Viruses: 41324399
Help
Entry
41324399 CDS
T40000
Symbol
FLB38_sLgp1
Name
(RefSeq) Orthobunyavirus shuniense; RNA-dependent RNA polymerase
KO
K25345
Peribunyaviridae RNA-directed RNA polymerase L [EC:
2.7.7.48
3.1.-.-]
Virus
3052440
Orthobunyavirus shuniense
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
VOG
VOG cluster
Motif
Pfam:
Bunya_RdRp
L_thumb_ring_vir
L_protein_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
41324399
NCBI-ProteinID:
YP_009667053
RS:
NC_043699
UniProt:
A0A0A0PAA9
LinkDB
All DBs
Position
NC_043699:32..6793
Genome browser
AA seq
2253 aa
AA seq
DB search
MDPYRIDMFRNRILASNDPEDAKDIMSDLLMERHNYFGREVCQYLDIEFRNDTPAQDILL
EFLPPGTVFNVRNCSPDNYVILNGKLYIIDYKVSVDAGYGLSTKTKYEEIFGDALSPFGL
DFEVVIIRADPIREMVHIDSQDFINAFGNIYIDLDFTWFFNLRALLYDKFKDNDRFLEIV
NQGEFTMTSPWIEENTPELYTHPIFKEFYNSLNDEEKNTFNTSLEFDATKSEKWNQNLIA
VIQKYEPFYKKFCNIAASGVFKCTGDYPAPSKDQISKGWEDMYERVKLERDLTDDLSKQK
PSFHFIWSPPDAERPNENISKILTLAKALQKIQGDSTFINGFRSLGLLMDFSSNIGLYES
HVSKLKNTARQTSKKIDQKLEEVEIGSATVLWEQQFKFNTKIMNAQDKSHLFKDFLGIGG
HKSFGKKSIDDLDIEKPKILDFNSKNVQDACNRIYRQVKNVLSNTNSLKKMGCYLEEYGY
NISNASPDIWERVQEVCSTNYWAAILDYSTLMKNMLAASQYNRHNTFRVVTCANNNLYGI
VMPSSDIKTKRSTLCYFVIALHDGKEDVVHSGSIHSTFQSGSKFVSISKGFRLDKERCQR
IVSSPGLFLMTSCLFLSDNKSLNTNDVLNFSFHTSVSITKAMLSLTEPSRYMIMNSLAIS
SHVREYMAEKFSPYTKTAFSVVMTQIIKRACYEAFDQKEKIELKNIHLTDYEITQKGVKP
QRDLKSIWFPGRVNLKEYINQVYMPFYFNSKGLHEKHHVMIDLAKTILEIEKDQRLNIPG
IWSDIPKKQTVNIRVLIYSLAKTLNMDTSRHNYIRSRIENNNNLKRSITTISTFTSSKSC
IKIGDFSEFKNRKEKKIIGNIKKEISKYTVANPEFAEDLDVSCAIHHADYADVRKAIPNY
SDCISTKVFDALYEKIKNGEIDDKPTVSHIFEVMRKHKQFYFSFFNKGQKTAKDREIFVG
EFEAKMCLYLVERISKERCRLNPEEMISEPGDSKLKKLEDLAEAEIRYTAQTLKNLNRKI
QKDMFGSEIDVDMKLHALKIEINADMSKWSAQDVLYKYFWLFALDPVLYKCEKERILYFL
CNYMQKRLILPDDLIANILDQRVQRQDDIIYEMSNGLTQNWVEIKRNWLQGNLNYTSSYL
HTCSMNVYKDVIKRSIDLLEGETLVNSMVHSDDNHTSLVIVQNKLNDNILIEFSIKLFEK
ICLTFGNQANMKKTYLTNFIKEFVSLFNIYGEPFSVYGRFLLTAVGDCAYLGPYEDCASR
LSATQTAIKHGCPPSLAWISIALNQWITHNTYNMLPGQNNDPCNILPCYNRFEVPIELCG
LLNCSLPSIAIAGLEADNLEFLVRTSRKLSPIMYQREPIQSQYDHILDWDLNQLTEIEAI
RFKMLRFMALDSSMSSDDGMGETSDMRSRSLLTPRKFTTQASLSRLTSYNDYQQIIQDQT
KVDELLGYFIQYPQLLVTKGENVEEFCQSIRFRYTSRKFKESLSIQNPAQLFIEQILFAN
KPMIDYTSIHDKLFGIQDDPNISDTTCIIGKKTFPETYNQIKCDLERFTLTNADIKTVYS
YCLMNDPILIACANNIILSMKGMTIDRSAMTCAQMPEIKSLKVIYHSPALVLRAYVTGDM
TIRGAEPDEMRRDIYHLEDFIEKTNIRNKMRERINKNEIRSNGRNIKFEIKELTKYYQIC
YDYIKSTEHKIKIFILPKRPATPSDFCSIVAGNLMLDNKWVTIHHLKQITSQTKKAEIAT
STDLELQLSYECLRLVAHFADSFLADNSRKQFLKRVIEEFSYKGVPVKELYGKIKHSRLR
SKIVPILYYMDDLDQLDLDRYDAEKAEEQITWNNWQTSREFQTGPIDLSIKGYGRSIRII
GNNSRLTAAELQISRIRDDIISRHSQALLNKNHGLKFELMEEYKDLDPRLFYICYQLRAK
KRYHYNILSVSHILDHNRRIQESKIRSTNYWVPVCPVAISKLTYNDKPQLGLIKRLNMDN
TKLTSIQVAVEDYAMVRKCNFAKMQFFDGPELPCGGIDISKMMKSQNILNLQVDTLQSIS
LIELCRIFNCKGTKDDNNAFEFLSDEILDEEVDEELDSSPALKITYTKKSIKNNTYKNTI
VKALIRECDKFEECFDITDEGFTSDSNLEILESLVWILRELHTNQWSTELMQCIHMTLYR
NEMDHLFHRFSIPEQFVDNPISLNYKWSNVIEFLVTLMQIDYKQEPWVSIMAHSLNKAVE
YATERKIQESTKENKLQKFIKGKKMGGRSKFDF
NT seq
6762 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatccttaccgtatcgatatgttccgcaatagaatccttgcatccaacgatcctgaa
gatgcaaaggatattatgtcagatctattgatggaacgccataactactttggcagagaa
gtgtgtcaatacctagacatcgaatttagaaatgatacacctgctcaagatatacttctt
gaattcctgcctccagggactgttttcaatgtgagaaactgcagcccggataattatgtt
atcttaaatggaaaattatatatcatagactataaagtctctgttgatgctggctatgga
ttgtcaacaaagacaaaatatgaggaaatatttggtgatgctttgtctccctttggtctc
gattttgaggttgttataatcagagcagatcctattcgagaaatggtgcatattgacagt
caagacttcataaatgcttttggaaacatctacattgatctagattttacatggttcttc
aatctgcgtgcgttactttatgataaatttaaagataatgaccgatttttagaaattgtc
aaccaaggcgaatttacaatgacttcaccatggatagaagaaaatacaccagagttatat
actcatcctatattcaaagagttttacaactcacttaatgatgaagaaaaaaatacattt
aataccagcttagaatttgacgctactaaatctgagaaatggaatcaaaacctgattgca
gtaatccaaaagtatgagccattttacaagaaattttgcaacattgcagcatcaggagtt
tttaaatgcacaggtgattatccagcacctagtaaggatcaaatatcaaagggatgggaa
gatatgtatgagagagtcaagcttgagagagatttaactgatgacttatctaaacagaag
ccaagtttccacttcatatggtcgcctcctgatgctgagagaccaaatgaaaatatttca
aagatattgacattggcaaaggcgcttcagaagatacaaggtgactccactttcattaat
gggtttagatcattgggtttgttaatggatttctcatctaatatcggcttgtatgaatcg
catgttagcaagcttaaaaatacagcacggcagacttctaaaaaaatagaccaaaagtta
gaagaagtagaaattgggagtgcaactgtcttatgggagcagcaattcaaatttaataca
aaaataatgaatgctcaagacaagtcacatctatttaaagatttccttggaattggtggc
cacaaatcatttgggaaaaaatcaattgatgacttggatatagagaagcctaagatattg
gatttcaattcaaaaaacgtccaagatgcgtgtaatagaatttatcgacaagtcaaaaat
gtcctatctaacactaattccttgaaaaaaatgggctgttatttagaagaatacggatat
aatatatcaaacgcttccccagacatatgggagagagtccaagaagtatgttctacaaat
tattgggctgcaatcttagattattcaactctgatgaaaaatatgttagctgcatcccaa
tataatcgccataatacatttagggttgtcacatgtgcaaacaacaacctctacgggata
gttatgccttcctcagatatcaagacaaaaagatcaactctttgctattttgtaatagct
ctacatgacgggaaagaggacgttgtgcattctggatcaatacattcaactttccaatca
ggatctaagtttgtatcaatctcaaagggttttagactagataaagagcgatgtcaaagg
attgtatcatcaccaggcttattcttaatgacatcttgcttattcttatccgacaacaaa
tcattgaatacaaatgatgtcttaaactttagtttccacacatctgtttcaataacaaag
gcaatgttatcgctaactgagccttctagatatatgattatgaattcacttgcaatctca
agtcatgtgcgtgagtatatggctgaaaagtttagcccatacacaaagactgcattttct
gttgttatgacacagatcattaagcgtgcatgttatgaggcatttgaccagaaagaaaag
atagagctaaaaaatatacatctgacagattatgagataacacaaaaaggtgtgaaacca
cagagagaccttaaatctatatggttcccagggcgtgtaaatttgaaggaatatatcaat
caggtatacatgccattttatttcaactctaaaggtttgcatgaaaaacaccatgttatg
attgacctagctaaaactatattagaaattgagaaagatcaacggttgaacatacctggg
atctggtcagatattccaaagaagcaaacagtcaacattagggttttgatttattcactt
gctaaaacattgaacatggacacatcgagacataattatatacgttctcgtatagaaaac
aacaacaacttaaaacgatccataacaactatatctacattcaccagttcaaaatcatgc
attaagattggagattttagcgaatttaaaaatcgtaaagaaaaaaagataataggtaat
ataaaaaaagaaataagcaagtatacagttgcaaatccagagtttgcagaagatttagat
gtgtcttgtgctatacaccatgccgattatgcagatgtgcgtaaggctataccaaattat
tcagattgcatatcaacaaaggtctttgatgcattatatgaaaagataaaaaatggagaa
attgatgataaaccaacagtatcacatatatttgaagtaatgaggaaacataaacaattt
tacttcagtttctttaacaaaggtcaaaaaacagcaaaagacagagagatttttgttgga
gaatttgaagcaaagatgtgcttatatttagttgaaaggatctccaaagagcgttgccgc
cttaatccagaagagatgatcagtgaaccaggagattctaaattgaaaaaattagaggat
ttggcagaagcagaaattcgatacacagcccaaacactaaagaatttgaaccgtaaaata
caaaaagatatgtttggatcagagattgatgttgatatgaagttgcatgcactgaaaata
gaaataaatgctgatatgtcaaaatggagtgctcaggatgttttatacaagtatttttgg
ctttttgctttagatcctgttttgtacaaatgcgaaaaagagaggatcttgtatttctta
tgtaactatatgcaaaaaagacttatcctaccagacgatttaattgcaaatattctagat
cagagagttcagcgccaagatgacatcatatatgaaatgagtaatggtcttactcaaaat
tgggttgaaatcaagagaaactggctccaagggaatttaaactacactagtagttatcta
cacacatgctcaatgaatgtttataaagatgtaattaaaagatctattgatttgcttgaa
ggagagacacttgtcaactcaatggtgcattcagatgacaaccatacatcattagtcata
gtgcagaataaattaaatgataatattttaattgaattttctataaagttgtttgaaaag
atatgcttaacatttggcaaccaagcaaacatgaagaaaacatatctaacaaattttatt
aaagaatttgtatcgttatttaatatatacggtgaacccttttcagtatatggtcgcttt
ctgctgacagctgtcggtgactgtgcctatctagggccttatgaagattgtgctagtaga
ttgtcagcaacacaaactgcaataaaacatggctgcccgccatcacttgcatggatcagt
atagcattaaaccaatggatcacacacaacacttataacatgcttccaggccaaaacaat
gacccatgtaacatattgccttgctacaatagattcgaggtccctattgaattgtgtggg
ctattaaattgttccttaccgagcattgcaatagcaggtttagaagcagataatctcgaa
tttttagtcaggacatcacgaaagctatctcccataatgtatcaacgagagccaatacaa
tcgcagtatgatcacattttagactgggatttgaaccaattaaccgaaatagaagcaatt
agattcaaaatgctgaggtttatggccttggactcttctatgtcatcagatgacggaatg
ggtgagacaagcgatatgcgatcaagatctttgctcaccccaaggaaattcacaacacaa
gcatcactatcaagattaacatcttacaatgactatcaacaaattatacaggatcagact
aaagttgacgagttgttaggctatttcatacaatatccccaactgttggtcacaaaggga
gaaaatgtagaggaattttgccagtctataagattcagatatactagccggaagtttaaa
gaatcactatcaatacaaaatcctgcacaattatttatagaacagatattatttgcaaac
aagccaatgattgattatactagtattcatgataaattatttggcattcaagatgatcct
aacatatcagatactacatgcattattggaaagaaaaccttcccagaaacctataatcag
attaaatgcgatttagaaagattcacattaacaaatgctgatatcaagacagtttatagt
tattgcttgatgaatgatcctatattgatagcatgtgcaaataatataatattatccatg
aaaggcatgactatagataggtcagctatgacatgtgcacaaatgcctgagattaaaagc
cttaaagtaatttaccatagtccagctttagttttgagggcatatgtaactggtgacatg
accatacgaggagcagagcctgatgaaatgaggagagatatatatcatcttgaggacttt
atagaaaagacaaacatacggaataagatgagagaaagaattaacaagaatgaaataagg
tctaatggaagaaatattaaatttgagatcaaagagctaactaagtattatcaaatatgc
tacgattatattaaatctactgagcataaaataaaaatattcattttgccaaaaagacca
gctaccccttctgacttctgctctatagtagctggtaatctaatgctagacaacaaatgg
gttacaatacaccatctaaaacagataacttcacaaacaaaaaaagcagaaatagcaact
tcaacagatttagagctgcaactgtcgtatgaatgtttgcgcctggtagcacattttgct
gattcttttctggcagataattctagaaaacagttcctaaagagggtaattgaagaattc
tcttataaaggagttcctgtcaaagagttgtatggtaaaataaaacattcaagattaagg
tcaaagatagttcctatactatattatatggacgatttagatcaattagatttggataga
tatgatgctgaaaaagcagaagagcagattacatggaataattggcagacatcaagagaa
tttcagactggaccaatagatttatcaattaaaggctatggacgtagcatccgaatcatt
gggaataattctaggttgactgcagcagaacttcaaataagtaggatacgtgatgacata
atttctagacacagtcaagcattgctaaataagaatcatgggttgaaatttgaacttatg
gaagaatacaaagaccttgatcctaggttgttttatatatgttaccaacttagggctaag
aaaagatatcactacaacatactgtcggtctcacatatactagaccacaatagacgcata
caggagtctaaaataagatctaccaattattgggtgccagtctgcccagtagcaatttct
aagctaacatataatgacaaacctcaattaggattgatcaagaggttaaatatggataat
acaaaattgacatcaatacaggtagcagttgaagactatgcaatggttagaaaatgcaac
tttgctaagatgcaattctttgacggaccagaattaccatgtggtggaatagatatttca
aagatgatgaaatcccagaatattctgaacttacaagtagatactttacaaagtatatcc
cttattgaattgtgtcggatctttaactgtaaaggtactaaggatgataataatgctttt
gaattcttgtctgatgaaattcttgatgaggaagtagatgaagagcttgattcctcccca
gctttgaagataacatacacaaaaaagtcaataaaaaataatacatacaaaaacacaata
gtaaaagcactaatacgtgaatgcgacaaatttgaggaatgctttgacataactgacgaa
ggctttacatcagatagcaatctggaaattttggaatctttagtctggattttgagagag
ttacatactaatcaatggtcgacagaattaatgcaatgcattcatatgacactgtataga
aacgagatggatcatctgttccatagattttccattcctgaacaatttgtagataaccca
atatcattgaattataagtggtcaaatgtgatagaattcttggtgacattaatgcagata
gattataagcaagaaccgtgggtttcaattatggcacattcattaaacaaagctgttgaa
tatgcaactgaaaggaagatacaggaatcaaccaaagagaacaaattgcagaagtttatc
aaagggaagaaaatgggtgggaggtctaagtttgatttctaa
DBGET
integrated database retrieval system
