KEGG   Viruses: 41324420
Entry
41324420          CDS       T40000                                 
Symbol
FLB08_sLgp1
Name
(RefSeq) Fort Sherman virus; polymerase
  KO
K25345  Peribunyaviridae RNA-directed RNA polymerase L [EC:2.7.7.48 3.1.-.-]
Virus
273345  Fort Sherman virus
SSDB
Motif
Pfam: Bunya_RdRp L_thumb_ring_vir L_protein_N
Other DBs
NCBI-GeneID: 41324420
NCBI-ProteinID: YP_009666949
RS: NC_043617
UniProt: A0A220A568
LinkDB
Position
NC_043617:50..6766
AA seq 2238 aa
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NT seq 6717 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
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DBGET integrated database retrieval system