPSLAWLSIALNHWITHTTYNMLPGQTNDPLPFFPTNNRNEIPVEM
CGLLESDLSTIALTGLESGNVTFLTNMARKLAPPILQRESIQDQYNSIETWDLEKLSPID
ILKFKMLRYIALDSSVTSDDGMGETSEMRSRSLLTPRKFTTSGSLNRLVSYKDYQEIISD
NQRMDELFETFIRYPELLVTKGENFEEFTKTILFRYNSKKFKESLSIQNPAQLFIEQILF
SNKPVIDYTSIHDKMFGLQDIPGIEELDTIIGRKTFVESYVQIVDDLSNLKLDLDDIKTV
YAFCLMNDPLLVTAANNIIMSVKGHGQERIGQSACKMPEVRSLKLIHYSPAIVLRAYVRG
INSIPNIDVDELSRDLSHLEEFIKSTNLREHMRDRIDKNEKKQLSRDLKFEIKELTRFYQ
VCYDYVKSTEHKIKVFILPYKVFTSIEFCGALTGNLISDKVWYITHYLKNIVSSTHKAQI
SASPELEVQIADEALRLIAHFADTFLSADSRVNFLKTVVEQFNYKGIPVKHLYAKIKNSK
LRTKFLGILLWLDDLTQSDLDKFDADKSDEKIIWNNWQVSRDMNTGPIDLIISGYSRQLR
ITGEDDRLIAAELQVTRLSEDLIHRHGQAMLNKPHGLKLEKMQSIQEMSRQLYYIVYQQR
SRKRYFYSILPTQIIEDHNSRVESSRLTKNSKWVPVCPVAISKLYQQGRPILSKVKKLNM
QTYTLSRIQVNIEEYAITRRAHFQKMPFFEGPPIPSGGIDLSELMKSTSLLSLNYDNIRN
ASLLDMSRVFKCNGSQNDQMAFEFLSDEVLEQDIIEEIECNPIFSISYTKKGDPNMTYKN
AFHKALIAECDKFETAFDFLDMGFCSNENLSILEEIHWIISYLKTNQWSTELDNCIHMCM
YRNGYDAEFHNFDIPSKFLKDPITRSINWPEVIEFILLIEEFETAIEPWASIKSHFCSKA
HSVALESMRHERRSLAEFVDTNKKTGKSKFDF
NT seq 6759 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtctcagttactattaaatcagtatcgaaaccgtatccttcactgccgagaacctgaa
attgcaaaggacatatggcgagatttattgaatgatcgccataattatttctcagtagag
ttctgtagggcagcaaatctggagcatagaaatgatgtgccagcagaagatatttgtgca
gaagttgtggacatgtctaaggcccgtaaagtgaggttctgtacccctgataattatttg
ctccatgatggtaaaatgtttataatagatttcaaagtttcaattgatgaaagatcatct
agattgacaagagacaagtataatgaaatatttggggaaatcttcaatcccgaaggtatt
gactatgaagttgtgattattagacttgatccgtccaacatgactatccacattgattct
agggaattcacagacattataggacccttaacgctgaatatagatctgcaatggtttttt
gatatgaaagatttcctatttgggaaatttagagatgatgataaattccatgcaataatc
aatcaaggagaatttaccatgactttaccttggattgaagaggatacaccagagctatta
acacaccctgtttatctagagtttatgcactcaatgcctttagaagaacaacaattgttc
aataattctttgaattttaagtcctttggagcagagaaatggaatatcttcctgaaggag
gttctaagcaattatgaagattactataagaaatttataaaggataatgcaaaatctata
ttcttaactacaggtaattatcccaagcctgataaacagcaaatatctgctgggtggaat
gaaatggtggcaagagttggtacagaacgagaattggtagatgatataaatcaagaaaag
cccagcctgcatatgatatggtcccaaaatgattcaacaagcaacaacaatattcagaaa
ctcatcaaattatcaaaattgctgcaatcgattagtggatcaggtacttatatcaatgca
tttagatctctaggaaaattaatggacatttcagcagatacaaggaaatatgaagctttt
tgcaatcagttaaaatcgcttgctagatctagtgtcaaaaagttagatagaaaaattgat
cccatacagattggtacttcaacagtgttgtgggagcagcagtttaaactggacactgaa
gtgataaaaagagaagacagaattcacttattaaaagatttcttcggaattggtaaacat
aaatctttcaataaaaaacttaattctgatataaatttagaaaaacccaaaattttaaat
ttcaataatgaagacttaatccggaagtgcaagaacaaatataatcaagcagtgtacaac
ctatcccaaccaaatcagttagataaaattgggaattacttagaacacttttctgctaaa
atcaataactgtagtgttgacatgtgggattttatatacaacacaaccaaaacaagatac
tggcaatgtataaatgattactcaatgcttatgaagaatatgcttgctgtatcccagtat
aacagacacaatacgtttagaatagtatcctgtgccaataataatctgtttggattagta
atgccaagttcggatatcaaaacaaaaaaagcaactttagtctatgcaattatagcaatt
cataatgatgagaaagaagttgttgaattgggatcattatattccacatttaaaactaac
actggatatctatccatatcaaaagcatttcggcttgacaaggaaaggtgtcaaagaata
gtatcatctcctggattattccttatgacaagttgcttattatttaatggaaacaagagt
ttagaattaaatgagttattaggattctcatttttcacgtcagtctccataacaaaagca
atgttatccctaactgaaccatctagatatatgataatgaattccttagcagtctctagt
catgtgaaagagtacatttctgagaaattttcaccttatacaaagacttgtttttctgtt
attatgacagacttgattaaaaaaggatgttattctgcatatgaacagaggaaaaaggtt
caaattcgcgacataaaactgactgattatgatataacacagaaaggagttgattctaaa
agagatttgaaatcaatctggtttccagggaaagtaagcctcaaagagtacttgaatcag
atatacttacctttttacttcaattccaagggcctgcacgaaaaacatcatgtcctgatt
gatctagctaaaacaatccttgagatagagagagaccaaagagaatctttacctgagcct
tggtcagagattccaaaaaaacaaactgtaaatctgaagattttaatttattctatagca
aaaaatcttaatttagatacatcaagacataactttgtaaggagcagagttgagaatgct
aataactttaatcgatccattactactatctcaacatttactagttcaaaatcctgtatc
aaaataggagattttgaagatctaaagaaaaagaaggtaaaatctgacacaaaaaagtta
tctaaagaaataaaaaaagtgtctattgctaatccattgtttctcgatgaaattacaaat
gaaaatgaaataaagcattctacatatgaagacttgaaacaatctgtcccagaatataca
gattatatgtctgtgaaagtgtttgataggctatatgaaaagattaaaaataaagagatg
gaagatagtgaaacagtaaagttaatattagagactatgaaaacacacaaaaccttttac
tttggattttttaacaaaggtcagaagactgctaaagatagagaaatattcctgggagag
tttgaggctaaaatgtgtctttacttagtggaaagaattgcaaaggagagatgcaaactc
aatccagaagaaatgattagtgaaccaggagattctaaattacgagtattagagaagcag
tcagaagaagaaattagatacattagtaatagtgtgaaaacatttaaaaatactgtggaa
aatttgaagtcaggtaaattgaactggtctgaaattgatgaaaataaaactagaggattg
aaaatagaaattaatgctgacatgtcaaaatggagtgcccaagatgtgctatttaaatat
ttttggctgataagtttggacccaatactctatcctgctgaacgcaaaagaatactctac
tttttatgtaattatatgcaaaaaaagctcattttaccagatgaactcttaactactata
ttagatcaaagagtgccacactcaaatgatattattgggatgatgacaaataattataga
acaaacacagtagagataaagcgtaattggttacagggcaatttgaattatacaagtagt
taccttcatagttgtagtatgtctgtctatagagatataattaaagaaggagcaatgctt
ttagaaggggaggccttggtgaattcaatggttcactctgatgacaatcaaacatctata
tgcatgatacaaaacaagctatctgatgattcagttatagagttctgtataaatgtgttt
gaaaagatatgcttaacatttggcaatcaagcaaatatgaagaaaacatatctaacaaat
tttattaaagagtttgtttctctatttaacatacatggtgaacctttttcaatttatggg
agatttttattaactgctgtcggtgactgtgcttatttaggtccttatgaagatttagct
agtcgactctccgctacacaaacagctgtgaaacatggttgccccccgtccttggcttgg
ctctctatagctctgaatcattggataacacatacaacctacaatatgttacctggtcaa
actaatgatcctttgccattcttcccaacaaacaacagaaatgaaataccagttgaaatg
tgcggtcttctagaaagcgatttgtctacaatagcactgacaggattggaatctggaaat
gtaacatttcttactaatatggctagaaaattggcaccccctattctacaaagagaaagc
attcaagatcaatacaattccatagaaacatgggatttagagaaactatctccgatagac
atattgaaattcaaaatgcttagatatatagcgttagacagctcagttacatctgatgat
ggaatgggagaaacaagcgaaatgcggtcgagatcattactaacacccaggaaattcact
acaagtggctccttaaatcggttagtatcttataaagactatcaagaaataatctcagat
aaccaacgtatggatgaattatttgaaacatttatcagatatcctgaactcctagtgact
aaaggtgaaaattttgaagaatttacaaaaaccatactatttcgttataattcgaaaaag
tttaaagagtctctatcaatacaaaaccctgcacagctgtttatcgaacagatcttattc
tcgaataaaccagtcatagattacactagtattcacgataaaatgtttggccttcaagat
ataccaggtattgaggagctagatactattataggtcgtaaaacatttgttgaaagttat
gttcaaatagtagatgatcttagcaatttaaaattggacttagatgatattaaaacagtt
tatgcattctgccttatgaatgatccactattagtaactgcagcaaataatataataatg
tcagtaaaaggacatggtcaagagagaattggtcaatcagcctgcaaaatgccagaagta
agaagcttaaaattaatacattattcgccagcgattgtgttgcgagcatatgtgaggggt
attaacagcatacccaatattgatgttgatgagctttctagggacttatcgcatttagag
gaatttattaaaagtacaaatttaagggagcacatgagggatagaatagataaaaatgaa
aagaagcaactatctagagatctcaaatttgaaataaaggaattaacaagattctatcag
gtttgctatgattatgttaagtctactgagcataaaataaaggtctttattctaccatat
aaagttttcacttcgattgagttttgtggagcattaacgggcaatttaattagtgataaa
gtttggtatataacacattatttgaaaaatatagtctctagtacgcataaagcacagata
tctgcatctccagaattggaggttcaaattgcagatgaggcgcttcgtcttattgcacac
tttgctgataccttcttgtctgctgattccagagtaaattttttgaaaactgtggtagag
caattcaattataaaggcatacctgttaaacatctatatgctaaaattaaaaattcaaaa
ttaagaacaaaatttttaggaatcttgctgtggttggatgatttaactcagagtgattta
gataaatttgatgctgacaaatcagatgaaaagattatctggaataattggcaagtatca
agggatatgaacactggaccaattgatttaataataagtggttattcaagacaactcaga
atcactggtgaagatgacaggcttatagcagccgaactgcaggtgacaagattatcagaa
gatttaatacaccgtcatgggcaagcaatgttgaacaaacctcatggtttaaaattagaa
aaaatgcaaagcatmcaagaaatgtccagacaactatattacatagtttaccaacaaaga
tctcgtaaacgctacttttactcaatattaccaacacaaataatagaggatcataactca
agagtagaatcatctagattaacaaaaaattcaaaatgggtgccagtttgtccggttgct
atatcaaaactttatcaacagggtagacctatactgtctaaagtaaaaaagctaaatatg
cagacttatactttatcccgaatccaagttaatattgaagaatacgcaataacaagaagg
gcacattttcaaaagatgccattctttgaaggtccaccaattccgtctggagggatcgat
ctgtcagaattaatgaaatccacatctttattaagtttgaactatgacaatatacggaat
gcatcgcttttagatatgtctagagtctttaaatgcaatggtagtcaaaatgatcaaatg
gcattcgaattcttatcggatgaggtgttagaacaagatattatagaggaaattgaatgt
aatccaatcttttcaatcagttacacaaagaagggggatccaaatatgacatataaaaat
gcatttcataaagctttaattgctgaatgtgacaaatttgaaacagcttttgacttccta
gatatgggattttgttcgaatgaaaatttaagtatactagaggagatccattggatcata
agttatttgaaaacaaatcaatggtccacagagttagataattgtatacatatgtgtatg
tatagaaatgggtatgatgctgaattccataatttcgatataccatctaaatttcttaaa
gatccaattacacggtcaattaactggccagaagtgattgaattcatactgttaatagaa
gaatttgaaacagcaatagaaccatgggcaagtataaaatcacacttctgttctaaagct
catagcgttgccttagaaagtatgagacacgaaagaaggtctttggcagaatttgtagac
accaacaaaaaaactgggaaatcaaaatttgatttttaa

DBGET integrated database retrieval system